第二章 生产中常用菌种的分离、
选育和保藏
第一节 菌种的分离筛选
第二节 培养分离
第三节 工业微生物育种
第四节 菌种的保藏及活化
带图象分析系统的微生物菌种
显微观察装置
第一节 菌种的分离简介
一、菌种的来源
? 根据资料直接向有科研单位, 高等院校, 工厂
或菌种保藏部门索取或购买;
? 从大自然中分离筛选新的微生物菌种 。
二、分离思路
? 新菌种的分离是要从混杂的各类微生物中依照
生产的要求, 菌种的特性, 采用各种筛选方法,
快速, 准确地把所需要的菌种挑选出来 。
? 实验室或生产用菌种若不慎污染了杂菌, 也必
须重新进行分离纯化 。
? 有了优良的菌种,还要有合适的工艺条件和合
理先进的设备与之配合。
? 定方案,首先要查阅资料, 了解所需菌种的生
长培养特性 。
? 采样,有针对性地采集样品 。
? 增殖,人为地通过控制养分或培养条件, 使所
需菌种增殖培养后, 在数量上占优势 。
? 分离,利用分离技术得到纯种 。
? 发酵性能测定,进行生产性能测定 。 这些特性
包括形态, 培养特征, 营养要求, 生理生化特
性, 发酵周期, 产品品种和产量, 耐受最高温
度, 生长和发酵最适温度, 最适 pH值, 提取工
艺等 。
三、新种分离与筛选的步骤
菌种筛选主要步骤
? 调查研究及查阅充分的资料

设计实验方案
↓确定采集样品的生态环境
采样
↓确定特定的增殖条件
增殖培养
↓确定特殊的选择培养基及可能的
↓定性或半定量快速检出法
平板 分离

? 原种斜面
↓确定发酵培养基础条件
筛选

初筛( 1株 1瓶)

复筛( 1株 3~ 5瓶)
↓结合初步工艺条件摸索
再复筛( 1株 3~ 5瓶)

3~ 5株

单株纯种 分离
↓ 生产性能试验
↓→毒性试验
菌种鉴定
( 一)采样
1、采样对象
以采集土壤为主 。
? 一般园田土和耕作过的沼泽土中, 以细
菌和放线菌为主;富含碳水化合物的土
壤和沼泽地中, 酵母和霉菌较多, 如一
些野果生长区和果园内 。
? 采样的对象也可以是植物, 腐败物品,
某些水域等 。
从自然界筛选
? 2,采样季节:以温度适中, 雨量不多的秋初为好 。
? 3,采土方式:在选好适当地点后, 用小铲子除去
表土, 取离地面 5-15cm处的土约 10g,盛入清洁的
牛皮纸袋或塑料袋中, 扎好, 标记, 记录采样时
间, 地点, 环境条件等, 以备查考 。 为了使土样
中微生物的数量和类型尽少变化, 宜将样品逐步
分批寄回, 以便及时分离 。
(二)增殖培养
? 为了容易分离到所需的菌种, 让无关的微生物
至少是在数量上不要增加, 可以通过配制选择性
培养基, 选择一定的培养条件来控制 。
? 例如碳源利用的控制, 可选定糖, 淀粉, 纤维
素, 或者石油等, 以其中的一种为唯一碳源, 那
么只有利用这一碳源的微生物才能大量正常生长,
而其它微生物就可能死亡或淘汰 。 这样对下阶段
的纯种分离就会顺利得多 。
(三)培养分离
? 尽管通过增殖培养效果显著, 但还是处于微
生物的混杂生长状态 。 因此还必须分离, 纯化 。
在这 — 步, 增殖培养的选择性控制条件还应进
一步应用, 而且控制得细一点, 好一点 。 纯种
分离的方法有划线分离法, 稀释分离法 。
1.稀释平皿分离法1.稀释平皿分离法
100ml
1g
9ml 9ml 9ml 9ml 9ml 9ml
1/100 1/1000 10-810-710-610-510-4
1ml 1ml 1ml 1ml 1ml(1)稀 释
1.稀释平皿分离法
b.涂布平皿分离法
a.倾注平皿分离法
2.平皿划线分离法
a,连续划线分离法 b,分区划线分离法
(四)筛 选
? 这一步是采用与生
产相近的培养基和培
养条件, 通过三角瓶
的容量进行小型发酵
试验, 以求得适合于
工业生产用菌种 。
(五)毒性试验
? 自然界的一些微生物是在一定条件下产毒的,
将其作为生产菌种应当十分当心, 尤其与食品
工业有关的菌种, 更应慎重 。 据有的国家规定,
微生物中除啤酒酵母, 脆壁酵母, 黑曲霉, 米
曲霉和枯草杆菌作为食用无须作毒性试验外,
其他微生物作为食用, 均需通过两年以上的毒
性试验 。
第二节 培养分离
? 从自然界中分离培养微生物是菌种选育的重要
和基础的步骤 。
? 到目前为止, 还没有一种分离培养方法能揭示
一个试样中所包含的所有微生物总数和种类 。
? 在任一试样中所存在的微生物仅为极少数特定种
类的菌株;在工业微生物筛选过程中, 应及时调
整检测方法, 以与各种不同类型的生长和代谢之
微生物相适应 。
? 因此, 建立一更为科学的和针对性不强的分离方
法是必要的 。
一、成功的分离培养方法
(1)认真考它所需产品的特征和生产过程;
(2)制订初步的筛选标准;
(3)将生态学方法运用到分离和筛选过程 。
三、将生态学方法用于培养分离
的一般思路要点
? 1,罗列出所要分离的微生物类群;
? 2,根据所采集样本的各种生态参数, 描述所要
分离的微生物之生态系统或栖息地:
? 3,将若干样本分成若干类型, 如植物和植物各
部, 土壤 (类型和土层 ),岩石, 水, 昆虫和发酵
食品等;
? 4,罗列出所要考察和测量的环境参数, 如 pH、
盐分, 水分, 氧化还原电势及温度等;
5.列出生物系统中有用的自然底物,如森林土
壤中的几丁质、葡萄表皮的果胶;
6.根据上述 1-5项中所获得的数据,设计分离方
法,即选择适宜的稀释液、底物、试样、天然浸
出汁和培养条件;
7.用标准方法作对照来评价生态学分离方法;
8.根据待检材料的生态参数需要,修改已知的
方法;
9.运用特定的富集方法,富集那些可能具有筛
选意义的微生物类群。
四、自然界中细菌的分离
(一 )采样和采集方法
? 为了从一特定生态系统中分离出具有代表性的
细菌菌群, 特别是分离那些在唯一微环境区域
中出现的菌群时, 必须十分重视样本的采集 。
? 样本采集时所需的工具通常有无菌刮铲, 土样
采集器, 镊子, 解剖刀, 手套, 无菌小塑料袋
和塑料瓶等 。
采样的注意事项
1,采样时应尽可能保持相对无菌;
2,所采集的样本必须具有某种代表性;
3,采好的样必须完整地标上样本的种类及采集
日期, 地点以及采集地点的地理, 生态参数
等;
4,应充分考虑采样的季节性和时间因素, 因为
真正的原地菌群的出现可能是短暂的;
? 5、采好的样应及时处理,暂不能处理的也应
贮存于 4℃ 下,但贮存时间不宜过长。这是因
为一旦采样结束,试样中的微生物群体就脱离
了原来的生态环境,其内部生态环境就会发生
变化,微生物群体之间就会出现消长
(二 )生态学参数及培养基
的组成原则
1,加入培养基中的天然提取物种类和用量, 环境
生物物理学参数以及用于平板涂布分离样本的溶
剂都会影响实验中所要分离的细菌的数量和种类 。
2,就分离培养基的组成而言, 部分培养基中必须
含有 10-50%的天然提取物 。 加入培养基中的天然
提取物, 部分培养基中则应含有多种碳, 氮源,
如几丁质, 纤维素或果胶 。
3、所有分离培养基中都应含有抗真菌剂 (如放线菌
酮和制霉素 ),掺加浓度一般为 50μg/ m1,以
抑制真菌的生长。
4、琼脂平板在使用前应置于 37℃ 培养箱中孵育 l、
2天。
5、培养基的生物物理学参数,如 pH及盐分也应调
节到与试样的生态系统参数值相近。
二,分离
? 目的微生物不纯,需 分离 纯化。采用简便迅速,
有一定准确性的检出方法,提高筛选效率。常
用平皿反应法:
? 纸片培养显色法:浸有指示剂滤纸。
? 透明圈 法:混浊底物被分解后形成 透明圈 。如
可溶性淀粉、碳酸钙等。
变色圈法:直接用显色剂或指示剂。
生长圈法:利用某些具有特殊营养要求的微生
物作为工具菌,要 分离 的微生物能在一般培养
条件下生长而合成该营养物而使工具菌能生长,
形成生长圈。
抑制圈法:琼脂块培养法。
用刚果红染色法鉴定筛选
降解纤维素的菌株
羧甲基纤维素钠作培养物
抗生素筛选
检定菌培养,
加上发酵液
五、放线菌的分离培养基的组成原则
? 大多数放线菌的分离培养是在贫脊或复杂底物
的琼脂平板上进行的 。 除嗜温性放线菌外, 其
他放线菌一般在培养 4-20天内在分离平板上缓
慢形成菌落 。
? 在放线菌分离琼脂中通常都加入抗真菌剂 制霉
菌素或放线菌酮, 以抑制真菌的繁殖 。
? 选择性地添加抗生素 。
? 分离琼脂平板制备好后, 一般皆应在 37℃ 培养
箱中存放 3天 。
放线菌的分离
? 土样中放线菌的非选择性分离:土样 风干,磨碎,
无菌海绵压印土样后压印平板后培养。
? 植物体上放线菌的分离:无菌取植物组织,干燥 以
减少细菌数量,剪碎植物材料后植入平板表层后培
养。也可洗下微生物后振荡培养。
? 水中放线菌的分离,为使所要分离的放线菌的数量
种类增多,一般将水样离心或滤纸过滤,取 离心沉
积或滤纸表面沉积 进行系列稀释和涂布。
次代培养及纯化
? 菌落形成后可根据肉眼可见的菌落形态上的差异,
作初步的鉴定和区分 。
? 通过高倍放大进行镜检, 可了解气生和营养孢子
形成情况 。
? 成功地分离出各种不同的放线菌属及种的关键是
所采集样本的本身及其分离用的琼脂培养基;而
肉眼识别不同的生长形态, 从而初步地加以鉴定,
在分离放线菌时显得尤为重要 。
? 将分离平板上所形成的菌落用经火焰灼烧灭菌的
钩形针或无菌牙签挑取, 点接到琼脂平板上进行
影印培养, 以进一步筛选和分离 。
放线菌菌落形态
六,真菌分离
1,利用低碳/氮比的培养基可使真菌生长菌落
分散, 利于计数, 分离和鉴定 。 这里主要是利
用营养成分的减少而使生长减慢, 并由此限制
真菌的迁徙生长 。
2,改变培养温度将有利于不同嗜温区真菌的分
离 。
3,有时, 真菌子实体形成必须有光线, 这在分
离培养时应加以考虑 。
4、选择性富集:是通过一定的方式使样本中一种
或一群微生物数量上的增加而利于分离的一种技
术。
富集可以是种水平的,如通过营养要求的改变
来富集分离镰刀菌;也可以是组成群水平的,如
以纤维素为唯一碳源的选择性培养基可选择性富
集所有能降解纤维素的纤维素裂解微生物。
5、在分离培养基中加入一定的抗生素即可有效地
抑制细菌生长及菌落形成。
真菌的分离方法
? 土中真菌的分离:稀释法, 混入法, 压贴法,
粘附法, 浮选法, 注射器采集法, 土过筛法,
庶糖密度梯度离心法 。
? 植物材料中真菌的分离:植入法, 压贴法, 洗
涤法, 浸泡法 。
? 水中真菌的分离:水样稀释后涂布分离 。 饵诱
技术常用于水中真菌的富集 。
? 子实体直接分离培养担子菌:新采集的子实体
组织植入平板内或在放于液体培养基表面放一
小块无菌滤纸上培养 。
七、生产选种
? 是在长年累月的生产实践中, 在培养工艺条
件没有任何可见变更情况下, 突然发现某些批次
生产水平提高较大, 这就有可能是个别自然变异
朝更好的方向变的细胞, 在这种条件下很适应于
培养条件, 并逐渐显示出它的生长优势, 这种优
势的发展, 促使它优良的生产性能表露 。
第四节 工业菌种的育种方针
? 工业菌种的育种:
是运用遗传学原理和技术对某个用于特定
生物技术目的的菌株进行的多方位的改造 。 通
过改造, 可使现存的优良性状强化, 或去除不
良性质或增加新的性状 。
工业菌种育种的方法
? 诱变
? 基因转移
? 基因重组
育种过程
? 包括下列 3个步骤:
? (1)在不影响菌种活力的前提下, 有益基因型
的引入 。
? (2)希望基因型的选出 。
? (3)改良菌种的评价 (包括实验规模和工业生产
规模 )。
选择育种方法时综合考虑的因素
(1)待改良性状的本质及与发酵工艺的关系 (如批
式或连续发酵试验 );
(2)对这一特定菌种的遗传和生物化学万面认识的
明了程度;
(3)经济费用 。
? 如果对特定菌种的基本性状及其工艺知晓甚少,
则多半采用随机诱变, 筛选及选育等技术:
? 如果对其遗传及生物化学方面的性状已有较深的
认识, 则可选择基因重组等手段进行定向育种 。
工业菌种改良方法
(1)解除或绕过代谢途径中的限速步骤:通过增加
特定基因的拷贝数或增加相应基因的表达能力来
提高限速酶的含量;在代谢裔途径中引伸出新的
代谢步骤, 由此提供一个旁路代谢途径 。
(2)增加前体物的浓度 。
(3)改变代谢途径, 减少无用副产品的生成以及提
高菌种对高浓度的有潜在毒性的底物, 前体或产
品的耐受力 。
(4)抑制或消除产品分解酶 。
(5)改进菌种外泌产品的能力 。
(6)消除代谢产品的反馈抑制 。 如诱导代谢产品
的结构类似物抗性 。
提高特定基因的表达水平
? (1)引入强转录及翻译信号, 可通过在一高效
表达载体上克隆靶基因;在靶基因的上游引
入强启动子;修改现有表达信号, 提高基因
效力等 。
? (2)诱导解除基因表达抑制的突变 。
改进菌种的生长效率
? 提高菌株对底物的利用率方法:
? a,通过确定并改变代谢中的耗能部分 ;
? b,由另一菌株的高效低能代谢途径代谢来实现 。
? c,赋予菌种对多种底物, 特别是价廉而丰富的
底物的利用能力, 由此可降低操作费用 。
第四节 诱变育种
? 以微生物的自然变异作为基础的生产选种的机
率并不很高, 一个基因的自然突变频率仅 10-6-
10-10左右 。
? 诱变育种:以诱发突变为基础的育种, 是迄今
为止国内外提高菌种产量, 性能的主要手段 。
诱变 物理、化学或生物诱变方法
一、诱变剂和诱变处理
? 物理诱变剂:射线如紫外线, X— 射线, γ—
射线, 快中子;
? 物理因素中目前使用得最方便而且十分有效的
是紫外线 。 许多高产菌株的选育都用过紫外线,
对于一般实验室, 中小型工厂都适用, 也很安
全 。
? 其他的几种射线都是电离性质的, 有一定的穿
透力, 一般都由专业人员在专门的设备中使用,
否则有一定危险性 。
? 超净工作台
小型 X射线衍射仪
Co60射线机
化学诱变剂:
化学因子如碱基类似物, 5— 氟尿嘧啶, 烷化剂等 。
化学诱变剂中使用最多, 最有效的是烷化剂 。
使用化学诱变剂的优缺点:
1,大多数情况下, 就突变数量而言, 要比电离辐射
更有效 。
2,化学诱变剂是很经济的, 因为只需要少量的
合适的诱变剂, 设备是实验室的一般玻璃器皿,
一个蒸气罩 。 而用电离辐射 ± 行工作时, 设备
费用大, 并要注意安全性 。
3,大部分诱变剂是致癌剂, 所以在使用中必须
非常谨慎, 要避免化学诱变剂与皮肤接触,,
且切勿吸入其蒸气, 有人对某些诱变剂极其敏
感, 甚至未直接接触就会过敏, 这就更要当心 。
诱变剂的选择
1,碱基类似物和羟胺具有很高的特异性, 但很少使
用, 回复突变率高, 效果不大 。
2,亚硝酸和烷化剂应用的范围较广, 造成的遗传损
伤较多 。 其 中亚硝基胍和甲基磺酸乙酯 常被称为
,超诱变剂,, 甲基磺酸乙酯是毒性最小的诱变
剂之一 。
3,吖啶类诱变剂可以造成生化代谢途径的完全
中断 。
4,紫外线仍十分有效 。 电离辐射是造成染色体
巨大损伤的最好诱变剂, 它能造成不可回复的
缺突变 。 但它可能影响邻近基因的性能 。
二、诱变育种步骤
?出发菌株的选择
?处理菌悬液的制备
?诱变处理
?中间培养
?分离和筛选
(一 )出发菌株的选择
1,自然界新分离的野生型菌株, 对诱变处理较
敏感, 容易达到好的效果 。
2,在生产中经生产选种得到的菌株与野生型较
相像, 也是良好的出发菌株 。
3,每次诱变处理都有一定提高的菌株, 往往多
次诱变能积累较多的提高 。
4,出发菌株开始时可以同时选 2~ 3株, 在处理
比较后, 将更适合的出发菌株留作继续诱变 。
5.要尽量选择单倍体细胞、单核或核少的多细
胞体来作出发诱变细胞,这是由于变异性状大部
分是隐性的,特别是高产基因。
6.根据采用的诱变剂或根据细胞生理状态或诱
变谱选择诱变剂,因为同一诱变剂的重复处理会
使细胞产生抗性,使诱变效果下降。有的诱变剂
是作用于营养细胞,就要选对数期的细胞:有的
作用于休止期,就可选用孢子。
(二 )处理菌悬液的制备
? 这一步骤的关键是制备单细胞和单孢子状态的,
活力类似的菌悬液, 为此要进行合适培养基的
培养, 并要离心, 洗涤, 过滤 。
带 玻璃珠 的 三角瓶 内,加无菌水
(三 )诱变处理
根据前面有关诱变剂及诱变处理的介绍, 结
合诱变对象的实际, 设计诱变处理方案 。
(四 )中间培养
? 由于在发生了突变尚未表现出来之前, 有一个
表现延迟的过程, 即细胞内原有酶量的稀释过
程 (生理延迟 ),需 3代以上的繁殖才能将突变
性状表现出来 。 此过程称为中间培养
? 这个过程对今后的筛选和获得稳定菌株都是极
为重要的 。
方法:
让变异处理后细胞在液体培养基中培养几小
时, 以让细胞的遗传物质复制, 让细胞繁殖几
代, 以得到纯的变异细胞 。
若不经液体培养基的中间培养, 直接在平
皿上分离就会出现变异和不变异细胞同时存在
于一个菌落内的可能, 形成混杂菌落, 以致造
成筛选结果的不稳定和将来的菌株退化 。
(五 )分离和筛选
? 筛选分初筛和复筛 。 初筛以迅速筛出大量
的达到初步要求的分离菌落为目的, 以量
为主 。
? 复筛则是精选, 以质为主, 也就是以精确
度为主 。 因此在具体方法上就有差异,
? 初筛可以在平皿上直接以菌落
的代谢产物与某些染料或基质
的作用形成的变色圈或透明圈
的大小来挑取参加复筛者, 而
将 90%的菌落淘汰 。
? 在数量减少后就要仔细比较参
加复筛和再复筛的菌株, 最后
才能选得优秀菌株 。 在以后的
复筛阶段, 还应不断结合自然
分离, 纯化菌株 。




降解
纤维
素产
生产
透明








紫外线的诱变育种
? 紫外线诱变一般采用 15W紫外线
杀菌灯, 波长为 2537A,灯与处理
物的距离为 15~ 30cm,照射时间
依菌种而异, 一般为几秒至几十
分钟 。 一般我们常以细胞的死亡
率表示, 希望照射的剂量死亡率
控制在 70~ 80%为宜 。
? 被照射的菌悬液细胞数,细菌为 106个 /ml左
右,霉菌孢子和酵母细胞为 106~ 107个 /ml。由
于紫外线穿透力不强,要求照射液不要太深,
约 0.5~ 1.0cm厚,同时要用电磁搅拌器或手工
进行搅拌,使照射均匀。
? 由于紫外线照射后有光复活效应,所以照射时
和照射后的处理应在红灯下进行。
(二 )操作步骤
1,将细菌培养液以 3000r/ min离心 5min,倾去上清
液, 将菌体打散加入无菌 生理盐水 再离心洗涤 。
2,将菌悬液放入一已灭菌的, 装有玻璃珠的三角瓶
内用手摇动, 以 打散菌体 。 将菌液倒入有定性滤纸
的漏斗内过滤, 单细胞滤液装入试管内, 一般处于
浑浊态的细胞液含细胞数可达 108个/ ml左右, 作
为待处理菌悬液 。
3,取 2~ 4m1制备的菌液加到直径 9cm培养皿内,
放入一无菌磁力搅拌子, 然后置磁力搅拌器上,
15W紫外线下 30cm处 。 在正式照射前, 应先开紫
外线 10min,让紫外灯预热, 然后开启皿盖正式
在搅拌下照射 10~ 50s。 操作均应在红灯下进行,
或用黑纸包住, 避免白炽光 。
4.取未照射的制备菌液和照射菌液各 0.5ml进
行 稀释分离,计数活菌细胞数。
5.取照射菌液 2ml于液体培养基中 (300ml三角
瓶内装 30ml培养液 ),120r/ min振荡培养 4~ 6h。
6.取中间培养液稀释分离、培养。
7.挑取菌落进行筛选。
亚硝基胍诱变曲霉菌
? N— 甲基 — N'- 硝基 -N- 亚 硝 基胍 (NGN,
MNNG或 TG)对真核或原核微生物都有强烈的
诱变作用 。 其精确的作用机制尚不很清楚, 据
认为是伴随着重氮甲烷的生成及在酸性条件下
生成亚硝酸, 直接作用于细胞内的 DNA复制系
统, 从而诱发了变异 。 MNNG的诱变作用随 pH
的升高而增强 。
? (二 )操作步骤
1,单孢子悬液制备 取斜面, 加入 6ml 0.1mol/ L
pH6.o的磷酸缓冲液, 用接种环刮下孢子, 振荡
试管, 立即通过带滤纸漏斗过滤, 由此制得单孢
子悬液, 若孢子液浑浊状, 其孢子浓度可达 l06个
/ ml,此为待处理孢子悬液 。
2,MNNG溶液的制备 用分析天平称取 2mg,加
入 2ml 0.1mol/ L pH 6.0磷酸缓冲液, 于暗处振荡
溶解 。
3.诱变处理 吸取 MNNG溶液 lml,加入到 1m1孢
子悬液中,30℃ 振荡 30min,立即稀释 1000倍停
止作用,然后以 10-2,10-4两个稀释度分离培养,
30℃ 3天后计数。
4,死亡率计算 将未处理的孢子液 1ml加入 1ml
磷酸缓冲液中,同上逐级稀释分离,30℃ 下培
养 3天。根据处理前后的活孢子数可计算出死亡
率。
5.挑取菌落进行糖化酶及蛋白酶产量筛选.
第五节 营养缺陷型的选育
? 营养缺陷型是指通过诱变而产生的缺乏合成某
些营养物质如氨基酸, 维生素和碱基等的能力,
必须在其基本培养基中加入相应的营养成分才
能正常生长的变异株 。
? 与营养缺陷型对应的是野生型 。
? 与筛选 营养缺陷型 有关的三类培养基
? ① 基本培养基 ( M, M,, minimal
medium) —— 能满足某一菌种的野生型或原养
型菌株营养要求的最低成分的合成培养基 。
? ② 补充培养基 ( S,M., supplemental
medium) —— 在基本培养基中有针对性地补加
某一种或几种营养成分, 以满足相应的 营养缺
陷型 菌株生长需要 ( 其他 营养缺陷型 仍不能生
长 ) 的培养基 。
? ③ 完全培养基 ( C, M,, complete
medium) —— 可满足该菌各种 营养缺陷型 菌株
营养需要的天然或半合成培养基 。
营养缺陷型的用途
? 营养缺陷型在生产上和科学研究上用途很大 。
目前生产氨基酸, 核苷酸的菌种都是各种类型
的缺陷型 。 要研究代谢途径, 育种技术都必须
有营养缺陷型的菌株为材料 。
筛选营养缺陷型的步骤
? 诱变
? 淘汰野生型
? 检出缺陷型
? 确定生长谱
一、诱变方法
? 物理诱变
? 化学诱变
二、淘汰野生型
? 抗生素法:野生型能在 MM中生长, 而缺陷型
不能, 于是将诱变处理液在 MM中培养短时让
野生型生长, 处于活化阶段, 而缺陷型无法生
长, 仍处于休眠状态 。 由于细菌或酵母对一些
抗生素敏感, 于是就相应加入一定量的抗生素,
结果活化状态的野生型就被杀死, 保存了缺陷
型 。 一般细菌可以采用青霉素, 酵母可采用制
霉菌素 。
? 菌丝过滤法:对于霉菌, 因孢子生长后会长出
菌丝体, 就可用滤纸过滤法将菌丝滤去, 而缺
陷型孢子却因未发芽而不能滤过 。
三、检出缺陷型
? 原理:在固体基本培养基和完全培养基上, 生
长情况完全不同, 缺陷型在 CM上生长良好,
而在 MM上则不生长, 野生型都能生长 。
? 具体方法:影印法、点种法、夹层法
? 1,将一较平皿直径小 1cm的金属圆筒蒙上一层灭
菌的丝绒, 用金属夹夹住, 灭菌 。
? 2,将完全培养基上长出的全部菌落在丝绒上轻
轻一压, 使之成为印模, 标记方位 。
? 3,将基本培养基平皿和完全培养基平皿在标记
的同一方位上先后轻轻一压, 此菌印模即复印于
上 。
(一 )影印法
? 4, 将 CM和 MM在恒温箱中培养 。
? 5,二平皿相同方位进行比较, 即可发现在
MM平皿上长出的菌落少于 GM平板上的 。 MM上未
长而相应于 CM上长出的那几个菌落就可能是缺
陷型 。
? 此法要求平皿上菌落不能太多, 菌落之间应有
一定间隔 。
(二 )点种法
? 也就是任意法 。
? 用接种针或牙签将 CM上长出的菌落在 MM和
CM两副平板上接种, 依次在相应位置点种,
然后一起培养, 观察其生长情况 。
? 此法结果明确, 但工作量大 。
(三 )夹层法
? 先在培养皿上倒一层基本琼脂培养基, 凝固后
涂上一层含菌的 MM,凝固后再倒一薄层 MM
琼脂培养基, 培养 24h,将出现的菌落标记,
然后倒上一层 CM琼脂培养基, 再培养 。 这时
第二批长出的菌落就可能是缺陷型 。
? 此法缺点是, 结果有时不明确, 而且将缺陷型
菌落从夹层中挑出并不很容易 。
四、营养缺陷型生长谱的确定
? 验证确定是缺陷型后, 就需确定其缺陷的因
子, 即生长谱测定 。
生长谱测定的方法
? 将缺陷型菌株培养后, 收集菌体, 制备成细胞悬
液, 与 MM培养基 (融化并凉至 50℃ )混合并倾注平
皿 。 待凝固后, 分别在平皿的 5~ 6个区间放上不
同的营养组合的混合物或吸饱此组合营养物的滤
纸圆片 。 培养后会在某组合区长出, 就可测得所
需营养 。 — 个平皿测一个菌 。
? 以不同组合的营养混合物与融化凉至 50℃ 的 MM
培养基混合铺成平皿, 然后在这些平皿上划线
接种各个缺陷型菌株于各相应位置, 培养后根
据在这些组合长出可推知其营养因子 。 在 5~ 6
个平皿上可测 20株菌以上 。
第六节 基因育种
? 基因重组育种:是运用体外 DNA各种操作或修
改手法获得目的基因, 再借助于病毒, 细菌质
粒或其他载体, 将目的基因转移至新的宿主细
胞并使其在新的宿主细胞系统内进行复制和表
达, 或者通过细胞间的相互作用, 使一个细胞
的优秀性状经其间遗传物质的交换而转移给
另 — 个细胞的方法 。
一个完整的基因克隆过程包括以
下步骤
? 1, 获得待克隆的 DNA片段 ( 基因 ) ;
? 2, 目的基因与载体在体外连接;
? 3, 重组 DNA分子导入宿主细胞;
? 4, 筛选, 鉴定阳性重组子;
? 5, 重组子的扩增与/或表达 。
2.2
基因重组
一、质粒的特点
1,质粒的存在并非微生物生命活动必需 。
2,每个细胞中存在的质粒数称为该质粒的拷贝数 。
不同类型的质粒其拷贝数各异, 同一质粒在不同
条件下, 拷贝数也可能差异很大, 有严紧型和松
弛型两种 。
3,质粒 DNA分子常呈现三种形态;常见的一种是
共价, 闭环状 DNA(CCC DNA);其次是由于 —
条链有缺口而产生的开环 DNA(ocDNA);第三种
是由双环分子两段均断裂而产生的线性 DNA。
质粒载体
二、各类质粒所赋予宿主细胞的
不同表现型
抗生素抗性:抗生素的产生;大肠杆菌素的产
生;肠毒素的产生;复杂有机化合物的降解;限
制性核酸内切酶和修饰酶的产生;杀伤性能。
在自然条件下,许多质粒可经细菌接合或相似
方式在宿主间相互转移。在实验室条件下,质粒
也可经人工手段将其转化入宿主细胞内。
载体-宿主系统
? 载体 (vector)是携带外源 DNA进入宿主细胞进
行扩增和表达的 DNA;
? 一般是通过改造质粒, 噬菌体或病毒等构建的 。
载体应具备以下条件:
? 1、能在适当的宿主细胞中复制;
? 2、具有多种限制酶的单一切点(即所谓多克
隆位点)以便外源 DNA插入;
? 3、具有筛选标志以区别阳性与阴性重组分子;
? 4、载体分子较小,以便体外基因操作,同时
载体 DNA与宿主 DNA便于分离;
? 5、对于表达型载体还应具有与宿主细胞相适
应的启动子、增强子、加尾信号等基因表达元
件。
宿主细胞必须符合以下条件
? 1、对载体的复制和扩增没有严格的限制;
? 2、不存在特异的内切酶体系降解外源 DNA;
? 3、在重组 DNA增殖过程中,不会对它进行修饰;
? 4、重组缺陷型,不会产生体内重组;
? 5、容易导入重组 DNA分子;
? 6、符合重组 DNA操作的安全标准。
目的基因的获取
? 一、通过建立基因文库分离靶基因
? 基因文库包括两类:基因组文库:利用限制性
内切酶。
? cDNA:用 mRNA反转录成单链 DNA,再经 DNA聚合
酶的作用产生双链 DNA。可去除真核生物基因
中不表达的内含子。
? 二、化学合成法制备 DNA片段
? 从蛋白质肽链的氨基酸顺序可以知道它的遗传
密码,再依照密码合成基因。
? 三、聚合酶链反应法扩增基因片段
? 对于已知全部或部分核苷酸序列的基因,可以
通过聚合酶链反应(PCR),以基因组 DNA
或 cDNA模板扩增得到目的基因片段。
PCR技术
? 根据需扩增片段的两端设计引物。
? 使 DNA解链(高温),引物结合于基因的两端
(低温),在合适温度下开始合成(链延长)
反应。
? 特点:需要很少的 DNA模板,且能直接从基因
组中得到目的基因。
DNA扩增
PCR反应
DNA片断的克隆
载体的条件,
a 复制起点
b 适宜的限制酶切点
c 选择标记
? DNA分子的体外连接
DNA片段的体外连接是重组 DNA技术的关键 。
DNA连接是由 DNA连接酶催化完成的 。
一,DNA连接酶
? DNA连接酶催化两条双链 DNA片段相邻的 5’-磷酸
和 3’-羟基间形成磷酸二酯键 。
? 在分子克隆中最有用的的 DNA连接酶是来自T4
噬菌体的 DNA 连接酶 。
? T4 DNA连接酶在分子克隆中主要用于:
? 1, 连接具有同源互补粘性末端的DNA片段;
? 2, 连接双链 DNA分子间的平端;
? 3, 在双链平端的 DNA分子上添加合成的人工接
头或适配子 。
重组 DNA导入宿主菌
? 体外连接的重组 DNA分子必须导入适当的受体
细胞中才能大量的复制, 增殖和表达 。 根据所
采用的载体的性质, 将重组 DNA分子导入受体
可有不同的方法 。
一、转 化
? 指以细菌质粒为载体, 将外源基因导入受体细
胞的过程 。 转化时, 细菌必须经过适当的处理
使之处于感受态-即容易接受外源 DNA的状态,
然后利用短暂热休克使 DNA导入细菌宿主中 。
? 此外还可用电穿孔法转化细菌, 它的优点是操
作简便, 转化效率高, 适用于任何菌株 。
二、转染和感染
? 利用噬菌体 DNA作为载体时可经两种方式导入
受体菌 。 一种是感染, 即在体外将噬菌体 DNA
包装成病毒颗粒, 然后使其感染受体菌 。 另一
种方式是转染, 即在 DNA连接酶作用下使噬菌
体 DNA环化, 再象重组质粒一样地转化进受体
菌 。 但习惯上常把以噬菌体 DNA为载体构建成
的重组子导入细胞的过程统称为转染 。
重组克隆的筛选与鉴定
? 基因克隆的最后一步是从转化细菌菌落中筛选
出含有阳性重组子的菌落, 并鉴定重组子的正
确性 。
? 通过细菌培养以及重组子的扩增, 获得所需的
基因片段的大量拷贝 。 进一步研究该基因的结
构, 功能, 或表达该基因的产物 。
一、抗药性标志的筛选
? 如果克隆载体带有某种抗药性标志基因如 ampr
或 tetrr, 转化后只有含这种抗药基因的转化子
细菌才能在含该抗菌素的平板上幸存并形成菌落,
这样就可将转化菌与非转化菌区别开来 。 如果重
组 DNA时将外源基因插入标志基因内, 该标志基
因失活, 通过有无抗菌素培养基对比培养, 还可
区分单纯载体或重组载体 ( 含外源基因 ) 的转化
菌落 。
二,β -半乳糖苷酶系统筛选
? 很多载体都携带一段细菌的 lacZ基因, 它编
码 β -半乳糖苷酶 N-端的 146个氨基酸, 称为 α
-肽, 它表达 β -半乳糖苷酶的 C-端肽链 。
? 当载体与宿主细胞同时表达两个片段时, 宿主
细胞才有 β -半乳糖苷酶活性, 使特异的底物
X-gal 变为兰色化合物, 这就是所谓的 α -互
补 。
? 而重组子由于基因插入使 α -肽基因失活, 不
能形成 α -互补, 在含 X-gal的平板上, 含阳性
重组子的细菌为无色菌落或噬菌斑 。
? 三, 菌落快速裂解鉴定法
? 从平板上直接挑选菌落裂解后, 直接电泳检测载体
质粒大小, 判断有无插入片段存在, 该法适于插入
片段较大的重组子初筛 。
? 四, 内切酶图谱鉴定
? 经初筛鉴定有重组子的菌落, 小量培养后, 再分离
出重组质粒或重组噬菌体 DNA,用相应的内切酶切
割, 释放出插入片断;对于可能存在双向插入的重
组子, 还要用内切酶消化鉴定插入的方向 。
重组 DNA的鉴定
遗传学方法
第七节 原生质体育种
? 原生质体育种技术主要有原生质体融合, 原生
质体转化技术, 此外尚有原生质体诱变育种等 。
? 原生质休融合育种是基因重组的一种重要方法 。
? 原生质体融合作为一种新的基因重组手段是
1978年第三届国际工业微生物遗传学讨论会上
提出来的 。
一、原生质体融合育种的特点
(一 )杂交频率较高:细胞壁去除后在高渗条件下
形成类似于球形的原生质体 。
(二 )受接合型或致育型的限制较小:二亲株中任
何一株都可能起受体或供体的作用, 因此有利
于不同种属间微生物的杂交 。
(三 )遗传物质传递更为完整:原生质体融合是二
亲株的细胞质和细胞核进行类似的合二为一的
过程 。
(四 )存在着两株以上亲株同时参与融合形成融合
子的可能性 。
( 五有可能采用产量性状较高的菌株作融合亲株 。
(六 )提高菌株产量的潜力较大 。
(七 )有助于建立工业微生物转化体系 。
二、原生质体融合育种步骤
1,标记菌株的筛选和稳定性验证 。
2,原生质体制备 。
3,等量原生质体加聚乙二醇促进融合 。
4,涂布于再生培养基, 再生出菌落 。
5,选择性培养基上划线生长, 分离验证, 挑取
融合子进一步试验, 保藏 。
6,生产性能筛选 。
三、原生质体融合育种的要点
( 一 ) 标记菌种的选择
获得标记菌种的方法是采用常规诱变育种,
筛选出营养缺陷型或/和抗药性菌株 。 这里最
重要的是标记必须稳定 。
采用抗药性菌株除可作标记外, 在实验室
中还可排除杂菌污染的干扰 。 为的是确证融合
的成功, 可以采用多标记菌种 。
(二 )原生质体的制备
原生质体的制备主要是在高渗压溶液中加
入细胞壁分解酶, 将细胞壁分离剥离, 结果剩
下由原生质膜包住的类似球状的细胞, 它保持
原细胞的一切活性 。
在放线菌和细菌中, 制备原生质体主要采用
溶菌酶;酵母和霉菌一般可用蜗牛酶或纤维素
酶等 。
影响原生质体制备的因素
1,菌体的前处理
为了使酶作用的效果好一些, 可将菌作一些
前处理 。 如细菌加入亚抑制剂量的青霉素 。
2,菌体的培养时间
为了使细胞易于原生质体化, 一般选择增殖
期的菌体 。
3, 酶浓度
对于不同种属的微生物, 不仅对酶的种类要
求不同, 就是对酶的浓度也有差异 。 另外, 最
佳酶浓度还随不同的生长期的菌体而变化 。
? 4.酶处理温度
? 5.破壁时的 pH值
? 6.渗透压稳定剂
等渗透压在原生质体制备中,不仅起到保
护原生质体免于膨裂,而且还有助于酶和底物
的结合,渗透压稳定剂多采用甘露醇,山梨醇,
蔗糖等有机物和 KCl和 NaCl等无机物。
第八节 筛选新的代谢产物
一、开发新的代谢产物的途径
? (1)从自然界分离新的微生物菌株,或采用新
的检阅方法筛选新的代谢产物。
? (2)对已知微生物的代谢产物进行化学修饰。
? (3)利用微生物转化改造代谢产物的结构。
(4)通过原生质体融合获得新的代谢产物。
? (5)DNA重组技术。
二、筛选微生物新的代谢产物
的程序
突变型菌株的筛选
? 一、产量性状突变株的筛选
三、筛选微生物代谢产物的目标
? 筛选克服抗生素抗性菌株的活性物质;
? 筛选抗肿瘤, 抗病毒的活性物质;
? 研究有药理活性的酶抑制剂及免疫调节剂;
? 寻找食品工业最好的酵母培养物;
? 筛选降解有害物质的微生物以及治疗上具有低
毒, 长效的化学药物等 。
四、筛选微生物代谢产物的方法
? (一 )直接方法
? 为了尽快确定微生物代谢产物的利用前途, 在
体外试验测得活性后, 可以将培养液的有效成
分直接作用于机体, 观察被测样品的疗效 。
? 这种直接确定代谢产物用途的方法亦称动物体
内治疗试验 。
? (二 )间接方法
? 筛选医用抗生素, 可用细茵, 真菌, 病毒或肿
瘤模型, 寻找抗细菌, 抗真菌, 抗病毒, 抗肿
瘤抗生素, 酶抑制剂, 免疫制剂等有效物质 。
? 在预筛选时, 多用琼脂平扳扩散抑菌法 。 通过
预筛选, 直接测定最初分离物的生物活性, 能
加速筛选过程 。
五、检测系统
? 筛选过程的成功依赖于排除那些已知的或并非
需要的代谢产物的检验方法, 这样才能识别出
人们需要的化合物 。
性能签别
? 性能鉴别是分离和筛选微生物代谢产物中最基
础的工作 。
? 鉴别可分为两方面:
一是对微生物方面进行形态, 培养, 生化功
能答试验观察, 并确定微生物产生菌的类群;
? 二是从化学的早期鉴别来鉴别微
生物的代谢产物 。 化学的早期鉴别
一般对产生菌所产生的代谢产物进
行纸上层析, 薄板层析, 纸上电泳,
抗菌谱, 高压电泳, 紫外分光光度
法, 液相和气相色谱等试验, 井获
得各种图谱, 与已知图谱进行比较
鉴别 。






? 如果认为是有实用前途的代谢产物, 则要进一
步大量培养, 并进行动物试验, 毒性考查, 药
物代谢等实验, 并进行提高发酵水平和改善提
取工艺的工作, 以备投入生产 。
? 如果是新的代谢产物, 一般要进一步确定其化
学结构, 井在此基础上进行合成法的研究或进
行化学改造, 研究结构与生物活性的相互关系,
并对作用机制, 生物合成过程作进一步的研究 。
菌种筛选方法
? 诱变处理后,突变细胞只占存活细胞的百分之
几,而能使生产状况提高的细胞又只是突变细
胞中的少数。
? 为了花费最少的工作量,在最短的时间内取得
最大的筛选成效,就要求采用效率较高的科学
筛选方案和手段。
菌种筛选方案
? 初筛:目的是删去明确不符合要求的大部分菌
株,把生产性状类似的菌株尽量保留下来,使
优良菌种不致于漏网。初筛工作以量为主,测
定的精确性还在其次。初筛的手段应尽可能快
速、简单。
? 复筛的目的是确认符合生产要求的菌株,所以,
复筛步骤以质为主,应精确测定每个菌株的生
产指标。
菌种筛选的手段
? 初筛
? 从菌体形态变异分析
? 平皿快速检测法 具体的有纸片培养显色法、变
色圈法、透明圈法、生长圈法和抑制圈法等
? 摇瓶培养法摇瓶培养法也可用于初筛。 初筛的
摇瓶培养一般是一个菌株只做一次发酵测定,
从大量菌株中选出 10-20%较好的菌株,淘汰
80-90%的菌株;而复筛中摇瓶培养一般是一个
菌株培养 3瓶,选出 3-5个较好的菌株,再做进
一步比较,选出最佳的菌株 。
特殊变异菌的筛选方法
营养缺陷型突变株的筛选
经诱变处理后的菌悬液在筛选前一般应先进
行诱变后培养,以促使变异细胞发生分离,防
止出现表型延迟现象,筛选出不纯的菌株。营
养缺陷型的筛选一般包括浓缩、进一步检出和
鉴别营养缺陷型等步骤。
? 抗性突变菌株的筛选 抗性突变株的筛选相对比
较容易,只要有 10-6频率的突变体存在,就容
易筛选出来。抗性突变株的筛选常用的有一次
性筛选法和阶梯性筛选法两种手段。
一次性筛选法 噬菌体抗性菌株、耐高温菌株
阶梯性筛选法药物抗性突变株。
? 组成酶变异株的筛选
许多水解酶是诱导酶,只有在含有底物或底
物类似物的培养环境中,微生物才会合成这些
酶类,所以,诱导酶的生产不仅需要诱导物,
而且受到诱导物的种类、数量以及分解产物的
影响。
具体的筛选方法有恒化器法、循环培养法和
诱导抑制物法。
? 1) 恒化器法:常被用于微生物的“驯化”。在
培养基中添加不能起诱导作用的低浓度底物,
菌生长速率极慢,而群体中少数组成型变异株
则可合成有关的酶,分解利用该底物,生长速
率较快。
? 为了提高组成酶变异株的优势,即它在群体中
的比例,可以应用恒化器培养技术。随着恒化
器培养中不断加入新鲜基质而逐渐增大组成酶
变异株的优势,这样就能够比较容易地做进一
步的纯化分离。
? 2)循环培养法:利用不含诱导物的培养环境和
含有诱导物的培养环境进行交替循环培养待分
离的菌悬液,从而使组成酶变异株得到富集。
? 当接种到不含诱导物而含有其它可利用碳源的
培养基中时,两种类型菌株同样能较好地生长,
但在此环境中组成型突变株已能合成有关的水
解酶,而诱导型菌株就不能合成。
? 将它们转接入含诱导物的培养基中时,变异
株能迅速利用诱导底物进行生长繁殖,而诱导
型出发菌株需经历一个诱导合成酶的阶段,两
类菌株的生长就不同步,组成酶变异株所占的
比例将逐渐增大。
? 3) 诱导抑制剂法:有些化合物能阻止某些诱导
酶的合成,当在诱导物和诱导抑制剂同时存在
的培养环境中培养待分离菌群时,诱导型菌株
不能产生诱导酶,无法正常生长,只有组成型
变异株能够利用底物进行生长繁殖。