第九部分 Chem3D实例指导
9.1 利用键工具建立模型
9.2 利用 Replacement Text建立模型
9.3 检查结构能量
9.4 ChemDraw和 Chem3D信息转换
9.5 分子轨道 (HOMO及 LUMO)
第九部分 Chem3D实例指导
9.1 利用键工具建立模型
Chem3D起始界面
第九部分 Chem3D实例指导
9.1 利用键工具建立模型
Chem3D起始界面
第九部分 Chem3D实例指导
选择
轨迹球
单键
双键
三键
虚键
文本
橡皮
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显示设置
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显示设置属性
线状模型
棒状模型
球棍模型
圆柱键模型
比例模型
带状模型
第九部分 Chem3D实例指导
选择 【 单键 】 工具,在模型窗口向右按动
圆柱键模型
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线状模型
第九部分 Chem3D实例指导
棒状模型
第九部分 Chem3D实例指导
球棍模型
第九部分 Chem3D实例指导
比例模型
第九部分 Chem3D实例指导
带状模型常用于生物分子
第九部分 Chem3D实例指导
选择 【 轨迹球 】 工具,使分子模型
在模型窗口沿 X,Y轴旋转
X,Y轴旋转指示
第九部分 Chem3D实例指导
选择 【 轨迹球 】 工具并按,Alt”键,
使分子模型在模型窗口沿 Z轴旋转
Z轴旋转指示
第九部分 Chem3D实例指导
模型结构信息
光标位于原子上,
自动显示原子信息
第九部分 Chem3D实例指导
光标位于键上,
自动显示键信息
模型结构信息
第九部分 Chem3D实例指导
模型的进一步信息
第九部分 Chem3D实例指导
模型的键长数据
第九部分 Chem3D实例指导
模型的键长和键角数据
第九部分 Chem3D实例指导
乙烯模型中的双键信息
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键级改动
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显示氢及孤对电子
第九部分 Chem3D实例指导
不显示氢及孤对电子的环己烷
原子名称及序数
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选择工具,双击原子,
按顺序改变原子序号
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利用 【 键 】 工具建立的结构,键
角及键长可能不正常,应 【 整理
结构 】
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环己烷的椅式构象
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9.2 利用 Replacement Text建立模型
使用 【 文本 】 工具输入结构式
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按 【 Enter】 自动转化为模型
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括号表示支链
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第九部分 Chem3D实例指导
整理结构
第九部分 Chem3D实例指导
简单优化
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4-甲基 -2-戊醇模型
第九部分 Chem3D实例指导
建立 1,2-双甲基环戊烷模型
第九部分 Chem3D实例指导
第九部分 Chem3D实例指导
整理结构
第九部分 Chem3D实例指导
建立 Ibuprofen(布洛芬 )模型
H 3 C C H
C H 3
C H 2 C H
C O O H
C H 3
第九部分 Chem3D实例指导
第九部分 Chem3D实例指导
建立十肽菌素模型
第九部分 Chem3D实例指导
第九部分 Chem3D实例指导
建立十二丙氨酸醇分子模型
第九部分 Chem3D实例指导
第九部分 Chem3D实例指导
改变显示方式
第九部分 Chem3D实例指导
设为线状模型
第九部分 Chem3D实例指导
第九部分 Chem3D实例指导
设为带状模型
第九部分 Chem3D实例指导
a-螺旋模型
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使用子结构建立模型
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子结构模型库
第九部分 Chem3D实例指导
选择所需的子结构,然后复制
第九部分 Chem3D实例指导
粘贴复制结果
第九部分 Chem3D实例指导
在子结构上进行编辑
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9.3 检查结构能量
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模型旋转
对位交叉
第九部分 Chem3D实例指导
总能量计算
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空间位阻能,0.977kcal/mol
计算结果
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模型的二面角数据
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数据与模型对应
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显示原子符号及序号
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按动旋转
数据相应改变
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对位重叠
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空间位阻能,3.906kcal/mol
计算结果
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9.4 ChemDraw和 Chem3D信息转换
ChemDraw中
画出的分子结构
复制粘贴到 Chem3D中
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Chem3D中
画出的分子模型 复制粘贴到ChemDraw中
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9.5 分子轨道 (HOMO及 LUMO)
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显示轨道时
必须选择
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选择分子轨道
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选择 HOMO
轨道
HOMO轨道
显示
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乙烯分子的 HOMO轨道
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选择 LUMO
轨道
LUMO轨道
显示
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乙烯分子的 LUMO轨道
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9.1 利用键工具建立模型
9.2 利用 Replacement Text建立模型
9.3 检查结构能量
9.4 ChemDraw和 Chem3D信息转换
9.5 分子轨道 (HOMO及 LUMO)
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9.1 利用键工具建立模型
Chem3D起始界面
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9.1 利用键工具建立模型
Chem3D起始界面
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选择
轨迹球
单键
双键
三键
虚键
文本
橡皮
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显示设置
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显示设置属性
线状模型
棒状模型
球棍模型
圆柱键模型
比例模型
带状模型
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选择 【 单键 】 工具,在模型窗口向右按动
圆柱键模型
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线状模型
第九部分 Chem3D实例指导
棒状模型
第九部分 Chem3D实例指导
球棍模型
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比例模型
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带状模型常用于生物分子
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选择 【 轨迹球 】 工具,使分子模型
在模型窗口沿 X,Y轴旋转
X,Y轴旋转指示
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选择 【 轨迹球 】 工具并按,Alt”键,
使分子模型在模型窗口沿 Z轴旋转
Z轴旋转指示
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模型结构信息
光标位于原子上,
自动显示原子信息
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光标位于键上,
自动显示键信息
模型结构信息
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模型的进一步信息
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模型的键长数据
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模型的键长和键角数据
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乙烯模型中的双键信息
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键级改动
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显示氢及孤对电子
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不显示氢及孤对电子的环己烷
原子名称及序数
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选择工具,双击原子,
按顺序改变原子序号
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利用 【 键 】 工具建立的结构,键
角及键长可能不正常,应 【 整理
结构 】
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环己烷的椅式构象
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9.2 利用 Replacement Text建立模型
使用 【 文本 】 工具输入结构式
第九部分 Chem3D实例指导
按 【 Enter】 自动转化为模型
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括号表示支链
第九部分 Chem3D实例指导
第九部分 Chem3D实例指导
整理结构
第九部分 Chem3D实例指导
简单优化
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4-甲基 -2-戊醇模型
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建立 1,2-双甲基环戊烷模型
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整理结构
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建立 Ibuprofen(布洛芬 )模型
H 3 C C H
C H 3
C H 2 C H
C O O H
C H 3
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建立十肽菌素模型
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建立十二丙氨酸醇分子模型
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改变显示方式
第九部分 Chem3D实例指导
设为线状模型
第九部分 Chem3D实例指导
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设为带状模型
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a-螺旋模型
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使用子结构建立模型
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子结构模型库
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选择所需的子结构,然后复制
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粘贴复制结果
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在子结构上进行编辑
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9.3 检查结构能量
第九部分 Chem3D实例指导
模型旋转
对位交叉
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总能量计算
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空间位阻能,0.977kcal/mol
计算结果
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模型的二面角数据
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数据与模型对应
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显示原子符号及序号
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按动旋转
数据相应改变
第九部分 Chem3D实例指导
对位重叠
第九部分 Chem3D实例指导
空间位阻能,3.906kcal/mol
计算结果
第九部分 Chem3D实例指导
9.4 ChemDraw和 Chem3D信息转换
ChemDraw中
画出的分子结构
复制粘贴到 Chem3D中
第九部分 Chem3D实例指导
Chem3D中
画出的分子模型 复制粘贴到ChemDraw中
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9.5 分子轨道 (HOMO及 LUMO)
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显示轨道时
必须选择
第九部分 Chem3D实例指导
选择分子轨道
第九部分 Chem3D实例指导
选择 HOMO
轨道
HOMO轨道
显示
第九部分 Chem3D实例指导
乙烯分子的 HOMO轨道
第九部分 Chem3D实例指导
选择 LUMO
轨道
LUMO轨道
显示
第九部分 Chem3D实例指导
乙烯分子的 LUMO轨道
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