第五章 微生物的新陈代谢 2
第一节 微生物对有机物的分解
第二节 微生物的能量代谢
第三节 分解代谢和合成代谢的联系
第四节 微生物独特合成代谢途径举例
第五节 微生物的代谢调节与发酵生产
第二节 微生物的能量代谢
? 能量代谢是微生物代谢的核心。
? 能量代谢的的中心任务,是将外界环境中多种形式的初级能源转化
为适用于一切生命活动的通用能源 ATP。 最初能源--通用能源
? 微生物可利用的初级能源为有机物、日光及还原态无机物 3大类。
? 能量代谢的实质就是将这 3大类初级能源逐步转化为 ATP的过程
( ATP的形成与利用)。
一、化能异养微生物的生物氧化和产能 二、自养微生物产 ATP和产还原力
一、化能异养微生物的生物氧化和产能
? 生物氧化( biological oxidation),就是发生在活细胞内
一系列产能性氧化反应的总称。
? 有机物生物氧化和燃烧的比较:
生物氧化的 形式,与氧结合、脱氢、失去电子
生物氧化的 过程, 脱氢、递氢、受氢
生物氧化的 功能,产能、产还原力、产中间代谢物
生物氧化的 类型,呼吸、无氧呼吸、发酵
产还原力:主要指还原型烟酰胺腺嘌呤核苷酸类物质,即
NADPH2或 NADH2,这两种物质在转氢酶作用下可以互换。
化能异养微生物:能源、氢供体、基本碳源都是有机物
大部分细菌和全部真核微生物
(一)底物脱氢( 4条途径)
产生还原力、能量、小分子中间代谢物 (以葡萄糖为例)
1,EMP途径 ( Embden-Meyerhof-Parnas pathway):
? 又称糖酵解途径、己糖二磷酸途径
( 1)概述,大多数生物的主流代谢途径。它以 1分子葡萄糖为
底物,经过 10 步反应而产生 2分子丙酮酸,2分子 NADH+H+
和 2分子 ATP的过程。 2阶段,3种产物和 10 个反应。 EMP途
径的简图和总反应式:
( 2) EMP途径
的反应步骤
( 3) EMP途径的终产物的去向
? NADH+H+ 在有氧条件下可经呼吸链的氧化磷酸化反应
产生 6ATP,而在无氧条件下,可把丙酮酸还原成乳酸或
把丙酮酸的脱羧产物 —— 乙醛还原成乙醇。
( 4) EMP途径的意义
? 五点:参阅 P103
2,HMP途径 ( hexose monophosphate pathway),
? 己糖一磷酸途径、己糖一磷酸支路、戊糖磷酸途径、磷酸
葡萄糖酸途径,WD途经( Warburg-Dickens pathway)
( 1)概述:其特点是葡萄糖不经过 EMP途径和 TCA循环而
得到彻底氧化,并能产生大量 NADP+H+形式的还原力以
及多种重要中间代谢物。 HMP途径的简图和总反应式:
( 2)反应过程:
( 3)产物去向:
p104
( 4) HMP途径的
生物意义:
p104
3,ED途径 ( Entner-Doudoroff pathway):
? 2-酮 -3-脱氧 -6-磷酸葡萄糖 (KDPG)途径
( 1)概述:存在于某些缺乏 EMP途径的微生物中的一种
代替途径,为微生物所特有,特点是葡萄糖只经过 4步
反应 即可快速获得丙酮酸。
( 2)反应步骤:
( 3)产物去向:
*( 4) ED途径的
特点, p106
( 5) ED途径的生
物意义,p106
4,TCA循环 (tricarboxylic acid cycle)
即三羧酸循环,又称 Krebs循环、柠檬酸循环。
( 1)概述,丙酮酸经过一系列循环式反应而彻底氧化、脱羧,形成 CO2、
H2O和 NADH2的过程。各种好氧微生物中普遍存在。
场所:线粒体(真核微生物);细胞质(原核微生物)
( 2)反应步骤:
( 3) TCA循环的特
点,p108
( 4) TCA循环的生
物意义,p108
TCA循环的意义:枢纽地位
? 4条脱氢途径在产能效率方面的比较:
(二 )递氢和受氢
贮藏在生物体内葡萄糖等有机物中的化学潜能,经过
上述 4条途径脱氢后,通过呼吸链(电子传递链)等方式传
递,最终可与氧、无机物、有机物等氢受体相结合而释放出
其中的能量。
生物氧化的 3种类型:呼吸、无氧呼吸和发酵。
1、有氧呼吸( aerobic respiration),好氧呼吸、呼吸
( 1)几个概念:
? 有氧呼吸,底物按常规方式脱氢后,经完整的呼吸链(又称
电子传递链)递氢,最终由分子氧接受氢并产生水和释放能
量( ATP) 的过程。由于呼吸必须在有氧的条件下进行,因
此又称呼吸 。
? 呼吸链,是指位于原核生物细胞膜上或真核生物线粒体上的
由一系列氧化还原势不同的氢传递体(或电子传递体)组成
的一组链状传递顺序,它能把氢和电子从低氧化还原势的化
合物处传递给高氧化还原势的分子氧或其他无机、有机氧化
物,并使它们还原。在氢或电子的传递过程中,通过与氧化
磷酸化反应发生偶链,就可产生 ATP形式的能量。
? 氧化磷酸化,又称 电子传递链磷酸化,是指呼吸链的递氢
(或电子)和受氢过程与磷酸化反应相偶连并产生 ATP的作
用。 递氢、受氢即氧化过程造成了跨膜的质子梯度差即质子
动势,进而质子动势再推动 ATP酶合成 ATP。
( 2)微生物中最重要的呼吸链组分:
① 烟酰胺腺嘌呤二核苷酸( NAD)和烟酰胺腺嘌呤二核苷磷
酸( NADP):
② 黄素腺嘌呤二核苷酸( FAD)和黄素单核苷酸( FMN):
它们是黄素蛋白( FP,flavoprotein)脱氢酶的辅基
③ 铁硫蛋白( Fe-S),是传递电子的氧化还原载体。这类小分
子蛋白的辅基中含有铁硫。 Fe-S蛋白存在于呼吸链中,每次
仅能传递 1个电子。
④ 泛醌(辅酶 Q),是一类小分子非蛋白脂溶性氢载体。其功
能是传递氢,收集呼吸链中各种辅酶或辅基传出的氢还原力
[NAD(P)2],然后将它们传递给细胞色素系统。
⑤ 细胞色素系统,是一类含铁卟啉的血红蛋白,主要存在于
好氧微生物中。细胞色素系统位于呼吸链的末端,功能是传
递电子,不传递氢。它们从泛醌中接受电子,同时将同等数
目的 H+推到线粒体膜外 (真核微生的 )或细胞膜 (原核微生物 )
外环境中。按吸收光谱和氧化还原电位不同将细胞色素分为
多种类型,如 Cyta,Cytb,Cytc,Cyta 3 。
( 3) 在呼吸链中电子或
氢的传递顺序一般为:
? NAD( P) → FAD → Fe -S
→ CoQ → Cyt.b → Cyt.c
→ Cyt.a → Cyt.a 3
? 呼吸链中有三处能提供
合成 ATP所需的足够能
量;
? P/O比的高低表示呼吸
链氧化磷酸化效率的高
低。
( 4) 原核微生物细胞膜上的呼吸链,与真核微生物的区别:
? 氧还载体的取代性强;氧还载体的数量可增可减;有分支
呼吸链存在。
化学渗透学说 p110
2、无氧呼吸( anaerobic respiration):
( 1)无氧呼吸,又称厌氧呼吸,是指一类呼吸链末端的氢
受体为外源无机氧化物(少数为有机氧化物)的生物氧化,
是一类在无氧条件下进行的、产能效率较低的特殊呼吸。
( 2)特点,底物按常规途径脱氢后,经部分呼吸链递氢,
最终由氧化态的无机物或有机物受氢,并完成氧化磷酸化
产能反应。
( 3)无氧呼吸的类型,见下图
无
氧
呼
吸
类
型
3、发酵( fementation)
发酵(狭义):在无氧等外源氢受体的条件下,底
物脱氢后所产生的还原力 [H]未经过呼吸链传递
而直接交给某一内源氧化性中间代谢物的一类低
效产能反应。
ADP TAP
底物 -H 底物
中间代谢 中间代谢物 -H2
工业上(广义):发酵是指任何利用好氧或厌氧微
生物来生产有用代谢物的一类生产方式。
无氧下
发酵类型:
( 1)由 EMP途径中丙酮酸出发的发酵
( 2)通过 HMP途径的发酵 — 异型乳酸发酵
两个概念:
? 异型乳酸发酵:葡萄糖经发酵后除主要产生乳酸外,
还产生乙醇、乙酸和 CO2等多种产物的发酵,称异型
乳酸发酵。
? 同型乳酸发酵:发酵只产生乳酸。经 EMP途径只产 2分
子乳酸。
①异型乳酸发酵的“经典”途径
② 异型乳酸发酵的双歧杆菌途径
( 3)通过 ED途径进行的发酵
( 4)由氨基酸发酵产能 — Stickland反应
发酵中的产能反应:产能效率低。底物水平磷酸
化可形成多种含高能磷酸键的产物。
二、自养微生物 生物氧化和产能
? 自养微生物是以无机物为氢供体、以 CO2为基本碳源的
营养类型。自养微生物和异养微生物在能量代谢方面
的异同?
? 自养微生物按其最初能源的的不同可分两大类:化能
自养型微生物和光能自养型微生物。两者在代谢方面
的相同点和不同点?
(一)化能自养微生物
? 化能自养微生物( chemoautotrophs),还原 CO2所需要
的 ATP和 [H]是通过氧化无机底物而获得,其产能途径
主要也是借助于经过呼吸链的氧化磷酸化反应,因此
化能自养菌一般都是好氧菌。
? 特点,①无机底物的氧化直接与呼吸链发生联系;②
呼吸链的组分多样化,氢或电子可以从任一组分直接
进入呼吸链;③产能效率低于化能异养微生物。
? 举例:硝化细菌
硝化细菌分为两个亚群:
1)能将氨氧化为亚硝酸盐的细菌称亚硝化细菌;
2)能将亚硝酸盐氧化 为硝酸盐的细菌称硝化细菌。
? 硝化细菌都是一些专性好氧的革兰氏阳性细菌,以氧
为最终电子受体,多数为无机营养型。
? 它们的细胞都具有复杂的膜内褶结构,该结构有利于
增加细胞的代谢能力。
? 硝化细菌对自然界氮循环影响极大,在自然界分布广
泛,陆地及水域皆有分布。
(二)光能自养微生物
自然界中,能进行光能营养的生物及其光合作用特点是:
光能营养型生物
产氧:真核生物(藻类及其他绿色植物)
原核生物(蓝细菌)
不产氧:真细菌(光合细菌-厌氧菌)
古细菌(嗜盐菌)
产能类型:
循环光合磷酸化、非循环光合磷酸化、嗜盐菌紫膜的光介
导 ATP合成
1、循环光合磷酸化,厌氧光合细菌中存在的通过光
驱动的电子循环式传递形成 ATP的过程称为循环
光合磷酸化。
? 代表,光合细菌
? 特点,①~④ p122
? 过程,菌绿素分子在光照下被光量子激发并逐出
电子,使菌绿素分子带正电荷。被逐出的电子经
铁氧还蛋白、泛醌,Cytb及 Cytc组成的环状 ETC
自动返回带正电的菌绿素分子,在 Cytb与 Cytc间
形成 ATP 。
2、非循环光合磷酸化,蓝细菌、藻类及各种绿色植
物通过光驱动的电子在 ETC上单向流动形成 ATP、
NADPH2和 O2的过程称为非循环式光合磷酸化。
? 代表:绿色植物、藻类、蓝细菌
? 特点:
? 过程:
3、嗜盐菌紫膜的光介导 ATP合成,嗜盐菌在无叶
绿素和菌绿素参与的条件下吸收光能产生 ATP的过程
称为紫膜光合磷酸化。
? 代表:嗜盐菌
? 特点:
? 过程:
第一节 微生物对有机物的分解
第二节 微生物的能量代谢
第三节 分解代谢和合成代谢的联系
第四节 微生物独特合成代谢途径举例
第五节 微生物的代谢调节与发酵生产
第二节 微生物的能量代谢
? 能量代谢是微生物代谢的核心。
? 能量代谢的的中心任务,是将外界环境中多种形式的初级能源转化
为适用于一切生命活动的通用能源 ATP。 最初能源--通用能源
? 微生物可利用的初级能源为有机物、日光及还原态无机物 3大类。
? 能量代谢的实质就是将这 3大类初级能源逐步转化为 ATP的过程
( ATP的形成与利用)。
一、化能异养微生物的生物氧化和产能 二、自养微生物产 ATP和产还原力
一、化能异养微生物的生物氧化和产能
? 生物氧化( biological oxidation),就是发生在活细胞内
一系列产能性氧化反应的总称。
? 有机物生物氧化和燃烧的比较:
生物氧化的 形式,与氧结合、脱氢、失去电子
生物氧化的 过程, 脱氢、递氢、受氢
生物氧化的 功能,产能、产还原力、产中间代谢物
生物氧化的 类型,呼吸、无氧呼吸、发酵
产还原力:主要指还原型烟酰胺腺嘌呤核苷酸类物质,即
NADPH2或 NADH2,这两种物质在转氢酶作用下可以互换。
化能异养微生物:能源、氢供体、基本碳源都是有机物
大部分细菌和全部真核微生物
(一)底物脱氢( 4条途径)
产生还原力、能量、小分子中间代谢物 (以葡萄糖为例)
1,EMP途径 ( Embden-Meyerhof-Parnas pathway):
? 又称糖酵解途径、己糖二磷酸途径
( 1)概述,大多数生物的主流代谢途径。它以 1分子葡萄糖为
底物,经过 10 步反应而产生 2分子丙酮酸,2分子 NADH+H+
和 2分子 ATP的过程。 2阶段,3种产物和 10 个反应。 EMP途
径的简图和总反应式:
( 2) EMP途径
的反应步骤
( 3) EMP途径的终产物的去向
? NADH+H+ 在有氧条件下可经呼吸链的氧化磷酸化反应
产生 6ATP,而在无氧条件下,可把丙酮酸还原成乳酸或
把丙酮酸的脱羧产物 —— 乙醛还原成乙醇。
( 4) EMP途径的意义
? 五点:参阅 P103
2,HMP途径 ( hexose monophosphate pathway),
? 己糖一磷酸途径、己糖一磷酸支路、戊糖磷酸途径、磷酸
葡萄糖酸途径,WD途经( Warburg-Dickens pathway)
( 1)概述:其特点是葡萄糖不经过 EMP途径和 TCA循环而
得到彻底氧化,并能产生大量 NADP+H+形式的还原力以
及多种重要中间代谢物。 HMP途径的简图和总反应式:
( 2)反应过程:
( 3)产物去向:
p104
( 4) HMP途径的
生物意义:
p104
3,ED途径 ( Entner-Doudoroff pathway):
? 2-酮 -3-脱氧 -6-磷酸葡萄糖 (KDPG)途径
( 1)概述:存在于某些缺乏 EMP途径的微生物中的一种
代替途径,为微生物所特有,特点是葡萄糖只经过 4步
反应 即可快速获得丙酮酸。
( 2)反应步骤:
( 3)产物去向:
*( 4) ED途径的
特点, p106
( 5) ED途径的生
物意义,p106
4,TCA循环 (tricarboxylic acid cycle)
即三羧酸循环,又称 Krebs循环、柠檬酸循环。
( 1)概述,丙酮酸经过一系列循环式反应而彻底氧化、脱羧,形成 CO2、
H2O和 NADH2的过程。各种好氧微生物中普遍存在。
场所:线粒体(真核微生物);细胞质(原核微生物)
( 2)反应步骤:
( 3) TCA循环的特
点,p108
( 4) TCA循环的生
物意义,p108
TCA循环的意义:枢纽地位
? 4条脱氢途径在产能效率方面的比较:
(二 )递氢和受氢
贮藏在生物体内葡萄糖等有机物中的化学潜能,经过
上述 4条途径脱氢后,通过呼吸链(电子传递链)等方式传
递,最终可与氧、无机物、有机物等氢受体相结合而释放出
其中的能量。
生物氧化的 3种类型:呼吸、无氧呼吸和发酵。
1、有氧呼吸( aerobic respiration),好氧呼吸、呼吸
( 1)几个概念:
? 有氧呼吸,底物按常规方式脱氢后,经完整的呼吸链(又称
电子传递链)递氢,最终由分子氧接受氢并产生水和释放能
量( ATP) 的过程。由于呼吸必须在有氧的条件下进行,因
此又称呼吸 。
? 呼吸链,是指位于原核生物细胞膜上或真核生物线粒体上的
由一系列氧化还原势不同的氢传递体(或电子传递体)组成
的一组链状传递顺序,它能把氢和电子从低氧化还原势的化
合物处传递给高氧化还原势的分子氧或其他无机、有机氧化
物,并使它们还原。在氢或电子的传递过程中,通过与氧化
磷酸化反应发生偶链,就可产生 ATP形式的能量。
? 氧化磷酸化,又称 电子传递链磷酸化,是指呼吸链的递氢
(或电子)和受氢过程与磷酸化反应相偶连并产生 ATP的作
用。 递氢、受氢即氧化过程造成了跨膜的质子梯度差即质子
动势,进而质子动势再推动 ATP酶合成 ATP。
( 2)微生物中最重要的呼吸链组分:
① 烟酰胺腺嘌呤二核苷酸( NAD)和烟酰胺腺嘌呤二核苷磷
酸( NADP):
② 黄素腺嘌呤二核苷酸( FAD)和黄素单核苷酸( FMN):
它们是黄素蛋白( FP,flavoprotein)脱氢酶的辅基
③ 铁硫蛋白( Fe-S),是传递电子的氧化还原载体。这类小分
子蛋白的辅基中含有铁硫。 Fe-S蛋白存在于呼吸链中,每次
仅能传递 1个电子。
④ 泛醌(辅酶 Q),是一类小分子非蛋白脂溶性氢载体。其功
能是传递氢,收集呼吸链中各种辅酶或辅基传出的氢还原力
[NAD(P)2],然后将它们传递给细胞色素系统。
⑤ 细胞色素系统,是一类含铁卟啉的血红蛋白,主要存在于
好氧微生物中。细胞色素系统位于呼吸链的末端,功能是传
递电子,不传递氢。它们从泛醌中接受电子,同时将同等数
目的 H+推到线粒体膜外 (真核微生的 )或细胞膜 (原核微生物 )
外环境中。按吸收光谱和氧化还原电位不同将细胞色素分为
多种类型,如 Cyta,Cytb,Cytc,Cyta 3 。
( 3) 在呼吸链中电子或
氢的传递顺序一般为:
? NAD( P) → FAD → Fe -S
→ CoQ → Cyt.b → Cyt.c
→ Cyt.a → Cyt.a 3
? 呼吸链中有三处能提供
合成 ATP所需的足够能
量;
? P/O比的高低表示呼吸
链氧化磷酸化效率的高
低。
( 4) 原核微生物细胞膜上的呼吸链,与真核微生物的区别:
? 氧还载体的取代性强;氧还载体的数量可增可减;有分支
呼吸链存在。
化学渗透学说 p110
2、无氧呼吸( anaerobic respiration):
( 1)无氧呼吸,又称厌氧呼吸,是指一类呼吸链末端的氢
受体为外源无机氧化物(少数为有机氧化物)的生物氧化,
是一类在无氧条件下进行的、产能效率较低的特殊呼吸。
( 2)特点,底物按常规途径脱氢后,经部分呼吸链递氢,
最终由氧化态的无机物或有机物受氢,并完成氧化磷酸化
产能反应。
( 3)无氧呼吸的类型,见下图
无
氧
呼
吸
类
型
3、发酵( fementation)
发酵(狭义):在无氧等外源氢受体的条件下,底
物脱氢后所产生的还原力 [H]未经过呼吸链传递
而直接交给某一内源氧化性中间代谢物的一类低
效产能反应。
ADP TAP
底物 -H 底物
中间代谢 中间代谢物 -H2
工业上(广义):发酵是指任何利用好氧或厌氧微
生物来生产有用代谢物的一类生产方式。
无氧下
发酵类型:
( 1)由 EMP途径中丙酮酸出发的发酵
( 2)通过 HMP途径的发酵 — 异型乳酸发酵
两个概念:
? 异型乳酸发酵:葡萄糖经发酵后除主要产生乳酸外,
还产生乙醇、乙酸和 CO2等多种产物的发酵,称异型
乳酸发酵。
? 同型乳酸发酵:发酵只产生乳酸。经 EMP途径只产 2分
子乳酸。
①异型乳酸发酵的“经典”途径
② 异型乳酸发酵的双歧杆菌途径
( 3)通过 ED途径进行的发酵
( 4)由氨基酸发酵产能 — Stickland反应
发酵中的产能反应:产能效率低。底物水平磷酸
化可形成多种含高能磷酸键的产物。
二、自养微生物 生物氧化和产能
? 自养微生物是以无机物为氢供体、以 CO2为基本碳源的
营养类型。自养微生物和异养微生物在能量代谢方面
的异同?
? 自养微生物按其最初能源的的不同可分两大类:化能
自养型微生物和光能自养型微生物。两者在代谢方面
的相同点和不同点?
(一)化能自养微生物
? 化能自养微生物( chemoautotrophs),还原 CO2所需要
的 ATP和 [H]是通过氧化无机底物而获得,其产能途径
主要也是借助于经过呼吸链的氧化磷酸化反应,因此
化能自养菌一般都是好氧菌。
? 特点,①无机底物的氧化直接与呼吸链发生联系;②
呼吸链的组分多样化,氢或电子可以从任一组分直接
进入呼吸链;③产能效率低于化能异养微生物。
? 举例:硝化细菌
硝化细菌分为两个亚群:
1)能将氨氧化为亚硝酸盐的细菌称亚硝化细菌;
2)能将亚硝酸盐氧化 为硝酸盐的细菌称硝化细菌。
? 硝化细菌都是一些专性好氧的革兰氏阳性细菌,以氧
为最终电子受体,多数为无机营养型。
? 它们的细胞都具有复杂的膜内褶结构,该结构有利于
增加细胞的代谢能力。
? 硝化细菌对自然界氮循环影响极大,在自然界分布广
泛,陆地及水域皆有分布。
(二)光能自养微生物
自然界中,能进行光能营养的生物及其光合作用特点是:
光能营养型生物
产氧:真核生物(藻类及其他绿色植物)
原核生物(蓝细菌)
不产氧:真细菌(光合细菌-厌氧菌)
古细菌(嗜盐菌)
产能类型:
循环光合磷酸化、非循环光合磷酸化、嗜盐菌紫膜的光介
导 ATP合成
1、循环光合磷酸化,厌氧光合细菌中存在的通过光
驱动的电子循环式传递形成 ATP的过程称为循环
光合磷酸化。
? 代表,光合细菌
? 特点,①~④ p122
? 过程,菌绿素分子在光照下被光量子激发并逐出
电子,使菌绿素分子带正电荷。被逐出的电子经
铁氧还蛋白、泛醌,Cytb及 Cytc组成的环状 ETC
自动返回带正电的菌绿素分子,在 Cytb与 Cytc间
形成 ATP 。
2、非循环光合磷酸化,蓝细菌、藻类及各种绿色植
物通过光驱动的电子在 ETC上单向流动形成 ATP、
NADPH2和 O2的过程称为非循环式光合磷酸化。
? 代表:绿色植物、藻类、蓝细菌
? 特点:
? 过程:
3、嗜盐菌紫膜的光介导 ATP合成,嗜盐菌在无叶
绿素和菌绿素参与的条件下吸收光能产生 ATP的过程
称为紫膜光合磷酸化。
? 代表:嗜盐菌
? 特点:
? 过程: