3t/ ?<?? [? 3t/ ?<?? [? yy? ?ê ?yvD fòZ ?ê ?yvD fòZ yy? 5 2 3 4 1 6 7 8 9 ×F DNA/ ?Dyy?¥'à Q ×F / ?Dyy?¥'à Q ×F DNA/ ?Dyy?¥'e ? ×F / ?Dyy?¥'e ? ×F DNA/ ? ?3¥'Hq ×F / ? ?3¥'Hq ×F DNA/ ?¥?TV? ×F / ?¥?TV? "¥y¥ X HDyó o¥y "¥y¥ X HDyó o¥y ?÷yv?? )?¥Vr ?÷yv?? )?¥Vr ?÷y?  )?¥Vr ?÷y?  )?¥Vr ?÷y ??t%?¥Vr ?÷y ??t%?¥Vr ?÷yVrát¥s ?B? ?÷yVrát¥s ?B? 3 ×F DNA/ ? ?3¥'Hq ×F / ? ?3¥'Hq C ¨?yM¥ s8 )% ¨?yM¥ s8 )% B ¨?y X H¥8 ¨?y X H¥8 A ¨?? ??T¥y  ? ¨?? ??T¥y  ? A ¨?? ??T¥y  ? ¨?? ??T¥y  ? 3 ×F DNA/ ? ?3¥'Hq ×F / ? ?3¥'Hq K??? ? = M ? K??? ? = M ? DNA ?¤ ? ?¤ ? DNA ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?? e ? ? ?? e ? K??? ? = M ? K??? ? = M ? K??? ? = M ?¥?C#  3t? ? K??? ? = M ?¥?C#  3t? ? MY ? y DNAs0?¥+?? i Mé DNA ? y MY ? y s0?¥+?? i Mé ? y ?1i?e?% )?úù% )K?? ? DNA¥ ? S ?1i?e?% )?úù% )K?? ? ¥ ? S % )¥K?D? eT¨ % )¥K?D? eT¨ hsd RI ?K??? ? = M ?  I ?K??? ? = M ? hsd MI ?K??J? ?  I ?K??J? ? hsd SI ?K?? ??J? ?¥x]Vr  I ?K?? ??J? ?¥x]Vr 1968 M Smith? | n5V @? _ó? ) dé?s ? M ? | n5V @? _ó? ) é?s ? Hind II? Hind III ? K??? ? = M ? K??? ? = M ? K??? ? = M ?¥ ?? K??? ? = M ?¥ ?? ?1+? I ? II ? III ? ?1+? ? ? ? K?? e K?? e ? ? ? ? ?? ? ?? ? ?? ? ?? ? ?a2 ?a2 s÷ ? 8 s÷ ? 8 ]÷= 8 ]÷= 8 s÷= 8 s÷= 8 £ùy0 £ùy0 ATP Mg 2+ SAM ATP Mg 2+ SAMMg 2+ MY?  MY?  TGAN 8 TGCT è??  è??  GAGCC AACN 6 GTGC CAGCAG Méê? Méê?  MY?  1kb)  MY?  ) MY?  =?í MY?  =?í  MY? /3  MY? /3 ?? Mé ?? Mé +s? Mé +s? Mé 24-26bp) ) K??? ? = M ? K??? ? = M ? K??? ? = M ?¥  K??? ? = M ?¥  ? ? é ? ? é H i n d III H i n d III Haemophilus influenzae d _ó @?? ) dé Haemophilus influenzae _ó @?? ) é ]B )é? ?c¥??]¥K??? ? = M ? ]B )é? ?c¥??]¥K??? ? = M ? K??? ? = M ? K??? ? = M ? II ?K??? ? = M ?¥'+? ?K??? ? = M ?¥'+? MY ? y DNAs0? 4 - 8a¥+??  MY ? y s0? v?s ?¥ Méê? MY?  =? § v?s ?¥ Méê? MY?  =? § MY Mé? ???¥è??íó2 MY Mé? ???¥è?? íó2 5‘ … G C T G A A T T C G A G … 3’ C T G A A T T C G A G … 3‘ … C G A C T T A A G C T C … 5’ G A C T T A A G C T C … EcoR I¥ MY?  ¥ MY?  EcoR I¥ Méê? ¥ Méê? EcoRI?á 3¥ 5‘T?  ?á 3¥ T?  5‘ … G-C-T-G-A-A-T-T-C-G-A-G … 3’ -C-T-G-A-A-T-T-C-G-A-G … 3‘ … C-G-A-C-T-T-A-A-G-C-T-C … 5’ -G-A-C-T-T-A-A-G-C-T-C … EcoRI 37 ¥ 5‘ … G-C-T-G-OH P-A-A-T-T-C-G-A-G … 3’ -C-T-G- -A-A-T-T-C-G-A-G … 3‘ … C-G-A-C-T-T-A-A-POH-G-C-T-C … 5’ -G-A-C-T-T-A-A- -G-C-T-C … | 4-7 ¥ | 5‘ … G-C-T-G A-A-T-T-C-G-A-G … 3’ -C-T-GA-A-T-T-C-G-A-G … 3‘ … C-G-A-C-T-T-A-A G-C-T-C … 5’ -G-A-C-T-T-A-AG-C-T-C … OH P OHP PstI?á 3¥ 3‘T?  ?á 3¥ T?  5‘ … G-C-T-C-T-G-C-A-G-G-A-G … 3’ -C-T-C-T-G-C-A-G-G-A-G … 3‘ … C-G-A-G-A-C-G-T-C-C-T-C … 5’ -G-A-G-A-C-G-T-C-C-T-C … PstI 37 ¥ 5‘ … G-C-T-C-T-G-C-A-OH P-G-G-A-G … 3’ -C-T-C-T-G-C-A- -G-G-A-G … 3‘ … C-G-A-G-POH-A-C-G-T-C-C-T-C … 5’ -G-A-G- -A-C-G-T-C-C-T-C … | 4-7 ¥ | 5‘ … G-C-T-C-T-G-C-A G-G-A-G … 3’ -C-T-C-T-G-C-AG-G-A-G … 3‘ … C-G-A-G A-C-G-T-C-C-T-C … 5’ -G-A-GA-C-G-T-C-C-T-C … OH P OHP PvuII?á 3¥ üh  ?á 3¥ üh  5‘ … G-C-T-C-A-G-C-T-G-G-A-G … 3’ -C-T-C-A-G-C-T-G-G-A-G … 3‘ … C-G-A-G-T-C-G-A-C-C-T-C … 5’ -G-A-G-T-C-G-A-C- -T-C … PvuII 37 ¥ 5‘ … G-C-T-C-A-G-OH P-C-T-G-G-A-G … 3’ -C-T-C-A-G- -C-T-G-G-A-G … 3‘ … C-G-A-G-T-C-POH-G-A-C-C-T-C … 5’ -G-A-G-T-C- -G-A-C-C-T-C … K??? ? = M ? K??? ? = M ? II ?K??? ? = M ? ?3Q?¥?T ?K??? ? = M ? ?3Q?¥?T v?s II ?? ? = M ?31M ?¥Q?Hq v?s ?? ? = M ?31M ?¥Q?Hq Tris-HCl 50 mM pH 7.5 MgCl 2 10 mM NaCl 0 - 150 mM DTT 1 mM 0 - 50 mM ?÷ ? ?÷ ? 100 mM ?÷ ? ?÷ ? 150 mM ú÷ ? ú÷ ? Volume 20 - 100 μl l T T 37 ¥ 1 - 1.5 hr 1 U ? ? = M ?¥ ??KDQ?Hq/Q? 1 l H? ? ? ? = M ?¥ ??KDQ?Hq/Q? l H? ? £3 1 μg S DNA ?3¥ ?  £3 S ?3¥ ?  K??? ? = M ? K??? ? = M ? II ?K??? ? = M ? ?3Q?¥?T ?K??? ? = M ? ?3Q?¥?T II ?? ? = M ?¥ ? ó? ?3 ?? ? = M ?¥ ? ó? ?3 ÷ i1 pM]¥ ?e5  V[] H ? M???i ÷ i1 pM]¥ ?e5  V[] H ? M???i 5‘ …GCTACATGGATCCCGGGTTCGCAT…3’ …GCTACATGGATCCCGGGTTCGCAT…3’ 3‘ …CGATGTACCTAGGGCCCAAGCGTA…5’ …CGATGTACCTAGGGCCCAAGCGTA…5’ BamHI SmaI 5‘ …GCTACATG GATCCCGGGTTCGCAT…3’ …GCTACATG GATCCCGGGTTCGCAT…3’ 3‘ …CGATGTACCTAG GGCCCAAGCGTA…5’ …CGATGTACCTAG GGCCCAAGCGTA…5’ 5‘ …GCTACATGGATCCC GGGTTCGCAT…3’ …GCTACATGGATCCC GGGTTCGCAT…3’ 3‘ …CGATGTACCTAGGG CCCAAGCGTA…5’ …CGATGTACCTAGGG CCCAAGCGTA…5’ K??? ? = M ? K??? ? = M ? II ?K??? ? = M ? ?3Q?¥?T ?K??? ? = M ? ?3Q?¥?T II ?? ? = M ?¥ ? ó? ?3 ?? ? = M ?¥ ? ó? ?3 ÷ i1 p?]¥ ? V? |/ ZE ÷ i1 p?]¥ ? V? |/ ZE P¨?L¥ ?¥÷ iFvLR ?¥¨ ] H ?3 P¨?L¥ ?¥÷ iFvLR ?¥¨ ] H ?3 ?÷ ?5 M ?a?F÷ú÷ ? M ?÷ ?5 M ?a?F÷ú÷ ? M B? ?5 M ?a÷D? A 6B? ? M B? ?5 M ?a÷D? A 6B? ? M 0.18¥ 5 M NaAc pH 5.4 8¥ 2.58¥b ?Y? 8¥b ?Y? b? 5 sòaú ? ?ò ?? 10sòa?2 sòaú ? ?ò ?? sòa?2 K??? ? = M ? K??? ? = M ? ?YK??? ? = M ??¥y í ?YK??? ? = M ??¥y í DNA" ?¥B " ?¥B ?aéa&pa o_aY?a EDTAaSDSaNaCl? ?aéa&pa o_aY?a ? Fv ?¥¨  1 μg DNA ¨ 10U ? Fv ?¥¨  ¨ FvQ?98 FvQ?98 üéQ? HW üéQ? HW K??? ? = M ? K??? ? = M ? ?YK??? ? = M ??¥y í ?YK??? ? = M ??¥y í DNA" ?¥J?? " ?¥J?? v?? )?¥ damJ? ? 5‘GATC3’? ?¥Fw N 6 ê v?? )?¥ J? ? ? ?¥Fw ? ?J s ?Y¥ ?μ Bcl IaMboI?? BamH Ia ? ?J s ?Y¥ ?μ ?? Bgl IIaSau3A I? s?Y ? s?Y v?? )?¥ dcmJ? ? 5‘CCAGG3’ 5‘CCTGG3’?  v?? )?¥ J? ?  ?  ?¥}J C 5 ê ? ?J s ?Y¥ ?μ EcoR II? ?¥}J ê ? ?J s ?Y¥ ?μ ?  ??t?¥J? ? 5‘CG3’? ?¥ C 5 ê ? ?J  ??t?¥J? ? ? ?¥ ê ? ?J K??? ? = M ? K??? ? = M ? ?YK??? ? = M ??¥y í ?YK??? ? = M ??¥y í ? ? = M ?¥? A?é ? ? = M ?¥? A?é ú i¥ ?aú i¥?2a? ?0 <a pH′? ú i¥ ?aú i¥?2a? ?0 <a ′ ? ? PBt? ? = M ?¥ MY? Mé? ? 3?+s?' ? PBt? ? = M ?¥ MY? Mé? ? 3?+s?' ?ì¥ Star activityC` C` EcoR I?èHq/ MYi Mé 5‘GAATTC3’? ?? ?èHq/ MYi Mé ? ?? 2 i?V 5% v/v H9 V Mé 5‘PuPuATPyPy3’? 2 i?V   H9 V Mé ? 5‘AATT3’ DNA ?¤ ? ?¤ ? DNA ?¤ ?¥'?é ?¤ ?¥'?é ?ˉ ? y DNA  ? g)¥ ?=o ?ˉ ? y  ? g)¥ ?=o DNA ?¤ ? ?¤ ? 5‘ … G-C-T-C-T-G-C-A G-G-A-G … 3’ -C-T-C-T-G-C-AG-G-A-G … 3‘ … C-G-A-G A-C-G-T-C-C-T-C … 5’ -G-A-GA-C-G-T-C-C-T-C … OH P OHP 5‘ … G-C-T-C-T-G-C-A-G-G-A-G … 3’ -C-T-C-T-G-C-A-G-G-A-G … 3‘ … C-G-A-G-A-C-G-T-C-C-T-C … 5’ -G-A-G-A-C-G-T-C-C-T-C … nick nick DNA ?¤ ? ?¤ ? DNA ?¤ ?¥'?é ?¤ ?¥'?é ?ˉD RNA y2?¥ DNA y  ? g)¥ ?=o ?ˉD y2?¥ y  ? g)¥ ?=o T4-DNA ?¤ ? ?¤ ? 5‘ … G-C-U-C-U-G-C-C-G-G-A-G … 3’ -C-U-C-U-G-C-C-G-G-A-G …3 3‘ … C-G-A-G A-C-G-G-C-C-T-C … 5’ -G-A-GA-C-G-G-C-C-T-C … OHP nick 5‘ … G-C-U-C-U-G-C-C-G-G-A-G … 3’ -C-U-C-U-G-C-C-G-G-A-G …3 3‘ … C-G-A-G-A-C-G-G-C-C-T-C … 5’ -G-A-G-A-C-G-G-C-C-T-C … DNA ?¤ ? ?¤ ? DNA ?¤ ?¥'?é ?¤ ?¥'?é ?¤? üh ? y DNAs0 ?¤? üh ? y s0 5‘ … G-C-T-C-A-G-C-T-G-G-A-G … 3’ -C-T-C-A-G-C-T-G-G-A-G…3’ 3‘ … C-G-A-G-T-C-G-A-C-C-T-C … 5’ -G-A-G-T-C-G-A-C- -T-C…5’ 5‘ … G-C-T-C-A-G-OH P-C-T-G-G-A-G … 3’ -C-T-C-A-G- -C-T-G-G-A-G…3’ 3‘ … C-G-A-G-T-C-POH-G-A-C-C-T-C … 5’ -G-A-G-T-C- -G-A-C-C-T-C…5’ T4-DNA ?¤ ? ?¤ ? DNA ?¤ ? ?¤ ? DNA ?¤ ?¥Q?Hq ?¤ ?¥Q?Hq Tris-HCl 50 - 100 mM pH 7.5 MgCl 2 10 mM ATP 0.5 - 1 mM DTT 5 mM Volume 10 - 20 μl l T T 4 - 15 ¥ 4 - 16 hr 1 U DNA ?¤ ?¥ ??KDQ?Hq/ 15 ¥Q? 1 l H ?¤ ?¥ ??KDQ?Hq/ Q? l H ? ? ?¤ 1 μg λ-DNA Hind III ?  ?3¥ ?  ? ? ?¤  ?  ?3¥ ?  DNA ?¤ ? ?¤ ? üh ? y DNA ? ¥ ?¤?T üh ? y ? ¥ ?¤?T Vs0? ?D¥???K?? ? ? = M ?7/¥T?  ¥ ?¤ ??s0 =?¥ ?¤7 üh  ¥ ?¤5 ??s0W¥ ? ¤yNa?Q? ?1 ¤¤ 4ú üh  ?¤r q¥ZE ? Vs0? ?D¥???K?? ? ? = M ?7/¥T?  ¥ ?¤ ??s0 =?¥ ?¤7 üh  ¥ ?¤5 ??s0W¥ ? ¤yNa?Q? ?1 ¤¤ 4ú üh  ?¤r q¥ZE ? Fv ?¤ ?¨  10v?T?  ¥ ?¤ Fv ?¤ ?¨  v?T?  ¥ ?¤ Fv üh  ?t¥ i9Fs0W ·? Fv üh  ?t¥ i9Fs0W ·? F ? 10% PEG8000\évs0-W¥μrT¨ F ? \évs0-W¥μrT¨ F ??N ?0 NaClK? i 150-200 mM F ??N ?0 K? i DNA ? ? ? ? v?? ) DNA ? ? I DNA pol I  v?? ) ? ?  ‘1‘¥DNA ? ?? ? ?? ‘1‘¥? ?? M ?? ¥? ?? M ?? ‘1‘¥? ?? M ?? ¥? ?? M ?? v?? ) DNA ? ? I¥'?é v?? ) ? ? ¥'?é 3‘ … G-C-T-C-A-G-C-T-G-G-A-G-A… 5’ -C-T-C-A-G-C-T-G-G-A-G-A… 5’ 5‘ … C-G-A-G-T-OH -G-A-G-T- 5‘ ppp dN Mg 2+ 3‘ … G-C-T-C-A-G-C-T-G-G-A-G-A… 5’ -C-T-C-A-G-C-T-G-G-A-G-A… 5’ 5‘ … C-G-A-G-T-C-G-A-C-C-OH -G-A-G-T-C-G-A-C- DNA pol I DNA ? ? ? ? v?? ) DNA ? ? I DNA pol I  v?? ) ? ?  ? g -MS:E ? g -MS:E v?? ) DNA ? ? I ¥'¨o v?? ) ? ? ¥'¨o 5‘ … G-C-T-C-A-G-C-T-G-G-A-G-T… 3’ -C-T-C-A-G-C-T-G-G-A-G-T… 3’ 3‘ … C-G-A-G-T-C-G-A-C-C-T-C-A… 5‘ -G-A-G-T-C-G-A-C-C-T-C-A… 5‘ Mg 2+ 5‘ dNTP 5‘ ppp dA α- 32 P-dATP ppp  5‘ … G-C-T-C A-G-C-T-G-G-A-G-T… 3’ -C-T-C A-G-C-T-G-G-A-G-T… 3‘ … C-G-A-G-T-C-G-A-C-C-T-C-A… 5‘ -G-A-G-T-C-G-A-C-C-T-C-A… 5‘ 5‘ … G-C-T-C-A-G-C-T-G-G-A-G-T… 3’ -C-T-C-A-G-C-T-G-G-A-G-T… 3’ 3‘ … C-G-A-G-T-C-G-A-C-C-T-C-A… 5‘ -G-A-G-T-C-G-A-C-C-T-C-A… 5‘ Nick translation ?! 32 PS:¥? ?! S:¥? DNase I DNA pol I DNA ? ? ? ? v?? ) DNA ? ? I v ?  Klenow  v?? ) ? ? v ?  Klenow ?¥'?é ?¥'?é v?? ) DNA ? ?*ü j¤? )?a ?) ?¤ N v?? ) ? ?*ü j¤? )?a ?) ?¤ ?s-=¥vt '1 Klenow ? ?s-=¥vt '1 Klenow ? ˉ?μ ‘1‘¥DNA ? ??? ‘1‘¥? ? ˉ?μ ? ?? ? ? ?? M ??? > ?  ‘1‘¥? ?? M ?? ? ?? M ?? ? > ?  ¥? ?? M ?? DNA ? ? ? ? v?? ) DNA ? ? I v ?  Klenow  v?? ) ? ? v ?  Klenow ?¥'¨o ?¥'¨o ? ü?? ? = M ?á 3¥ ‘T?  ? ü?? ? = M ?á 3¥ T?  DNA ? ¥]ê í  S: ? ¥]ê í  S: cDNA?= y¥?? ?= y¥?? ??  ??E?? DNA?  ??  ??E?? ?  DNA ? ? ? ? v?? ) DNA ? ? I v ?  Klenow  v?? ) ? ? v ?  Klenow ?¥'¨o? ü?? ? = M ?á 3¥ ‘T?  ?¥'¨o ? ü?? ? = M ?á 3¥ T?  5‘ … G-C-T-G-OH P-A-A-T-T-C-G-A-G … 3’ -C-T-G- -A-A-T-T-C-G-A-G … 3‘ … C-G-A-C-T-T-A-A-POH-G-C-T-C … 5’ -G-A-C-T-T-A-A- -G-C-T-C … Klenow dATP dTTP 5‘ … G-C-T-G-A-A-T-T-OH P-A-A-T-T-C-G-A-G … 3’ -C-T-G-A-A-T-T- -A-A-T-T-C-G-A-G … 3‘ … C-G-A-C-T-T-A-A-POH-T-T-A-A-G-C-T-C … 5’ -G-A-C-T-T-A-A- T-T-A-A-G-C-T-C … DNA ? ? ? ? v?? ) DNA ? ? I v ?  Klenow  v?? ) ? ? v ?  Klenow ?¥'¨o DNA ? ¥]ê í  S: ?¥'¨o ? ¥]ê í  S: 5‘ … G-C-T-G-OH P-A-A-T-T-C-G-A-G … 3’ -C-T-G- -A-A-T-T-C-G-A-G … 3‘ … C-G-A-C-T-T-A-A-POH-G-C-T-C … 5’ -G-A-C-T-T-A-A- -G-C-T-C … Klenow α- 32 P-pppdA dTTP P-pppdA dTTP 5‘ … G-C-T-G-A-A-T-T-OH P-A-A-T-T-C-G-A-G … 3’ -C-T-G-A-A-T-T- -A-A-T-T-C-G-A-G … 3‘ … C-G-A-C-T-T-A-A-POH-T-T-A-A-G-C-T-C … 5’ -G-A-C-T-T-A-A- T-T-A-A-G-C-T-C … DNA ? ? ? ? T4-DNA ? ? ? ? T4-DNA ?¥'+? ?¥'+? í dNTP H V[V ?? 3‘-OH ? M í H V[V ??  ? M oμB? dNTP H? Mào?? ? ] HT? oμB? H? Mào?? ? ] HT?  1? dNTP (i H ??]??1ê  1? (i H ??]??1ê ‘1‘¥DNA ? ??? ‘1‘¥? ?? M ?? ? ??? ¥? ?? M ?? DNA ? ? ? ? T4-DNA ? ? ? ? T4-DNA ? ?¥'¨o M ü?? ? = M ?á 3¥ ’T?  ? ?¥'¨o M ü?? ? = M ?á 3¥ T?  5‘ … G-C-T-C-T-G-C-A-OH P-G-G-A-G … 3’ -C-T-C-T-G-C-A- -G-G-A-G … 3‘ … C-G-A-G-PHO-A-C-G-T-C-C-T-C … 5’ -G-A-G- -A-C-G-T-C-C-T-C … T4-DNA ? ? ? ? 5‘ … G-C-T-C- OH P-G-G-A-G … 3’ -C-T-C- -G-G-A-G … 3‘ … C-G-A-G-PHO-C-C-T-C … 5’ -G-A-G- -C-C-T-C … ?i? ?9 ??3 ? y DNAo ^ ?1? y?3??? ?i? ?9 ??3 ? y o ^ ?1? y?3??? DNA ? ? ? ? T4-DNA ? ? ? ? T4-DNA ? ?¥'¨o DNA ? ¥]ê í  S: ? ?¥'¨o ? ¥]ê í  S: 5‘ G-C-T-C-A-G-C-T-G-G-A-G-T 3’ G-C-T-C-A-G-C-T-G-G-A-G-T 3’ 3‘ C-G-A-G-T-C-G-A-C-C-T-C-A 5‘ C-G-A-G-T-C-G-A-C-C-T-C-A 5‘ Mg 2+ 5‘ ppp dN 5‘ ppp dA α- 32 P-dATP 2+ ppp dA  5‘ G-C-T-C A-G-C-T-G-OH G-C-T-C A-G-C-T-G- HO-T-C-G-A-C-C-T-C-A 5‘ -T-C-G-A-C-C-T-C-A 5‘ T4-DNA pol T4-DNA pol 5‘ G-C-T-C-A-G-C-T-G-G-A-G-T 3’ G-C-T-C-A-G-C-T-G-G-A-G-T 3’ 3‘ C-G-A-G-T-C-G-A-C-C-T-C-A 5‘ C-G-A-G-T-C-G-A-C-C-T-C-A 5‘ DNA ? ? ? ? G ?? RNA¥DNA ? ? Q c ? G ?? ? ? Q c ? Q c ?¥'+?[ RNA1 e ? cDNA y Q c ?¥'+? [ 1 e ? y 3’AAAAAAAAAAAAAA 5’mRNA Q c ? Q c ? Mg 2+ dNTP 5’TTTTTTTTTTTT oligo (dT) 12-18 3’AAAAAAAAAAAAAA 5’mRNA 5’TTTTTTTTTTTTTT ’TTTTTTTTTTTTTT 3’cDNA DNA ? ? ? ? G ?? RNA¥DNA ? ? Q c ? G ?? ? ? Q c ? Q c ?¥'+? ?_? M DNA-RNA? y?¥ RNA y Q c ?¥'+? ?_? M ? y?¥ y Q c ? Q c ? 3’ RNA 5’ DNA3’ 5’ 3’ RNA 5’ DNA3’ 5’ Q c ? Q c ? 5’ DNA3’ ? ? ? ? ? ? ? y? ?? M ?? ?? M ? VII ExoVII ? y? ?? M ?? ?? M ?  v?? )¥? ?? M ? VII?31 Mg 2+ v?? )¥? ?? M ? ?31 ExoVII 3’ 5’3’ 5’ 3’ 5’ 3’ 5’ ? ? ? ? ? ? ? y? ?? M ?? ?? M ? III ExoIII ? y? ?? M ?? ?? M ?  ExoVII 3’ 5’3’ 5’ Mg 2+ 3’ 5’3’ 5’ v?? )¥? ?? M ? III +s?1V 3‘  ? M v?? )¥? ?? M ? +s?1V  ? M ? ? ? ? ? ? ? y? ?? M ? λ ? ?? M ? λExo ? y? ?? M ? ? ?? M ? λExo 3’ 5’3’ 5’ Mg 2+ λ? ?? M ?+s?1V 5‘  ? M ? ?? M ?+s?1V  ? M 3’ 5’3’ 5’ ? ? ? ? ? ? ? y? ? = M ? S1? ? ? ? y? ? = M ? ? ? ? S1? ? ?¥'+? ?1?! w ? ) Aspergillus oryzae ? ? ?¥'+? ?1?! w ? ) Zn 2+ A3 A3 K a pHS?1 4.0 - 4.3 31 NaCl 10 - 300 mM 31 ?3? y DNA¥ ?1?3 ? y DNA y 75000 ?3? y ¥ ?1?3 ? y y  ?3? y DNA¥ ?1?3? y RNA y 7 ?3? y ¥ ?1?3? y y  ? ? ? ? ? ? ? y? ? = M ? S1? ? ? ? y? ? = M ? ? ? ? S1? ? ?¥'Q? = M? y DNA RNA ? ? ?¥'Q? = M? y  5‘ … G-C-T-C-A-G-C-T-C-T-T-G-A-G-G-A-G-T… 3’ -C-T-C-A-G-C-T-C-T-T-G-A-G-G-A-G-T… 3’ S1 Zn 2+ 5‘ … G-C-T-C-A-G-C-T-C T-T-G-A-G-G-A-G-T… 3’ -C-T-C-A-G-C-T-C T-T-G-A-G-G-A-G-T… 5‘ … G-C-T-C A-G-C-T-C T-T-G-A-G G-A-G-T… 3’ -C-T-C A-G-C-T-C T-T-G-A-G G-A-G-T… 5‘ dNMPs  5‘ NMPs  ? ? ? ? ? ? ? y? ? = M ? S1? ? ? ? y? ? = M ? ? ? ? S1? ? ?¥'Q? = M{ ? g ? Y¥ ? y DNA RNA ? ? ?¥'Q? = M{ ? g ? Y¥ ? y  5‘ … G-C-T-C-A-G C-T-G-G-A-G-T… 3’ -C-T-C-A-G C-T-G-G-A-G-T… 3‘ … C-G-A-G-T-C-G-A-C-C-T-C-A… 5‘ -G-A-G-T-C-G-A-C-C-T-C-A… 5‘ 5‘ … G-C-T-C-A-G-C-T-G-G-A-G-T… 3’ -C-T-C-A-G-C-T-G-G-A-G-T… 3’ 3‘ … C-G-A-G-T-C A-C-C-T-C-A… 5‘ -G-A-G-T-CA-C-C-T-C-A… nick gap S1 Zn 2+ 5‘ … G-C-T-C-A-G -C-T-C-A-G 3‘ … C-G-A-G-T-C -G-A-G-T-C T-G-G-A-G-T… 3’ T-G-G-A-G-T… A-C-C-T-C-A… 5‘ A-C-C-T-C-A… ? ? ? ? ? ? ? y? ? = M ? S1? ? ? ? y? ? = M ? ? ? ? S1? ? ?¥×1¨o DNA ?ê RNA S1 mapping ? ? ?¥×1¨o  ?ê  DNA mRNA ? ? S1 EcoRI ? ? ? ? ? ? ? y = M ? y? M¥? ? ? Bal31? ? ? ? y = M ? y? M¥? ? ? ? ? ? S1? ? ?¥'+? ?1· f?9? ) A.espejiana ? ? ?¥'+? ?1· f?9? ) Ca 2+ 5‘ dNMPs  5‘ NMPs  ssDNA or RNA Ca 2+ Ca 2+ ? ? ? ? ? ? ? y = M ? y? M¥? ? ? Bal31? ? ? ? y = M ? y? M¥? ? ? ? ? ? Bal31? ? ?¥'¨oo? DNAlM ? ? ?¥'¨oo? lM EcoRI A B C EcoRI EcoRI B C A Bal31 B C A ì? ì? A C ? ?? e ? ? ?? e ?  ???M ? TdT  ???M ? TdT¥'+? ?1l d£F ¥'+? ?1l d£F ?31 e¥ DNA ? ? ?? ? dNTPs ?31 e¥ ? ? ?? ? 5‘ p 3‘ HO OH 3‘ p5‘ TdT Mg 2+ dATP 5‘ p 3‘ HO AAAAAAAAAAAA OH 3‘ p5‘ TdT¥'+? ¥'+? 5‘ p 3‘ HO OH 3‘ p5‘ TdT Co 2+ dATP 5‘ p 3‘ HO AAAAAAAAAAA AAAAAAAAAA OH 3‘ p5‘ 5‘ p 3‘ HO OH 3‘ p5‘ TdT Co 2+ dATP 5‘ p 3‘ HO AAAAAAAAAAAAAA OH 3‘ p5‘ AAAAAAAAAAA ? ?? e ? ? ?? e ? a? ?? ? a? ?? ? ?1l d£F¥a? ?? ? CIP ?1l d£F¥a? ?? ? ?1v?? )¥a? ?? ? BAP ?1v?? )¥a? ?? ? 5‘ p OH 3‘ DNA or RNA 5‘ ppp dN 5‘ pppN BAP / CIP OH 3‘ 5‘ HO 5‘ HO dN 5‘ HO N ? ?? e ? ? ?? e ? T4-? ? ? ? T4-PNP ? ? ? ? T4-PNP¥'+? DNAaRNAadNRaNR¥5‘-OH F ¥'+? F 5‘ HO 3‘ HO OH 3‘ OH 5‘ T4-PNP Mg 2+ pppATP γ- 32 P-ATP pppA  5‘ p 3‘ HO OH 3‘ p 5‘ ¨??¥  ]ê íS: ¨??¥  ]ê íS: B ¨?y X H¥8 ¨?y X H¥8 3 ×F DNA/ ? ?3¥'Hq ×F / ? ?3¥'Hq é ì plasmid é ì ` )8hy DNA ` )8hy I ?é ì cosmidD ` ) ì I ?é ì D ` ) ì |/ ? ?88 |/ ? ?88 8¥? ?#+? 8¥? ?#+? 8¥? ?#+? 8¥? ?#+? 8¥? ? 8¥? ?  ??÷yúr ? s8%  ??÷yúr ? s8% 1?÷y4ˉ? ? ??? ? ? 1?÷y4ˉ? ? ??? ? ? 1?÷y¥ ?9Vr4A1¥Hq 1?÷y¥ ?9Vr4A1¥Hq 8¥? ?#+? 8¥? ?#+? 8? !¥Hq 8? !¥Hq μ? s8%¥ T?? T?? VM? μ? s8%¥ T?? T?? VM? μ? a¥ ?êS: μ? a¥ ?êS: μ?ú¥?÷ DNA¥ ? ? μ?ú¥?÷ ¥ ? ? μ??B¥? ? = M ? MY Méê? μ??B¥? ? = M ? MY Méê? μD+? s8%M a?¥ˉ?ê???ê? μD+? s8%M a?¥ˉ?ê???ê? é ì é ì é ì¥'+? é ì¥'+? é ì ^ 3t% =%μ¥a ?? ? ?7? ? ?871?ˉ?ai é ì ^ 3t% =%μ¥a ?? ? ?7? ? ?871?ˉ?ai $×?L.¥B ?? ?s0 $×?L.¥B ?? ?s0 é ìèn?e?% )?? )? é ìèn?e?% )?? )? 'v ?¥é ì ^ DNA?¥ 'v ?¥é ì ^ 'v ?¥? ? DNAé ì μ Na>aì¥s02 'v ?¥? ? é ì μ Na>aì¥s02 ' cccDNA ' é ì DNA¥s0 S? 1 - 300 kb é ì ¥s0 S? é ì é ì é ì¥'+? é ì¥'+? é ì¥1?ˉ?? é ì¥1?ˉ?? é ì ? ?¨7?%¥ DNAˉ?"dé?1?ˉ? é ì ? ?¨7?%¥ ˉ?"dé?1?ˉ? é ì DNA ¥ˉ?02 %? é ìD7?¥?1" é ì ¥ˉ?02 %? é ìD7?¥?1" ?  ??%?¥s0 ? J ?*é ì Vs1 ?  ??%?¥s0 ? J ?*é ì Vs1 vˉ? ?? vˉ? ?? ???ˉ? e?¥é ì 1 - 3 J stringent plasmid ???ˉ? e?¥é ì J ???ˉ? e?¥é ì 10 - 60 J stringent plasmid ???ˉ? e?¥é ì J é ì é ì é ì¥'+? é ì¥'+? é ì¥1?ˉ?? J ?¥ e?? – é ì DNAˉ? ? e? é ì¥1?ˉ?? J ?¥ e?? é ì ˉ? ? e? e?ˉ??tD e¥2? e?ˉ??tD e¥2? ori E.coli ColE1 plasmid ˉ?Z_ ˉ?Z_ rop  +  Rop RNA II RNA I 3’ 5’ 5’ 3’ é ì é ì é ì¥'+? é ì¥'+? é ì¥1?ˉ?? J ?¥ e?? – é ì DNAˉ? ? e? é ì¥1?ˉ?? J ?¥ e?? é ì ˉ? ? e? e?ˉ?  Sy0Dˉ?  Sê? ori¥2? e?ˉ?  Sy0Dˉ?  Sê? ¥2? Pcop cop P/Orep rep ori Cop Rep é ì é ì é ì¥'+? é ì¥'+? é ì¥?M ?? é ì¥?M ?? ?? ?cμM ?ˉ?02¥?]é ì? ?] Hi? ?? ?cμM ?ˉ?02¥?]é ì? ?] Hi? B?%???C`?1é ì¥?M ???M ??¥é B?%???C`?1 é ì¥?M ?? ?M ??¥é [v?? )¥é ì1 è [v?? )¥é ì1 è ColE1apMB1 ?μM ?¥ˉ?024N?M ? ?μM ?¥ˉ?024N?M ? pSC101aFaRP4 ?μM ?¥ˉ?024N?M ? ?μM ?¥ˉ?024N?M ? p15A#  3é ì?μM ?¥ˉ?024N?M ? #  3é ì?μM ?¥ˉ?024N?M ? ìF??M ?? ? ìF? ?M ?? ? é ì é ì é ì¥'+? é ì¥'+? é ì¥?M ??s0? é ì¥?M ?? s0? ?cμM ?ˉ?02¥?]é ìˉ? H s?]B? ?cμM ?ˉ?02¥?]é ìˉ? H s?]B? J ? e?"d¥? ?á P ?é ì¥K? J ??] J ? e?"d¥? ?á P ?é ì¥K? J ??] ?cμ?]ˉ?02¥?]é ìˉ? Hò s1-¥ ?cμ?]ˉ?02¥?]é ìˉ? Hò s1-¥ J ? e?"d¥??á P ?é ì¥K? J ??? J ? e?"d¥??á P ?é ì¥K? J ??? yNüV ??ˉ?? ù?%s ? ùa ˉ ? )?]B yNüV ??ˉ?? ù?%s ? ùa ˉ ? )?]B % = % = ? J ?¥é ì[a¥%s ? ù?÷ a ] ? J ?¥é ì[a¥%s ? ù?÷ a ] é ì é ì é ì¥'+? é ì¥'+? é ì¥ VM? é ì¥ VM? ê § f|? )¥é ì Vs? v ? ê § f|? )¥é ì Vs? v ? ¤??é ì ?? ?Hq/1?1VB?%M? ¤??é ì ?? ?Hq/1?1VB?%M? 6B?% ¤?T¨ ? FaColaRé ì? 6B?% ¤?T¨ ? é ì? ? ColaR¥  ??? ? ¥  ??? d¤??é ì ? ?? ?Hq/? ?1? 3¤?T¨ d¤??é ì ? ?? ?Hq/? ?1? 3¤?T¨ ′¤?i¥ ^ td¤??é ì ColE1¤??é ì ′¤?i¥ ^ td¤??é ì ¤??é ì ¥i?xù/9 ?? 3 DNAM??V?? bom ? ¥i?xù/9 ?? 3 M??V?? ? mob y %? y %? é ì é ì é ì¥'+? é ì¥'+? z{+ y¥L.S: z{+ y¥L.S: 7 3?¥é ì DNA aaz{B??L.S:y? 7 3?¥é ì aaz{B??L.S:y? P¤7? 3tá 3?è 3édA3¥?F? ? P¤7? 3tá 3?è 3édA3¥?F? ? té F? F 3 ía×á ? ?0ay?| ?0aμt té F? F 3 ía×á ? ?0ay?| ?0aμt té?? F 3 ía% )y íaμa té?? F 3 ía% )y íaμa ?tS:y DNA×Fs0¥ ?ê μ×1il ?tS:y ×Fs0¥ ?ê μ×1il é ì é ì é ì¥y é ì¥y ? ?i¥7 3?é ì??s0  va J ??a?B ? Mê? aL.S:? ?X? ?J? ? ?@ X H8¥1 pyNa a31[?7 3?é ì1$é? |yyb ? ?i¥7 3?é ì??s0  va J ??a?B ? Mê? aL.S:? ?X? ?J? ? ?@ X H8¥1 pyNa a31[?7 3?é ì1$é? |yyb " - L i P¨¥v?? )é ìv  ^?  ?+?7 3?é ì y¥ " - L i P¨¥v?? )é ìv  ^?  ?+?7 3?é ì y¥ pSC101 8.8 kb J ? 5 1ì í F?S:y Tc r J ? 1ì í F?S:y ColE1 6.5 kb J ? 20 - 30 v?? ) =y íS:y E1 6.5 kb J ? v?? ) =y íS:y RSF2124 ColE1 3é ì ?t ] ? í F?S:y Ap r ColE1 3é ì ?t ] ? í F?S:y é ì é ì é ì¥s ? é ì¥s ? |yy¥é ì? ? ??¨o Vs? ?/+ ? |yy¥é ì? ? ??¨o Vs? ?/+ ? ú Jé ì lM J ? e?y J ? 1000-3000 ?9y ú Jé ì lM J ? e?y J ? ?9y ? Jé ì ?1 pSC101 J ?l? 10 Vr ty?y ? Jé ì ?1 J ?l? Vr ty?y ? ùé ì ?]?/VC J ?a????]?é ? ùé ì ?]?/VC J ?a????]?é ??é ì cμ??Y¨?to?? ? ?¤h polylinker ??é ì cμ??Y¨?to?? ? ?¤h ??é ì  μ??\éy#ê? L??÷y¥?? ??é ì  μ??\éy#ê? L??÷y¥?? , èé ì  μ? ??] s8¥ˉ?0 L?y X H , èé ì  μ? ??] s8¥ˉ?0 L?y X H Vré ì  μ <??÷yVr¥ caJraB?¥íq Vré ì  μ <??÷yVr¥ caJraB?¥íq ?é ì  μáy L? ?0?íq¥ X H ?ê ?é ì  μáy L? ?0?íq¥ X H ?ê é ì é ì ×1¥v?? )é ì8 ×1¥v?? )é ì8 ???ˉ? ???ˉ? pBR322 4363 bp Origin of Replication ROP ROI Sal I BamH I Tc r Pvu I Pst I Pst I EcoR I Cla I Hind III Hind II Bal I Ap r pBR322  o ? í V ?9 o ? í V ?9 J ? 50 - 100 / cell J ? ¨?y X H ¨?y X H é ì é ì ×1¥v?? )é ì8 ×1¥v?? )é ì8 pUC18 / 19  J ? 2000 - 3000 / cell J ? ¨?y X H??? ¨?y X H???  μ X Hê? MCS  μ X Hê? ?ê4t ?S: lacZ’ ?ê4t ?S: BamHI pUC18 2686 bp Ap r lacZ' ori GAATTCGAGCTCGGTACCCGGGGATCCTCTAGAGTCGACCTGCAGGCATGCAAGCTT 396 452 EcoRI SstI KpnI SmaI XbaI SalI PstI SphI HindIII é ì é ì ×1¥v?? )é ì8 ×1¥v?? )é ì8 pUC18 / 19?ê4S: lacZ’ ¥A ?e ?  ?ê4S: ¥A ?e ? pUC18/19 Plac lacZ’ ’ MCS β-? ? ?¥ α-t ? ? ?¥ t αβ O H H H OH H OH HOH CH 2 OH O N Cl Br Cl Br Cl Br O N N 5- -4- o -3- ) -β-D-? ?  o  ) ? ? X-gal é ì é ì ×1¥v?? )é ì8 ×1¥v?? )é ì8 pGEM-3Z   J  J  μ ? ` )8¥ < ?0  μ ? ` )8¥ < ?0  μ X Hê? MCS  μ X Hê? ?ê4t ?S: lacZ’ ?ê4t ?S: ¨??÷y¥úrVr ¨??÷y¥úrVr ?i T7? SP6 ?0+s?1? ` )8 DNAI ?¥ RNA ? ?i ? ?0+s?1? ` )8 ? 2743 bp MCS lacZ’ ’ P T7 ori Ap r r pGEM-3E P SP6 ? ? MYyNM?¥ s8 )A?Vr ` )8 RNA ? ? ? ? ? MYyNM?¥ s8 )A?Vr ` )8 ? ? ? E.coli BL21 DE3?  ? é ì é ì é ì DNA¥s ?B? é ì ¥s ?B? L iB? P¨/  ??ZE?!é ì DNA L iB? P¨/  ??ZE?!é ì  o?ì á0 ??E o?ì á0 ??E é ì DNABúa? ùéa !!1 púaY?ê ? é ì Búa? ùéa !!1 púaY?ê ? a ·E a ·E é ì DNAB?a y ?a?TeL é ì B?a y ?a?TeL m £?E m £?E é ì DNABa?T? ùo? o?ìE?a ·E-W é ì Ba?T? ùo? o?ìE?a ·E-W é ì é ì é ì DNA¥s ?B? é ì ¥s ?B? o?ì á0 ??E o?ì á0 ??E ¨cμ EDTA¥? A?? )8 ¨cμ ¥? A?? )8 F · ) ? 3% )%C F · ) ? 3% )%C F CsCl?Y? F ?Y? ? ? ??V@ ? ? ??V@ ,?§/ | cccDNA ,?§/ |  d?? cccDNA  d?? proteins ocDNA L-DNA cccDNA RNAs é ì é ì é ì DNA¥s ?B? é ì ¥s ?B? a ·E a ·E ¨cμ EDTA¥? A?? )8 ¨cμ ¥? A?? )8 F · ) ? 3% )%C F · ) ? 3% )%C F NaOH? SDS¥? ·A ?  db =ct F ? ¥? ·A ?  db =ct Fú i¥Z ?K ·A?? ? ?8 ?" ? Fú i¥Z ?K ·A?? ? ?8 ?" ? ?8 DNA#v?s?aé ?8 #v?s?aé ?? |  bA¨&p o_Y | ?"? ¥?aé ?? |  bA¨&p o_Y | ?"? ¥?aé Y?sd??? £Mé ì DNA Y?sd??? £Mé ì ¨í DNase¥RNase ?"??¥ RNA ¨í ?"??¥ cccDNA L-DNA ocDNA D-DNA T-DNA é ì é ì é ì DNA¥s ?B? é ì ¥s ?B? m £?E m £?E ¨cμ EDTA? Triton X-100¥? A?? )8 ¨cμ ? ¥? A?? )8 F · ) ? 3% )%C F · ) ? 3% )%C m £? 40 eò m £? eò ??¨í )é &G ???t ??¨í )é &G ???t Y?sd???é ì DNA Y?sd???é ì ` )8hy DNA ` )8hy ` )8hy ^B ?d%± 3t ?úr qú+s?1 S ? ` )8hy ^B ?d%± 3t ?úr qú+s?1 S ? ó?% ?a1?ˉ?N2?? ? ó?yF? .? ó?% ?a1?ˉ?N2?? ? ó?yF? .?  ?7 OB?¥Hq/  ? ? ???Mo?b  ?7 OB?¥Hq/  ? ? ???Mo?b ` )8hy¥  ?+? P¤ ? ì¥ DNA ?$ 7??1yy ` )8hy¥  ?+? P¤ ? ì¥ ?$ 7??1yy ?¥μ¨8y1 ?¥μ¨8y1 úr q¥? ?? ? P?÷yúr? ? s8% úr q¥? ?? ? P?÷yúr? ? s8% 1?ˉ?N2? ? P?÷y s8%?úr ?9 1?ˉ?N2? ? P?÷y s8%?úr ?9 ` )8hy DNA ` )8hy v?? )¥ λ ` )8 DNA v?? )¥ ` )8 λ ` )8¥ 3tD+? 3t2 ` )8¥ 3tD+? 3t2 λ ` )8 ^v?? )¥??? ` )8 ` )8 ^v?? )¥??? ` )8 λ ` )8?? T ?a? λ-DNAF? ` )8?? T ?a? F? λ-DNA ?é 48502?? ? ?é ?? ? λ-DNA à μ 61?y à μ ?y λ ` )8 3tD+? 3t2 ` )8 3tD+? 3t2 5’ TCCAGCGGCGGGG 3’ 3’ CCCGCCGCTGGA 5’COS COS cos h???y h???y á???y á???y · ) e?y · ) e?y ? ù e?y ? ù e?y DNA?? e?y ?? e?y E3y E3y * ù e?y * ù e?y E3y E3y ×Fy ×Fy ÷"D??y ÷"D??y λ - DNA ` )8hy DNA ` )8hy v?? )¥ λ ` )8 DNA v?? )¥ ` )8 λ ` )8 3tD+?? ?? ù ` )8 3tD+? ? ?? ù E.coli  ?  ? LamB s8 s8 ? ? ? ? ˉ? ˉ?   3 3 ` )8hy DNA ` )8hy v?? )¥ λ ` )8 DNA v?? )¥ ` )8 λ ` )8 3tD+?? ?? ù ` )8 3tD+? ? ?? ù 8 = 8 = 100?P·¥ J ?P·¥ J  S?1e DNA¥75 - 105%  S?1e ' 36 - 51 kb ' D A ` )8hy DNA ` )8hy v?? )¥ λ ` )8 DNA v?? )¥ ` )8 λ ` )8 3tD+? ·e ? ` )8 3tD+? ·e ? λ ` )8? ?v?? )a" ? 3%?9 V ?|  DNA°¤??? ó?%¥ ? ?8 DNA i?á 30} ` ) 8 R ì?? f ?1 ·e ?b???1? λ-DNA ¥ cI? int y¥át ?7? ?y¥ 7bD1>? | %? ó ?%' &¥?éb | ì V[? 31?M λ-DNA ó?% ¥?é P ` )8)? · ) ?)? · ) ? DNA×F/ ?B?31 λ ` )8é ? · ) ? ` )8? ?v?? )a" ? 3%?9 V ?|  °¤??? ó?% ? ? i?á 30} ` ) 8 R ì?? f ?1 ·e ? b???1? ? y¥át ?7? ?y¥ 7bD1>? | %? ó ?%' & ?éb | ì V[? 31?M  ó?% ¥?é P ` )8)? · ) ? )? · ) ? ×F/ ?B?31 ` )8é ? · ) ? ` )8hy DNA ` )8hy v?? )¥ λ ` )8 DNA v?? )¥ ` )8 λ-DNA8¥y ê é 8¥y ê é 7 3? λ-DNA ¥ K1 51kb' &é1 48.5kboμ ?? ?¥?÷ DNA ? ?v? 2.5kb H? ?$ ?μ? ? ?¥ ` )8 R ìbyN ê 7 3? λ-DNA¥é V[4ú  b  L7 3? λ-DNA ?μ 40-50%¥ ? ^ˉ?? 3 ?dA3¥b? M"¥  V| λ-DNAs? v ?8 7 3?  ¥ K1 ' &é1 oμ ?? ?¥?÷ ? ?v? H? ?$ ?μ? ? ? ` ) R ìbyN ê 7 3? ¥é V[4ú  b  L7 3? ?μ ¥ ? ^ˉ?? 3 ?dA3¥b? M"¥  V| s? v ?8 ? ??8 ? ??8 |}?8 |}?8 ` )8hy DNA ` )8hy v?? )¥ λ ` )8 DNA v?? )¥ ` )8 λ-DNA8¥y ê é ? ??8 8¥y ê é ? ??8 8? 8? ? ?ê? ? ?ê? 8? 8? ? ? ? ? ? ? 8é 37 kb 8é ? ? ? vl ? ? ? vl 0 - 14 kb  51 – 37   ` )8hy DNA ` )8hy v?? )¥ λ ` )8 DNA v?? )¥ ` )8 λ-DNA8¥y ê é |}?8 8¥y ê é |}?8 8? 8? 8? 8? ? ? ? ? ? ? Kl é 10 kb Kl é  51 – 26   8é 26 kb 8é ? ? ? ? ? ? Kv é 25 kb Kv é  36 – 26   ` )8hy DNA ` )8hy v?? )¥ λ ` )8 DNA v?? )¥ ` )8 λ-DNA8¥y ÷"×ˉ¥ ? Mê? 8¥y ÷"×ˉ¥ ? Mê? 7 3?¥ λ-DNA y μ 5? EcoRIê?? 7? HindIIIê?? 7 3?¥ y μ ? ê?? ? ê?? ??×F?TA? ÷"à 1 - 2? ??×F?TA? ÷"à ? ] H1 L?ò? ?÷¥ DNA ? ¥ X H?319FB ] H1 L?ò? ?÷¥ ? ¥ X H?319FB t?B¥ ? Mê? t?B¥ ? Mê? " e?¥ Mé??31?¨??lM/ ? ?"9@ ? " e?¥ Mé??31?¨??lM/ ? ?"9@ ? ê? ê? ` )8hy DNA ` )8hy v?? )¥ λ ` )8 DNA v?? )¥ ` )8 λ-DNA8¥yF ê4S: 8¥y F ê4S: Dé ì?]7 3? λ-DNA  ? ? a¥ê4S:yN Dé ì?]7 3?  ? ? a¥ê4S:yN F ê4S: ^ λ-DNA X H8y¥×1 = ? F ê4S: ^ X H8y¥×1 = ? λ-DNA X H8 ¥ê4S:?1μ/   ? X H8 ¥ê4S:?1μ/   ? ?f? ? ?S: ?f? ? ?S: t ?Q? ?S: t ?Q? ?S: ` )8hy DNA ` )8hy v?? )¥ λ ` )8 DNA v?? )¥ ` )8 λ-DNA8¥yF ê4S: imm434 8¥y F ê4S: imm434yI ?B?E? λ- ` )8 yI ?B?E? ` )8 é ? · )?ì¥E3tbcμ??S: é ? · )?ì¥E3tbcμ??S: y¥ λ-8é ? s8%ay ? · 8é ? s8%ay ? · e ?% ) 3é? ¤??$ê e ?% ) 3é? ¤??$ê ??÷ DNA? ??S:y?y ? ??÷ ? ??S:y?y ?  λ-×Fs0Lé ? · )?ì??  ×Fs0Lé ? · )?ì?? i üê i üê ` )8hy DNA ` )8hy v?? )¥ λ ` )8 DNA v?? )¥ ` )8 λ-DNA8¥yF ê4S: lacZ 8¥y F ê4S: lacZyI ? β-? ? ? ?b? yI ? ? ? ? ?b? í ?¥ X-gal 3? ? ???tb??÷ 3? ? ???tb??÷ y? ?? lacZy?y ?? ? y? ?? y?y ?? ? ?? ? ???t 7 b8 λ-DNA5á ?? ? ???t 7 b8 5á 3 ? ?i üê 3 ? ?i üê ` )8hy DNA ` )8hy v?? )¥ λ ` )8 DNA v?? )¥ ` )8 λ-DNA8¥yy2" á ?0¥lM8 8¥y y2" á ?0¥lM8 2"?lM sup ^·? CAG Gln_ UAG stop¥lMb v?? )¥ t )écμ+s?¥n?y I ?átn? tRNA ?B?1???BlMb |7 3? λ-DNA  D? E ?h? ?a¥y?¥ CAG á ? 0lM? UAGb??? λ-DNAé ?B?¥v?? ) )éa? ???μ?¥h??a9ü? ?$ ? 3% )?"ü V[E?μ]×F8¥ 3tê ?# ? ?7yy? L? P¨ ¥ s85 ^ μ2"?lM8n?? ?¥ )é 2"?lM ^·?  _  v?? ) )écμ+s?¥n?y I ?átn? ?B?1???BlMb |7 3?  ? ?h? ?a¥y?¥ 0lM? b??? é ?B? v?? ) )éa? ???μ?¥h??a9ü? ?$ ? 3% )?"ü V[E?μ]×F8¥ 3tê ?# ? ?7yy? L? P¨ ¥ s85 ^ μ2"?lM8n?? ?¥ )é ` )8hy DNA ` )8hy v?? )¥ λ ` )8 DNA v?? )¥ ` )8 λ-DNA8¥?1 ?? 8¥?1 ?? ? ? ??8 ? ? ??8 Charon2aCharon6aλgt11 |}?8 |}?8 λEMBL4aλgtλcaλNM762aCharon40 ?ê4?8 ?ê4?8 λEMBL1aλL47aλ1059 7 3?¥ λ ` )8? ? P2 ` )8 ·÷?¥% )?N2 Spi +  7 3?¥ ` )8? ? ` )8 ·÷? ¥% )?N2  ?? 3é]?V? s λ-DNA ¥ red? gam ?y e?b ?|? ?? 3é]?V? s ? ?y e?b ?|? ÷ DNA |} red? gam ×F ` )8L?μ Spi - V? ? P2 ` ) ÷ |} ?  ×F ` )8L?μ - V? ? ` ) 8 ·÷?¥v?? ) s8 )?N2i??i üê 8 ·÷? ¥v?? ) s8 )?N2i??i üê ` )8hy DNA ` )8hy v?? )¥ λ ` )8 DNA v?? )¥ ` )8 λ-DNA×Fs0¥8?  ×Fs0¥8?  λ-DNA×Fs038? |y ?μ? ? ?¥ ` )8×F R ìZ Vúr? ? s8% ¨?8? ¥?aé V°¤V? ?  λ ` )8¥v?? )?4 |CX  ??b?t ?aYès1Moo?¥ ?s B?s ?  EFz 6B?s5 ?  DFzb H? O?? ? ?s ?aD×F λ-DNAs0?a ? ?μré ? ??B??a A$×F λ-DNAê ?a (? ?$ ?μ? ? ?¥ ` )8 R ì?9 ^?? ?7 !9¥ ×Fs03 |y ?μ? ? ? ` ) ×F R ìZ Vúr? ? s8% ¨?8? ¥?aé V°¤V? ` )8¥v?? )?4 |CX  ??b?t ?aYès1Moo?¥ ?s B?s ?  Fz 6B?s5 ?  Fzb H? O?? ? ?s ?aD×F s0?a ? ?μré ? ??B??a A$×F ê ?a (? ?$ ?μ? ? ?¥ ` )8 R ì?9 ^?? ?7 !9¥ ` )8hy DNA ` )8hy v?? )¥ λ ` )8 DNA v?? )¥ ` )8 λ-DNA# ×Fs0¥s ?B? # ×Fs0¥s ?B? |v?? )cμ ?è¥ ?!? ?!à ? 3é ù |v?? )cμ ?è¥ ?!? ?!à ? 3é ù F ? λ ` )8×F λ ` )8¥??A 37¥ ?! 1l H F ? ` )8×F ` )8¥??A ¥ ?! l H ¨?7 ?! d?? ?! 4 -12l Hb? H ` )8 R ì ¨?7 ?! d?? ?! l Hb? H ` )8 R ì áXr 10 13 -10 14 / Lv?? )%X? ? 3 áXr v?? )%X? ? 3 ? ? ???? ` )8 ? ? ???? ` )8 &p4 db λ-DNA &p4 db Y?sd??? λ-DNA Y?sd??? ` )8hy DNA ` )8hy v?? )¥ λ ` )8 DNA v?? )¥ ` )8 λ-DNAT18¥a? T18¥a? λ-DNA V8? ? ` )8 R ì ?úr ?v?? ) V8? ? ` )8 R ì ?úr ?v?? ) λ-DNA8¥  ? ?1 25 kbùùv?é ì¥   8¥  ? ?1 ùùv?é ì¥   ×F λ-DNAs0¥ ?ê?1ZL ×F s0¥ ?ê?1ZL ×F λ-DNAs0¥4 |?1eL ×F s0¥4 |?1eL λ-DNA8 a? X H? ?9?÷ DNA ? ?? a?Vr 8 a? X H? ?9?÷ ? ?? a?Vr ?÷y ?÷y ` )8hy DNA ` )8hy v?? )¥ M13? y ` )8 DNA v?? )¥ ? y ` )8 M13 ` )8¥ 3tD+? 3t2 ` )8¥ 3tD+? 3t2 M13 ` )8¥??? ′ ` )8¥??? ′ M13 ` )8?? T ?a?? y DNAF? ` )8?? T ?a?? y F? M13 DNA ?é 6407?? ? ?é ?? ? M13 DNA à μ 10?y à μ ?y 2700?? T?as0 ?? T?as0 M13 ` )8? 3 ó?%?]?  3é ` )8? 3 ó?%?]?  3é ` )8hy DNA ` )8hy v?? )¥ M13? y ` )8 DNA v?? )¥ ? y ` )8 M13 ` )8¥ 3tD+?? ?? ù ` )8¥ 3tD+? ? ?? ù + DNA  + DNA   RFDNARFDNA RFDNA- DNA II II V ` )8hy DNA ` )8hy v?? )¥ M13? y ` )8 DNA v?? )¥ ? y ` )8 M13 DNA8¥y 8¥y III VI I IV II X V VII IX VIII 7 3? M13RF-DNA 7 3? III VI I IV II X V VII IX VIII II X M13mp" 8 " 8 lacZ‘polylinker ` )8hy DNA ` )8hy v?? )¥ M13? y ` )8 DNA v?? )¥ ? y ` )8 M13 DNA8¥+? 8¥+? P X H¥ DNA ? [+?? y¥? T { s8%? P X H¥ ? [+?? y¥? T { s8%? ? DNA?_lM?dèμ¨ ? ?_lM?dèμ¨ M13×Fs0 ?êeL ×Fs0 ?êeL $ M13 ` )8? ?¥ s8% 3é? ¤?? $ ` )8? ?¥ s8% 3é? ¤?? $ê^?O aGêb7 O×Fs0v$ $ê^?O aGêb7 O×Fs0v$ ê¥$gv ê¥$gv ? M13-DNA8¥Kv ?J ^  loμ 1.5 kb ? 8¥Kv ?J ^  loμ ` )8hy DNA ` )8hy D?±t s8%M a?¥8B?ê4M??±t¥h D?±t s8%M a?¥8B?ê4M??±t¥h yyF DNAb yyF ?±thy? ?N ?B??±t?μ?+s?¥h ?±thy? ?N ?B??±t?μ?+s?¥h yb?vyF¥2 V|?±thys? 1v ? yb?vyF¥2 V|?±thys? 1v ? ? y DNAhy ? y hy ? y DNAhy ? y hy ? y RNAhy ? y hy ? y RNAhy ? y hy RNAhy1áˉ? HviM?¥ DNA?WQ?t hy1áˉ? HviM?¥ ?WQ?t ?t?W8 VT18é?è?¥ DNA×Fb ?t?W8 VT18é?è?¥ ×Fb I ?é ìD ` ) ì I ?é ìD ` ) ì λ-DNA8? M13-DNA8¥  KvsY1 25 kb? 8? 8¥  KvsY1 ? 1.5 kb?? f ?/aa31 X H÷v¥?÷ DNA ?  ?? f ?/aa31 X H÷v¥?÷ ?  I ?é ì? ` ) ì8¥yü ^1 éB?4ú ` )8 DNA I ?é ì? ` ) ì8¥yü ^1 éB?4ú ` )8 ¥  b  K%?¥Hq/v? ê ` )8 DNA¥é  K%?¥Hq/v? ê ` )8 ¥é ü ?]?9F8¥  ? ?b| ` )8 DNAD μ1¥? ü ?]?9F8¥  ? ?b| ` )8 D μ1¥? Dé ìF B ; ?KvK1 ê 8¥é] H Dé ìF B ; ?KvK1 ê 8¥é] H ? ? £×F DNAs08? ˉ$ ?μ? ? ?¥ R ì? ? ? £×F s08? ˉ$ ?μ? ? ?¥ R ì? L ^y I ?é ì? ` ) ì8¥ ± ^b? ??? I ?é ì L ^y I ?é ì? ` ) ì8¥ ± ^b? ??? I ?é ì ? ` ) ì?z{ ?ayyN×F DNAs0% = ? ` ) ì?z{ ?ayyN×F s0% = ? ??? ` )8 R ìb ? ??? ` )8 R ìb I ?é ìD ` ) ì I ?é ìD ` ) ì I ?é ì cosmid I ?é ì I ?é ì8¥y I ?é ì8¥y I ?é ì ^B ? |yy¥cμ I ?é ì ^B ? |yy¥cμ 1978 M Collins? Hohn? üy M ? ? üy pHC79 6400 bp Tc r r λ fragment fragment cos ori Ap r r PstI BamHI SalI λ-DNA cos? ?é ìˉ?0¥ ? ?é ìˉ?0¥ + y ??¥8 + y ??¥8 cos site - carrying plasmid 1.8 kb¥λ-DNA ? + pBR322 ? ? ?  S?1 31 - 45 kb  S?1 I ?é ìD ` ) ì I ?é ìD ` ) ì I ?é ì cosmid I ?é ì I ?é ì8¥+? I ?é ì8¥+? ?^ λ-DNA *"é?8? iúr ? s8% ?^ *"é?8? iúr ? s8%   v 45 kb O X H ? μB?¥vlS?   v  O X H ? μB?¥vlS? ?^é ì *" s8%?1?ˉ? ?^é ì *" s8%?1?ˉ? ×F?TeL ?ê ?^ ×F?TeL ?ê ?^ ? ?8 = ? 3 s8% ? ?8 = ? 3 s8% I ?é ìD ` ) ì I ?é ìD ` ) ì ` ) ì phagemid or phasmid ` ) ì ` ) ì8¥+? ` ) ì8¥+? ` ) ì ^B ? |yy¥cμ? y ` )8 ? aˉ?0 ` ) ì ^B ? |yy¥cμ? y ` )8 ? aˉ?0 [#é ìˉ?0a X Hê?aS:y¥+ y ??¥8 [#é ìˉ?0a X Hê?aS:y¥+ y ??¥8 ?^ M13-DNA *"8? iúr ? s8% ?^ *"8? iúr ? s8%   1è?¥ M13mp" 1v? 10 kb   1è?¥ " 1v? ?^é ì *" s8%?1?ˉ? ?^é ì *" s8%?1?ˉ? ×F?TeL ?ê ?^ ×F?TeL ?ê ?^ YV X H ? y DNA ?¤]?é¥?B? y DNA YV X H ? y ?¤]?é¥?B? y I ?é ìD ` ) ì I ?é ìD ` ) ì ` ) ì phagemid or phasmid ` ) ì ×1¥ ` ) ì8 pUC118 / 119 ×1¥ ` ) ì8 pUC118 pUC18 + M13W? u IG pUC118 pUC18 M13W? u pUC119 pUC19 + M13W? u IG pUC119 pUC19 M13W? u 500 ? J ? J 3200 bp MCS lacZ’ ’ lacI ori Ap r r M13-MG pUC118 / 119 V U M13£ù ` )8 DNA V U £ù ` )8 I ?é ìD ` ) ì I ?é ìD ` ) ì ` ) ì phagemid or phasmid ` ) ì ×1¥ ` ) ì8 pBluescript 8? c8 ×1¥ ` ) ì8 8? c8 pBluescript = pUC + f1-ori + P T3 + P T7 2958 bp MCS lacZ’ ’ P T7 ori Ap r r f1-ori pBluescript P T3 ` )8 ?0 P T3 ? P T7 <?? ` )8 ?0 ? <?? ÷y¥ c ÷y¥ c 4 | ?¥? y DNA×Fs0 4 | ?¥? y ×Fs0  ` )8 RNA ? ?¥i  ` )8 ? ?¥i /? V LC?÷y /? V LC?÷y ¥8? c |/ ? ?88 |/ ? ?88 | ?a?ta±t¥ ?yF? saa31 X H ?? | ?a?ta±t¥ ?yF? saa31 X H ?? .à  $ kb ¥DNA ? N H I ?é ì? ` ) ì8¥  .à  $ ? N H I ?é ì? ` ) ì8¥  9ùù? ? ?@31b 9ùù? ? ?@31b |% )¤?y0?  ) ? ?8 ¥ˉ? uas ¥ ua× |% )¤?y0?  ) ? ?8 ¥ˉ? uas ¥ ua× ? uDé ìF B ' V? ? ?88b?v ? ¥? ? uDé ìF B ' V? ? ?88b?v ? ¥? ÷ DNA X H?t ? ?88 aL??×F |/ ? ?8 ÷ X H?t ? ?88 aL??×F |/ ? ?8 ? ?^? ? ? ?8 *" s8%?×?¥ˉ?iL.b ? ?^? ? ? ?8 *" s8%?×?¥ˉ?iL.b " -訥 |/ ? ?88 ? " -訥 |/ ? ?88 ? % ) |/ ? ?8 BAC % ) |/ ? ?8 ?  |/ ? ?8 YAC ?  |/ ? ?8 |/ ? ?88 |/ ? ?88 % ) |/ ? ?8 Bacterial Artificial Chromosomes BAC % ) |/ ? ?8 % ) |/ ? ?8Yè ^v?? )?y0 Fé ì¥$  % ) |/ ? ?8Yè ^v?? )?y0 é ì¥$  y¥   S? 50 - 300 kb-W y¥   S? kb-W ò? ??¥ pBACsv?? ) s8 )o ????B J ò? ??¥ v?? ) s8 )o ????B J pBACs?1 a¨? ?1 a¨? X Hv?y[ gene cluster2 X Hv?y[ 2 y?±tyó o y?±tyó o |/ ? ?88 |/ ? ?88 ?  |/ ? ?8 Yeast Artificial Chromosomes YAC ?  |/ ? ?8 YAC8?cμ/ íq 8?cμ/ íq ?  ? ?8¥ ì?  ?  ? ?8¥ ì?  ?  |/ ? ?8¥y ?  |/ ? ?8¥y pYAC4 CEN4 EcoRI URA3 TEL BamHI TEL ori Ap r r TRP1 ARS1 ?  ? ?8¥ˉ?0 ?  ? ?8¥ˉ?0 ?  ? ?8¥?? ì?  ?  ? ?8¥?? ì?  ? "d¥ê4S: ? "d¥ê4S: v?? )¥ˉ?0 v?? )¥ˉ?0 v?? )¥ê4S: v?? )¥ê4S: YAC8¥  1 350 - 400 kb |/ ? ?88 |/ ? ?88 ?  |/ ? ?8 Yeast Artificial Chromosomes YAC ?  |/ ? ?8 ?  |/ ? ?8¥ P¨ ?  |/ ? ?8¥ P¨ pYAC4 CEN EcoRI URA TEL BamHI I TEL ori Ap r r TRP ARS EcoRIEcoRI EcoRI BamHI ?¤ ?¤ ??  ) ??  ) ×F?  ? ?8 ×F?  ? ?8 C ¨?yM¥ s8 )% ¨?yM¥ s8 )% 3 ×F DNA/ ? ?3¥'Hq ×F / ? ?3¥'Hq ò?yy? s8¥+? ò?yy? s8¥+? L i訥yy? s8 L i訥yy? s8 s8%? !¥Hq s8%? !¥Hq s8%? !¥Hq s8%? !¥Hq K?? ?J? K?? ?J? ? M ?? = M ?? ?J recB -  recC -  hsdR -  ? M ?? = M ?? ?J   ×F?? ?J? ×F?? ?J? ¨?y ?9úrVr¥ s8% recA -  ¨?y ?9úrVr¥ s8% μ?ú¥?r q μ?ú¥?r q μD8ê4S:o?¥V? μD8ê4S:o?¥V? ? ?7 3 ?J? ? ?7 3 ?J? ]?×F% ) ? ?ê ? 3tó "? ]?×F% ) ? ?ê ? 3tó "? ò?yy? s8¥+? ò?yy? s8¥+? v?? ) v?? ) L.? b#8 s8"d?! 3éá ? ?!e ?×F0×? L.? b#8 s8"d?! 3éá ? ?!e ?×F0×? a¨??÷ DNA¥ ?9? X Hae? 3ty¥úrV rayó o¥y ^ DNA×F L?yy?¥?1 s 8 ) a¨??÷ ¥ ?9? X Hae? 3ty¥úrV rayó o¥y ^ ×F L?yy?¥?1 s 8 ) á2ˉa? ?N¥ =y í á2ˉa? ?N¥ =y í ò?yy? s8¥+? ò?yy? s8¥+? j¤? ) j¤? ) L.? b#?aés ??r ? 3éá ? ? !e??á =y í L.? b#?aés ??r ? 3éá ? ? !e??á =y í a¨?e? 3ty¥ X HaVr[#×F?at¥ μrs ? a¨?e? 3ty¥ X HaVr[#×F?at¥ μrs ? L. 4×?8 s8"d 4?! L. 4×?8 s8"d 4?! ò?yy? s8¥+? ò?yy? s8¥+? y ? ) y ? ) F 3 í¥?1 3á?s0L.M?TeL?á =y í F 3 í¥?1 3á?s0L.M?TeL?á =y í ?1¨? F 3 í 3á )é¥?  ?1¨? F 3 í 3á )é¥?  L.?×? 3éM? ¤ L.?×? 3éM? ¤ ò?yy? s8¥+? ò?yy? s8¥+? ?  ) ?  ) μ?? 3t¥+?L.? b# 3éá ? ?! e??÷yVr"d? ?L.×? μ?? 3t¥+?L.? b# 3éá ? ?! e??÷yVr"d? ?L.×? a¨??÷ DNA¥ ?9a X H[#?? 3ty¥úr Vrayó o¥ya?? 3tyVr? e¥ù? ^ DNA×F L?yy?×1¥??? s8 ) a¨??÷ ¥ ?9a X H[#?? 3ty¥úr Vrayó o¥ya?? 3tyVr? e¥ù? ^ ×F L?yy?×1¥??? s8 ) =÷??aát? ?N Oc ú =÷??aát? ?N Oc ú ò?yy? s8¥+? ò?yy? s8¥+? ? % E? ? % E? μ?? 3t¥+??÷yVr úN2M? y ?!?'? ÷L.×? μ?? 3t¥+??÷yVr úN2M? y ?!?'? ÷L.×? a¨??? 3ty¥úrVr a¨??? 3ty¥úrVr DNA×F?T"d 4? ? ×F?T"d 4? ? ò?yy? s8¥+? ò?yy? s8¥+?  ??t% ?S? ? x×% CHO  ??t% ?S? ? x×% D |¥ T?1"ís0×FVr"dr ? μ? a ¥?? e"d D |¥ T?1"ís0×FVr"dr ? μ? a ¥?? e"d a¨? ? ??t? |¥yVr? eù?ay0t ¥ 3á ^ DNA×F L?yy?¥?1 ??t s8 a¨? ? ??t? |¥yVr? eù?ay0t ¥ 3á ^ ×F L?yy?¥?1 ??t s8 % ?!Hq N Y 3é? ¤ % ?!Hq N Y 3é? ¤ ò?yy? s8¥+? ò?yy? s8¥+? ±t% E 2·?a?= ±t% E 2·?a?= jTt¥ü6il×vy±t%^?s?%  ?!e? O?'? ÷ μ;?T¨ jTt¥ü6il×vy±t%^?s?%  ?!e? O?'? ÷ μ;?T¨ a¨?ú?±tyVr? e¥ù?ay0t¥ 3á jTt ?é¥?  a¨?ú?±tyVr? e¥ù?ay0t¥ 3á jTt ?é¥?  L.?TN ? L.?TN ? L i訥yy? s8 L i訥yy? s8 v?? ) v?? ) ¨?¤ sé ì C600aW3110aHB101aJM83a JM101 Ap s aTc s aCm s  ¨?¤ s λ-DNA LE392aED8654 ¨?¤ sé ì   ¨?¤ s  ?  ) ?  )  ??t% CHO  ??t% 8?  8?  à??  à??