第六章 病毒与原核生
物的遗传学分析
优点:
?生活周期短
?单倍体,无显隐性关系
?研究方法简单
?灵敏度高
第一节 噬菌体(病毒)的遗传学分析
一、噬菌体的基本特征
?温和噬菌体
?烈性噬菌体
二、噬菌体杂交与基因定位
噬菌体的杂交方法:混合感染(复感染、双重感染)
重组合
重组频率 = x 100% 重组合 +亲组合
例,1955年 Kaiser 的 λ噬菌体实验
+ + + x s mi co1 杂交
s:小噬菌斑,mi:微小噬菌斑,co1:中央浑浊
小点的噬菌斑。
类型 数目 合计 百分比 s-co1 co1-mi s-mi
+ + +
s co1 mi
975
724
1899 90.8
s + +
+ co1 mi
30
32
62 2.9 √ √
s co1 +
+ + mi
61
51
112 5.3 √ √
s + mi
+ co1 +
5
13
18 0.86 √ √
合计 2091 3.76 6.16 8.2
作图:
3.76 6.16s co1 mi
8.2 + 2 x 0.86=9.92
第二节 细菌杂交与基因定位
一,E,coli 的性因子
1,F因子(性因子、致育因子):
1946年 J,Lederberg 在大肠杆菌中有杂交现象,并
进一步发现了性因子 F。
F因子共有 15个基因,3,5 x 106道尔顿,
6 x 104bp
F+:含有 F因子的细胞(菌株),具有性伞毛(接
合管)
F-:不含 F因子的细胞(菌株)
2,F’因子与性导
附加体,具能游离于染色体外而独立存在,又可重
组于染色体上的遗传因子称为附加体。 F因子是一
种附加体。
当 F因子从染色体上切离时,可能发生不准确切离
而带有宿主的部分基因,这种游离的 F因子称为 F’
因子。 F’因子的转移可以导致 F’因子上宿主基因的
转移。
3,Hfr菌株
当 F因子重组在宿主细胞染色体上时,F因子仍然
可以发生转移,此时的转移可推动宿主基因的转移,
因此这种菌株称为高频重组菌株( high frequence
of recombination,Hfr)
F因子 推动 染色体的转移是以 F因子的一端开始,
沿 F因子所处位置的相反方向进行转移,F因子最
后才转移。所以染色体在 F因子的推动下发生的转
移具有一定的方向和顺序。
二、中断杂交与基因定位
1954年利用 Hfr菌株的染色体转移特征(方向性和
顺序性),进行了 E.coli染色体的基因定位。
Hfr,thr+ leu+ Azs T1s lac+ gal+ strs(供体)
F-,thr- leu- Azr T1r lac- gal- strr (受体)
让两种细胞混合,37℃ 水浴一定时间后取样,组织
捣碎机中断杂交,而后涂布在含 Str的基本培养基
上,考察供体基因在受体细胞出现的时间及顺序
(基因转移的时间及顺序)。
概念,选择性标记与反选择性标记
8 8.5 9 11 18 25
thr leu Az T1 lac gal
三、非中断杂交与基因定位(重组作图)
利用 F因子可以推动染色体到受体细胞中的特
点,将要考察的基因全部转移到受体细胞中,然后
考察各种基因型出现的频率,根据重组值计算公式
计算重组值,进行作图。
为保证要考察的基因全部转移到受体细胞中,选择
性标记必需处于转移的末断。
细菌基因重组的特征,与真核生物相比,原核生物
的基因重组有两个特征,一是必需发生偶数次交换,
细菌细胞才可存活;二是由于染色体不完整或选择
培养的关系,野生的重组子才可存活,所以相反的
重组子不出现。
四,E.coli的染色体图
E.coli的基因定位主要以中断杂交的方法进行
的,所以 E.coli的染色体图是以分钟作单位的。
第三节 细菌转化与基因定位
一、细菌的遗传转化
1928年 Griffith发现肺炎双球菌的转化现象。 1944年
Avery证实转化因子是 DNA。
?转化 ( transformation):外源 DNA通过细胞吸收过
程进入细胞,并使其发生遗传改变的过程。
?感受态 ( competence):细胞具有吸收外源 DNA能
力的生理状态。
有些细菌在生长过程中会自发地产生感受态,如肺
炎双球菌,枯草杆菌等;有些细菌不会自发地产生
感受态,必需经特殊处理才可产生感受态,如大肠
杆菌。
1928年
Griffith 的
实验
遗传转化的机理
二、基因定位
遗传转化的转化因子一般在 10000~20000bp之
间,因此当两个基因连锁(注意:这里的连锁与真
核生物的连锁不完全一样),他们被同时转化(共
转化)的频率要远高于不连锁的基因。利用共转化
的特点,可以对连锁的基因进行基因定位。
例,Nester利用枯草杆菌 trp2+ his2+ tyr1+ DNA为供体,
对 trp2- his2- tyr1- 进行转化。
第三节 细菌转导与基因定位
1952年,Lederberg & Zinder在进行
U型管实验时发现。
转导 ( transduction):利用噬菌体(病毒)
为媒介,将一个细胞(供体)的遗传物
质转移到另一个细胞(受体)中去的过
程。
一、一般性(普遍性)转导
指供体细胞所有基因具有同等机会被进行转导的过
程。
通常能够进行普遍性转导的噬菌体是烈性噬菌
体,他们感染细菌细胞后,在细胞内复制,最后导
致细胞裂解。在裂解过程中,供体细胞DNA降解。
噬菌体包装时可能以很低的频率发生错误而将供体
细胞DNA误为噬菌体自身DNA进行包装。当这
个噬菌体感染另一个细胞(受体),从而将供体D
NA转移到受体细胞中,完成转导过程。
利用转导现象可以进行基因定位。
噬菌体包装供体DNA时,要求DNA片段的大小
必须与噬菌体DNA大小相当,才可进行包装。因
此当两个基因连锁时,这两个基因被同时转导(共
转导、并发转导)的可能性比不连锁基因大得多。
因此利用共转导频率的大小可以进行基因定位。
x=(1-d/L)3 或 d=L(1-3√ x )
x,两基因的共转导频率; d,两基因间的
物理距离,单位与L相同。
L,转导DNA的平均长度,即转导噬菌体D
NA大小。
例,转导噬菌体 P1,基因组大小为80 kb。
供体,E,coli supC+ trpA+ pyrF+
受体,E.coli supC- trpA- pyrF-
以 supC为选择性标记
结果,1.supC+ trpA+ pyrF+ 36
2.supC+ trpA+ pyrF- 114
3.supC+ trpA- pyrF+ 0
4.supC+ trpA- pyrF- 453
顺序:根据 3知3基因的顺序为 supC trpA pyrF
距离, supC- trpA共转导类型是1和2,频率是0,
25,距离为29,6kb。
supC- pyrF共转导类型是1和 3,频率是0,
06,距离为48,7kb。
根据 E,coli染色体全长3,0 x 10 6 bp推算,
每分钟DNA长度约30 kb。因此上述距离分别为
1分钟和1,6分钟。
supC 1.0 trpA 0.6 pyrF
二、局限性(特异性、特殊性)转导
指转导噬菌体几乎只转导特定的少数几个基因的现
象。
局限性转导一般由温和噬菌体介导。如 λ噬菌体只
转导 gal基因及 bio基因。
局限性转导的频率较高,可达10 -3,而普遍性转
导的频率一般为10 -5~ 10-7