第十章 干扰素
第一节 干扰素基因及其编码的蛋白质
一,I型干扰素基因和蛋白产物
二,II型干扰素基因和蛋白产物
第二节 干扰素的诱导合成
一,I型干扰素的合成
二,II干扰素的合成
第三节 干扰素受体及信号传递途径
一、干扰素受体
二、干扰素的信号传递途径
第四节 干扰素诱导的抗病毒作用
一,2-5( A)合成酶和 RNaseL途径
二,dsRNA依赖性蛋白激酶途径
三,Mx蛋白的抗抗病毒机制
四、其他干扰素诱导蛋白的抗病毒作用
第五节 病毒抗干扰素作用的对策
第十一章 噬菌体分子生物学
第一节 噬菌体的结构组成
一、有尾噬菌体的结构
(一)壳体组成
1.头部 2.尾部
(二)有尾噬菌体的核心
1.T偶数噬菌体核心
2,λ 噬菌体核心
3.其他有尾噬菌体的核心
二、球部噬菌体的结构
(一)壳体结构
(二)球形噬菌体的核心
三、丝状噬菌体的结构
第二节 噬菌体基因组的结构
一,DNA噬菌体基因组
(一) dsDNA噬菌体基因组
1.Λ噬菌体基因组的结构
2.T4噬菌体基因组的结构
(二) ssDNA噬菌体基因组
1,φ X 174噬菌体基因组的结构
2.M13噬菌体基因组的结构
二,RNA噬菌体基因组
第三节 噬菌体基因组的复制
一,DNA噬菌体基因组的复制
(一) dsDNA噬菌体基因组的复制
1,λ 噬菌体 DNA复制
2.T7噬菌体 DNA复制
( 二) ssDNA噬菌体基因组的复制
1.以亲代环状 +ssDNA分子为膜板合成互补的负链
2.子代 +ssDNA的合成
二,RNA噬菌体基因组的复制
第四节 噬菌体基因组转录与翻译的调控
一、噬菌体基因组转录的调控
1,λ 噬菌体的转录的调控
2.T7噬菌体的转录调控
3.其他噬菌体的转录调控
二、噬菌体翻译的调控
1.反义 RNA在 λ 噬菌体基因 Q翻译中的调控作用
2.R17噬菌体 RNA二级结构对翻译的调节
第五节 噬菌体溶原性感染
一、噬菌体溶原化状态的建立
二、噬菌体基因组的整合
三、原噬菌体的割离
四、转导
1.普遍性转导
2.局限性转导
第六节 基因克隆的噬菌体载体
一,λ 载体
(一)酶切位点的去除与再建
1.EcoR I位点的去除 2,λ 同类噬菌体的重组 3.酶切位点的再建
(二)遗传标记与 λ 载体的重组
(三) Spi重组体的筛选
(四) chi位点的引入
(五)表达载体的构建
二、粘粒载体
三,M13载体
第十二章 动物病毒分子生物学
第一节 动物 dsDNA病毒
一、嗜肝 DNA病毒科
(一)病毒粒子的结构
(二)病毒基因组及其编码蛋白
(三)病毒的复制与转录
(四)病毒粒子的组装与释放
1.20nm空心颗粒的组装
2.Dane 颗粒的组装与释放
(五)嗜肝 DNA病毒与肝细胞癌
二、痘病毒科
(一)病毒粒子的结构及其化学组成
(二)病毒基因组极其编码蛋白
(三)病毒粒子所包含的多肽和酶
(四)病毒的侵入与脱壳
1.病毒的侵入 2.病毒粒子的脱壳
(五)病毒的基因表达
1.早期转录 2.中期转录 3.晚期转录
(六)病毒粒子的组装与释放
(七)痘苗病毒作为外源基因表达的载体
第二节 动物 ssDNA病毒
一、细小病毒基因组及其编码产物
二、细小病毒的复制与转录
(一)自主细小病毒
(二)依赖细小病毒
三,AAV作为基因克隆的载体
四,AAV与抑癌作用
第三节 动物 dsRNA病毒
一、呼肠孤病毒粒子的结构
二、呼肠孤病毒的基因组
三、呼肠孤病毒编码的蛋白质及其功能
(一)病毒结构蛋白
(二)病毒非结构蛋白
四、呼肠孤病毒的复制
(一)病毒的侵入
(二)病毒的转录与复制
(三)病毒粒子的组装与释放
第四节 动物 -ssRNA病毒
一、正粘病毒科
(一)流感病毒粒子的结构
(二)流感病毒的基因组及其编码蛋白
1.P基因与 P蛋白
2.NP基因与 NP蛋白
3.HA 基因和 HA蛋白
4.NA基因与 NA蛋白
5.RNA7基因及其编码产物
6.RNA 8基因与 NS1,NS2蛋白
(三)流感病毒复制与基因表达的调控
1.流感病毒粒子的侵入与脱壳
2.流感病毒的 mRNA转录
3.流感病毒基因组的复制
4.流感病毒基因表达的调控
(四)流感病毒粒子的组装与释放
二、副粘病毒科
(一)副粘病毒粒子的结构
(二)副粘病毒基因组及其编码产物
1.NP蛋白 2.P蛋白 3.C蛋白 4.V蛋白
5.L蛋白 6.M蛋白 7.病毒包膜糖蛋白
8.肺病毒的 NS1和 NS2蛋白
(三)副粘病毒基因组的转录与复制
三、弹状病毒科
(一)弹状病毒粒子的结构
1.病毒包膜 2.核衣壳
(二)弹状病毒基因组的结构
(三)弹状病毒的转录与复制
1.病毒吸附、侵入和脱壳
2.病毒基因组转录
3.病毒基因组复制
4.病毒粒子的组装与出芽
四、布尼亚病毒科
(一)布尼亚病毒粒子的结构
(二)布尼亚病毒的基因组及其编码蛋白
1.S RNA节段的编码产物
2,M RNA节段的编码产物
3,L RNA节段的编码产物
(三)布尼亚病毒的转录与复制
1.布尼亚病毒的转录
2.布尼亚病毒的基因组复制
五、沙粒病毒科
(一)沙粒病毒粒子的结构
(二)沙粒病毒的基因组及其编码蛋白
(三)沙粒病毒的转录与复制
(四)沙粒病毒的 DI颗粒和 DIRNA
第五节 动物 +ssRNA病毒
一、小 RNA病毒科
(一)小 RNA病毒粒子的结构
(二)小 RNA病毒的基因组
(三)小 RNA病毒的复制机制
1.小 RNA病毒的基本复制周期
2.小 RNA病毒的吸附、侵入和脱壳的机制
3.多蛋白的合成与切割
4.小 RNA病毒基因组复制
(四)小 RNA病毒粒子的形态发生
二、冠状病毒科
(一)冠状病毒粒子的结构与结构蛋白
图 1-1冠状病毒粒子的结构模式图(动物病毒学殷震) Fig.1-
1.Model of Coronavirus Particle
(二)冠状病毒基因组结构
图 1-2,冠状病毒基因组示意图(分子病毒学徐耀先)
Fig.1-2,Model of Coronavirus Genome
(三)冠状病毒的复制机制
1.冠状病毒的感染
2.冠状病毒的转录与复制
3.冠状病毒 mRNA的表达
4.冠状病毒结构蛋白的翻译后加工
(四)冠状病毒粒子的出芽与翻译
三、披膜病毒科
(一)披膜病毒粒子的结构
(二)披膜病毒基因组的结构
图 1-4.冠状病毒的复制模式(分子病毒学徐耀先) Fig.1-4
Model of Coronavirus Replication
图 1-3 亚基因 mRNA的转录模式(分子病毒学徐耀先)
Fig.1-3 Model of subgenomic mRNA Transcription
ORF1
S
ORF3
sM M N
ORF7 UTR
Leadersequcence
Poly(A)
CUAAAC
Encodedfragmentt
+ mRNA5’
— mRNA3’
1
2 S
3
4 sM
5 M
6 N
7
图,1- 7 冠状基因组结构及表达模式图
Fig,1-7 Outline of structure and expression of
(三)披膜病毒的复制与基因表达
1.甲病毒的复制和基因表达
2.风疹病毒的复制
(四)披膜病毒的 DI颗粒
四、黄病毒科
(一)病毒粒子的结构
(二)病毒基因组的结构及其编码蛋白
(三)病毒基因组的复制
第十三章 肿瘤病毒分子生物学与癌基因
第一节 DNA肿瘤病毒
一、腺病毒
(一)腺病毒粒子的结构
(二)腺病毒的复制循环
(三)腺病毒引起细胞转化的分子机制
1.腺病毒转化作用的基因片段
2.腺病毒的转化基因 E1A和 E1B及其编码产物
3.E1A和 EIB蛋白的调节功能及其转化活性
二、多瘤病毒
(一)病毒粒子的结构
(二)病毒基因组
(三)病毒增殖性感染
1.病毒的侵入
2.早期基因表达
3.晚期基因表达
4.病毒粒子组装和宿主细胞裂解
(四)病毒基因表达的调控
1.早期基因表达调控区
2.晚期基因表达调控区
3.增强子
4.复制原点
(五) SV40与小鼠多瘤病毒的转化作用
1.病毒转化基因的发现
2.病毒转化蛋白的致癌机理
三、乳头瘤病毒
(一) HPV型别与不同类型肿瘤
1.皮肤疣与皮肤癌
2.生殖道疣和生殖道癌
3.口腔与呼吸道肿瘤
(二)乳头瘤病毒粒子结构
(三)乳头瘤病毒基因组结构
(四)乳头瘤病毒的基因表达
1.早期基因表达
2.晚期基因表达
(五)乳头瘤病毒的癌基因及其转化作用机制
四、疱疹病毒
(一)疱疹病毒粒子的结构
(二)疱疹病毒基因组结构及其功能
1.病毒基因组的异构体
2.疱疹病毒的基因组
3.病毒基因及其编码产物
( 1)立即早期基因及其蛋白产物
( 2)早期基因及其蛋白产物
( 3)晚期基因及其编码产物
( 4)病毒潜伏感染期表达的基因和蛋白产物
1) EBNA基因家族 2) LMP基因 3) EBERs基因
4.病毒基因组的调空区
(三)疱疹病毒的基因表达与基因组复制
1.病毒的基因表达
2.病毒的基因组复制
(四)疱疹病毒的细胞转化及其致癌作用
1.EBV的癌基因
2.EBV癌基因的转化作用
3.ESV与肿瘤
( 1) EBV与鼻烟癌 ( 2) EBV与 BL
( 3) EBV与其他肿瘤
第二节 RNA肿瘤病毒 —— 逆转录病毒
一,RNA肿瘤病毒的分类地位
(一) α逆转录病毒
(二) β逆转录病毒属
(三) γ逆转录病毒属
(四) δ逆转录病毒属
(五) ε逆转录病毒属
二、病毒粒子的结构
三、病毒的基因组
A型颗粒 B型颗粒 C型颗粒
(一)基因组编码区
1.Gag基因 ⒉,pol基因 3.pol基因 4.env基因
(二)基因组的末端结构
1.R序列 2.U5序列 3.PB位点 4.先导序列
5.PP序列 6.U3序列
四、病毒的结构蛋白
1.包膜蛋白
2.核心蛋白
3.酶
五、病毒的基因组复制与基因表达
(一)基因组 RNA的逆转录和原病毒 DNA合成
(二)原病毒 DNA的整合
(三)病毒基因的表达
1.病毒基因的转录
2.转录后加工
3.病毒 mRNA的翻译
六、逆转录病毒的致癌作用与癌基因
(一)病毒癌基因及其致癌机制
1.Src与 abl癌基因
2.Sis癌基因
3.erbB和 fims癌基因
4.Ras癌基因家族
5.Myc癌基因及其核癌基因
6.Mos与 raf癌基因
(二)原病毒 DNA插入和整合对细胞癌基
因的顺式激活
(三) HTLV -1调节蛋白 P40tax的反式
激活作用
第三节 人类免疫缺陷病毒的分子生物学
一,HIV基因组结构的复制性
(一)结构基因
1.Gag基因 2.pol基因 3.env基因
(二)附加基因与调节基因
1.Vif基因 2.vpr基因 3.tat基因 4.rev基因
5.Nef基因 6.vpu基因 7.vpx基因
二,HIV基因表达的调控
(一) LTR中的转录启动子
(二)增强子
(三) Tat和 Rev蛋白及其效应元件对 HIV基因表
达的影响
三,HIV感染的分子基础
(一) CD4与 HIV的嗜亲性
(二) gp120与 CD4分子在 HIV吸
附过程中的相互作用
(三) gp120的 V3环对 HIV感染的影响
四,HIV潜伏感染与激活
五,AIDS的发生机理
(一)细胞素与 AIDS
(二) T4细胞耗竭
(三)自身免疫与 B细胞激活
六、抗 HIV 治疗及其疫苗的展望
(一)阻断病毒吸附和建立感染
(二)病毒逆转录和蛋白酶活性的抑制
(三) HIV疫苗的研制
第十四章 亚病毒分子生物学
第一节 类病毒
1.马铃薯纺锤形块茎类病毒科
2.鳄梨白斑类病毒科
一、类病毒的分子结构
(一) T结构区
(二) P结构区
(三) C结构区
(四)结构区
二、类病毒的结构转换
三、类病毒的复制和剪接
第二节 卫星 RNA和卫星病毒
一、卫星 RNA和卫星病毒的分类
1.A型卫星 2.B型卫星 3.C型卫星 4.D型卫星
二、卫星 RNA和拟病毒
三、卫星病毒
第三节 朊病毒
一、朊病毒病
二、朊病毒蛋白及其结构型转变
三,PrP基因与朊病毒蛋白的合成
四、朊病毒的复制
第四节 丁型肝炎病毒
一,HDV病毒粒子的结构
二,HDV的基因组
三,HDV的转录、复制与翻译
四,HDV病毒粒子的组装和释放