Section D Bacterial structure and function
细菌的结构与功能
D1 Prokaryote taxonomy
原核生物分类学
1.Classification of prokaryotes( 原核生物的分类)
1.1 细菌分类学的主要目的是建立一个分类系统,根据细菌一般的特征,将
细菌分类至种群。分类的任务是鉴定单个细菌的种或菌株和命名。依表
型特征和大致进化规律分类也用于研究不同细菌类群问的关系。
1.2 在等级分类系统中最重要的单元称作种 (speed)。 由一个特殊微生物单
细胞繁衍而来的培养物,通常称为菌株。菌株也被用来描述一个种的亚
类群,亚类群指种内有相同特征的细菌。从林奈 (1707~1778)开始,—
直以双名法命名。即属名加种名。
1.3 双名法的学名是用拉丁词组成的,所以应用斜体字表示或在学名之下划
一横线。通常,微生物的名字已经写出全文,属名可减至一个字或几个
字,只要不与其他属混淆即可。这样,随后提到大肠杆菌只需写成
E,coli。
2.Characters used in prokaryote identification
( 原核生物鉴定用的特征)
2.1 DNA tests
比较菌株间 DNA的含量和序列是将微生物分为不同类群和确定它们间的进化
关系 (系统发育的分析 )可信度最高的方法。按惯例,测定 DNA的 G— C含量
(G+C mol %值 —— 译者注 )或菌株间 DNA同源性。最近,业已应用分析比较
保守的细胞分子中有效的 DNA序列如 16srRNA或蛋白质 如细胞色素 C,ATP
酶,对这类信息进行分析的技术称为分支分类 。
2.Characters used in prokaryote identification
( 原核生物鉴定用的特征)
? 2.2 菌落形态
? 细菌菌落的形状、质地和颜色是鉴定分类的依据。例如,金黄色
葡萄球菌 (Streptococcus aureus),所以这样命名由于菌落是黄颜
色的,aureus来自拉丁词金色的。
Shape of colonies菌落的形状
光滑型菌
落 粗糙型菌落
粘液型菌落
Texture and color of colonies菌落的质地和颜色
2.Characters used in prokaryote identification
( 原核生物鉴定用的特征)
? 2.3 细胞的形态结构和染色反应( Cell shape,structures and reaction
to stains)
2.Characters used in prokaryote identification
( 原核生物鉴定用的特征)
? Cell shape
2.Characters used in prokaryote identification
( 原核生物鉴定用的特征)
葡萄球菌 (stapylococcus) 四联球菌 (tetrad)
2.Characters used in prokaryote identification
( 原核生物鉴定用的特征)
炭疽芽胞杆菌 3-10 μ m
大 中
大肠埃希菌 2-3 μ m

布鲁菌 0.6-1.5 μ m
2.Characters used in prokaryote identification
( 原核生物鉴定用的特征)
弧菌 螺菌 螺杆菌
2.Characters used in prokaryote identification
( 原核生物鉴定用的特征)

大肠埃希菌 2-3 μ m炭疽芽胞杆菌 3-10 μ m
大? Reaction to stains ( Gram-positive or Gram-negative)
2.Characters used in prokaryote identification
( 原核生物鉴定用的特征)
? Cell structures
? spores(( 孢子)( malachite green stain孔雀绿染色)
? Unusual cell walls ( 普通细胞壁)( Ziehl-Neelsen acid-fast stain固
酸染色法)
? Capsules( 荚膜)( Indian ink stain黑墨汁染色法)
? Intracellular lipids( 细胞内的脂类) ( sudan black苏丹黑染色)
? Flagella ( 鞭毛)( flagellar stain鞭毛染色)
? Metachromatic granules ( 异染颗粒)( Albert-Leybourne stain)
2.Characters used in prokaryote identification
( 原核生物鉴定用的特征)
肉毒梭菌
破伤风梭菌
Spores
炭疽芽胞
杆菌
2.Characters used in prokaryote identification
( 原核生物鉴定用的特征)
? 2.4 Growth charateristics( 生长特征)
? Temperature
? pH
? O2
Oxygen,Aerobic (Pseudomonas,Bacillus)
No Oxygen,Anaerobic (Clostridium)
Either,Facultative Anaerobe (E,coli)
菌膜
菌沉

均匀浑浊
对照
细菌在液体培养基中的生长情况
( O2的影响)
2.Characters used in prokaryote identification
( 原核生物鉴定用的特征)
? 2.5 Biochemical tests( 生化检验)
? 利用的碳源和氮源
? 代谢的最终产物,如 3-羟基丁酮,用 V-P试验
? 细菌所产生的酶,如脱羧酶、蛋白酶和 DNA酶
? 其它的分子
? 抗体反应
VP






大肠杆菌,—
产气杆菌,+
2.Characters used in prokaryote identification
( 原核生物鉴定用的特征)
2.Characters used in prokaryote identification
( 原核生物鉴定用的特征)
H2S试验
2.Characters used in prokaryote identification
( 原核生物鉴定用的特征)
尿










2.Characters used in prokaryote identification
( 原核生物鉴定用的特征)
? Immunological tests ( 免疫学检验)
? 细胞组分如胞壁脂多糖 O-侧链的抗体或荚膜的抗体常用于区分一
个种中菌株间的差异
3.Current classification of prokaryotes
( 原核生物的现代分类)
? 3.1 原核生物的门类:
泉古细菌门
广古细菌门 真细菌
产液菌门、异细菌门、
产金色菌门、热微菌门、
蓝细菌门、绿菌门
蛋白细菌门、厚壁菌门、
螺旋体门、丝状杆菌门、
拟杆菌门、黄杆菌门
鞘氨醇杆菌门、梭杆菌门
疣微菌门
古细菌
初生古细菌门
3.Current classification of prokaryotes
( 原核生物的现代分类)
3.2 16sRNA对原核生物分类
Aquificales( 产液菌)
Thermatogales( 热胞菌)
Thermodesulfobacterium( 嗜热脱
硫细菌)
Green non-sulfur bacteria( 绿色非
硫细菌)
OP2
Deubiciccus( 奇异球菌)
Green sulfur bacteria( 绿色硫细菌)
Cyanobacteria( 蓝细菌)
Spirochetes( 螺旋体)
Bacteroides/Flavobacterium( 拟
杆菌 /黄杆菌)
Planctomyces/pirella( 浮霉状菌
/小梨型菌)
Chlamydia( 衣原体)
Nitrospira( 硝化螺菌)
Gram-positive bacteria( 革兰氏
阳性细菌)
Proteobacteria( 蛋白细菌 /紫细
菌)
产液菌 /氢杆菌
热胞菌
绿色非硫细菌
奇异球菌
螺旋体
绿色硫细菌
黄杆菌
浮霉状菌
衣原体
革兰氏阳性细菌
蓝细菌
紫色细菌
3.3 原核生物系统图:
3.Current classification of prokaryotes
( 原核生物的现代分类)
? 3.4 各类原核生物特征:
? Aquificales( 产液菌):最古老的一类微生物,包括嗜热细菌,
它们利用氢、硫代硫酸盐或者硫磺作为电子供体,放出氧气。
? Thermatogales( 热胞菌):是一类极端嗜热菌,能够在 90℃ 生
长。
? Thermodesulfobacterium( 嗜热脱硫细菌):能够在 70℃ 生长,
产生硫酸盐,具有古细菌祖先的一些特征。
? Green non-sulfur bacteria( 绿色非硫细菌):是一类嗜热、光合
作用、丝状的细菌,它们的光合作用不产生氧气。
? OP2,这是一类仅仅用 PCR鉴定的、还未培养出的细菌。
? Deubiciccus( 奇异球菌):这类细菌的细胞壁很厚,能够抵抗较
强的辐射。
3.Current classification of prokaryotes
( 原核生物的现代分类)
? Green sulfur bacteria( 绿色硫细菌):能够进行光合作用,但是
不放氧气。
? Cyanobacteria( 蓝细菌):是一类光合作用放氧的微生物,带有
气泡和一些其它的胞囊,有很厚的细胞壁,能够固定氮气,叶绿
体可能来自于这一类微生物。
? Spirochetes( 螺旋体):革兰氏染色阴性、能够运动、有一个或
者一个以上的鞭毛。一些能够引起人类的疾病,如梅毒、莱姆关
节炎。
? Bacteroides/Flavobacterium( 拟杆菌 /黄杆菌):革兰氏染色阴
性,广泛存在于动物、水和土壤中,是一类专型厌氧菌。
? Planctomyces/pirella( 浮霉状菌 /小梨型菌):细胞壁缺乏肽聚糖,
有一层又蛋白质组成的 S-层,细胞具柄,能够产生芽细胞。
3.Current classification of prokaryotes
( 原核生物的现代分类)
? Chlamydia( 衣原体):动物细胞内寄生,如导致沙眼等一系列
眼病的沙眼衣原体。
? Nitrospira( 硝化螺菌):化能自养型、能够进行硝化作用,利用
无机氮作为能源。大多数其它的硝化细菌属于蛋白细菌。
? Gram-positive bacteria( 革兰氏阳性细菌),DNA分子中的 GC含
量差别较大。这一类细菌中有许多致病菌,如葡萄球菌、链球菌,
也有在工业上应用的微生物,如乳酸杆菌,还有能够形成芽孢的
杆菌和梭菌。
? Proteobacteria( 蛋白细菌 /紫色细菌):是最大的也是最多的一
类细菌,它包含了最常见的革兰氏阴性细菌。这一类细菌可以分
为五簇,α,β,γ,δ,θ。
Section D Bacterial structure and function
细菌的结构与功能
D2 Prokaryote cell structure
原核生物细胞的结构
1.Prokaryotic cells( 原核生物的细胞)
? 1.1 Prokaryotic cells
? 荚膜
? 外膜
? 细胞壁
? 质膜
? 周质空间
? 纤毛
? 鞭毛
? 核糖体
? 拟核
? 内涵体
细胞结构图
Contribute to Virulence of bacteria by
preventing phagocytosis
Function of Capsule
1.Prokaryotic cells( 原核生物的细胞)
? 1.2 古细菌和真细菌的区别
特征 真细菌 古细菌
细胞壁 有胞壁酸 无胞壁酸
脂类 酯键相连 醚键相连
甲烷生成 没有 可能有
RNA多聚霉 一个 几个
起始 tRNA 甲酰甲硫氨酸 甲硫氨酸
核糖体 链霉素和氯霉素敏感 链霉素和氯霉素抗性
白喉毒素抗性 白喉毒素敏感
2,The cytoplasm and ribosomes ( 细胞质与核糖体)
? 2.1 细胞质:细菌的细胞质是
水、细胞功能所需的各种分
子,RNA和蛋白质的混合物。
? 2.2 核糖体:核糖体是由一个
大亚基和一个小亚基组成,
是合成蛋白质的场所。 原核
生物的核糖体与真核生物的
核糖体不同,因此有些抗生
素对人类是非常有利的。
3,Prokaryote DNA( 原核细胞的 DNA)
? 3.1 细菌的 DNA位于细胞之中,有一个染色体组成,不同的细菌之间染色体
的大小不同,DNA是换装、致密超螺旋,与组蛋白类是的蛋白质结合。
? 3.2 染色体没有核膜包围,但在显微镜中常可看到分离的核区,称为拟核。
? 3.3 某些细菌还含有染色体以外的小分子 DNA,称作质粒。质粒上的基因对
细菌的生活并非必须。
细菌染色体
质粒
4,Other internal prokaryote features
( 细菌的其它内含物)
? 4.1 细菌细胞含有的与某些特出功能相联系的结构称作内含体
( inclusion bodies)
? 异染颗粒:是一种聚 -?— 羟丁酸颗粒,能量的储藏物质。
? 脂肪滴:储藏能量。
? 气泡:在细胞内四周排列,有蛋白质构成,提供浮力,使光合细菌
飘浮水的表面。
? 间体( mesosomes),原生膜的内陷结构,它的功能与细胞分裂有
关,也可能是促进细胞壁的合成。
5,Endospores( 芽孢)
? 5.1 细菌的芽孢杆菌属和梭菌属产生的一种特化的繁殖结构,它无繁殖
功能,是一种抗逆性的休眠体。
? 5.2 芽孢对环境有惊人的抗性,如热、紫外线、化学消毒、干燥等。
? 5.3由于许多病原菌可以产生芽孢,必须设计灭菌措施以除去这种结构。
芽孢的结构图
Section D Bacterial structure and function
细菌的结构与功能
D3 Bacterial cell envelope and cell
wall synthesis
细菌的细胞膜和细胞壁的合成
1.The Gram stain( 革兰氏染色)
? 1.1 根据 1884年革兰姆发明的染色,细菌常常被分成两类:革兰
氏阳性细菌和革兰氏阴性细菌。
? 1.2 细菌对革兰是染色的不同反应的原因是他们的细胞壁由不同
的结构。
? 1.3 革兰是染色的步骤:
Gram Stain
1) Crystal violet
结晶紫
Gram Stain
2) Grams Iodine (mordant)
媒染
Gram Stain
3) Alcohol
Gram Stain
4) Safranin (Counterstain)
复染
革兰氏染色法:
革兰阳性菌
革兰阴性菌
革兰染色
两类细菌细胞壁的共同组分为肽聚糖,但各有其特殊组分。
涂片 风干 固定
结晶紫 碘液 95%乙醇 复红1min 1min 脱色媒染
Results
? Gram (+) Purple
? Gram (-) Red
? Difference - due to structure of cell wall
? Gram (+) Thick cell wall
? Gram (-) Thin cell wall,LPS,lipoprotein
革兰阳性 革兰阴性
2.Lipid bilayer( 脂双层分子)
? 2.1 原生质膜是一个半透性膜,磷脂双分子层是膜的骨架。磷脂
是由极性的头部和非极性的尾部组成,极性头部亲水,非极性尾
部疏水。
3.The plasma membrane ( 细胞膜)
? 埋藏在磷脂双分子层中的是各种功能的蛋白,如转运蛋白、能量
代谢的蛋白、对化学物质刺激能够反映的受体蛋白等。
? 完全贯穿双分子磷脂层的蛋白叫整合蛋白( integral),通过电荷
作用松散地连接在磷脂层表面的蛋白叫外周蛋白( peripheral
proteins)
? 脂类和蛋白质均在运动,而且彼此之间相互运动,所以这种膜结
构也被称为液态镶嵌模型。
4.The bacterial cell wall( 细菌的细胞壁 )
? 4.1 肽聚糖 Peptidoglycan是细菌细胞壁的物质分子,它是由糖和氨基
酸形成的。细胞壁的作用是提供刚性和强度,保护细胞在低浓度环
境中不被裂解。
? 4.2 革兰氏阳性细菌细胞壁还含有另外一种多聚体,称磷壁酸
( teichoic acid),它的功能还不太清楚,可能与细菌的姿容现象有
关。
革兰阴性菌肽聚糖 — 聚糖骨架、四肽侧链
革兰阳性菌肽聚糖 — 聚糖骨架、四肽侧链、五肽交联桥
青霉素作用点
溶菌酶作用点
N-乙酰葡糖胺
N-乙酰胞壁酸
壁磷壁酸膜磷壁酸
5.The periplasmic space( 周质空间 )
? 5.1 界于外膜和细胞质膜之间的透明空间称为周质空间( periplasmic
space)。 它是由疏松的肽聚糖网络贯穿于类似凝胶的结构。
? 5.2 周质空间含由一系列的蛋白质,如将营养物运输进入细胞的蛋白
质、蛋白水解酶、细胞防御蛋白(破坏青霉素的 ?-内酰胺酶)
6.The out membrane ( 外膜 )
? 革兰氏阴性菌的外膜由磷脂构成,但也有其它的某些独特成分。
7.Extracellular layers ( 细胞外层 )
? 7.1 细胞外层极为于细胞最外的一层结构,不同的细胞外层由不
同的称呼。
? 荚膜( capsule),由完好的组织结构,由细胞多糖组成。
? 粘液层( a slime layer),易随扩散而丢失的多糖层。
? 以上两种结构通常也称为多糖包被。
? 7.2 细胞外层有许多功能:
? 细菌表面的渗透屏障作用;
? 保护细菌免受吞噬;
? 保护细胞免受干燥损伤;
? 帮助细菌附着到物体的表面
肺炎链球菌荚膜
荚膜
Streptococcus pneumoniae
Section D Bacterial structure and function
细菌的结构与功能
D4 Bacterial movement and
chemotaxis
细菌的运动和趋化现象
1.Motility ( 细菌的运动)
? 1.1 许多细菌用特殊的结构鞭毛运动,鞭毛的着生位置和数目常是细
菌分类的依据。
? 1.2 细菌中有端生鞭毛、周生鞭毛和丛生鞭毛菌。
周毛菌
丛毛菌
单毛菌
双毛菌
?鞭毛需用电子显微镜观察,或经特殊染色法使鞭毛增粗后才能在光镜下看
到。
?Almost all Spiralbacteria are motile;About 1/2 of Bacilliare motile;Almost all
Cocciare non-motile
2.Flagella structure ( 鞭毛的结构)
? 2.1 鞭毛由鞭毛亚基组成,这些蛋白质称作鞭毛蛋白。
? 2.2 鞭毛的典型结构如图所示。
3.Flagella movement ( 鞭毛的运动)
? 鞭毛坚硬不能屈曲但能旋转,鞭毛的旋转运动很像一个马达,质
子浓度梯度在释放能量的过程中引起鞭毛的旋转。
? 鞭毛旋转的方向决定了运动的类型。逆时针旋转向前运动,顺时
针旋转翻滚转向。
4.Chemotaxis( 趋化性)
? 4.1 细菌朝向或者离开化学物质的运动称为趋化性。正趋化性是
朝着化学物质运动,负趋化性是离开化学物质运动。
? 4.2 细菌的运动分为直线和翻滚,直线运动通过鞭毛逆时针旋转
引起,翻滚运动通过鞭毛顺时针旋转引起。有趋避剂时,细菌行
翻滚运动,有吸引剂时,细菌行直线运动。
? 4.3 鞭毛的运动类型与趋避剂浓度相联系,涉及到位于周质空间
的蛋白化学感受器。
? 4.4 蛋白化学感受器通过甲基化和去甲基化作用调节鞭毛的旋转
方向。如:有吸引剂时,MCP甲基化,引起鞭毛逆时针旋转,细
菌直线运动,靠近吸附剂;有趋避剂时,MCP去甲基化,鞭毛顺
时针旋转,细菌翻滚转向,逃离趋避剂。
化学吸引剂与鞭毛旋转间的关系
CH3-
Exercise:
? 1.State the structure of bacterial cell envelope.
? 2,State the special structure of bacterial cell,
? 3,State the process of Gram stain and the reason of different
result.
? 4.Which characters of bacterial cell can they be used to identify
prokaryotic species?
? 5.Which differences are there between bacteria and archaea?