Section C Information Storage and
Transfer 信息的储存与传递
C1 Structure and
organization of DNA
DNA的结构与组装
1.DNA stucture
? 1.1 脱氧核糖核酸是所有生命细胞的遗传物质;然而有些病毒和噬菌体含
有 RNA,当作他们的遗传物质。 DNA分子的重复单位是脱氧核糖核苷酸,
它是由一个五碳脱氧核糖、磷酸基和四种碱基中的一种组成。这四种碱
基有单环的嘧啶,如胞嘧啶和胸腺嘧啶,和双环的嘌呤,如腺嘌呤和鸟
嘌呤。
N
C
N
C
C
C
N
C
N
N H 2
H
H
H H
N
C
N
C
C
C
N
C
N
H
O
NH 2
N
C
N
C
C
C
O
H
H H
H
O O
H
H N
C
N
C
C
C
O
H
C H 3
H
O
H
HH N
C
N
C
C
C
H
N H 2
( A) ( G)
( U) ( T) ( C)
1.DNA stucture
? 1.2 磷酸二酯键把核苷酸连在一起,形成 DNA分子的骨架,DNA
携带的遗传信息就是碱基的顺序。两股相反方向的反向平行链的
DNA链通过碱基之间的氢键结合形成双螺旋。碱基互补配对。
2.DNA packaging( DNA的包装)
2.1 原核细胞中的 DNA包装
一个大肠杆菌细胞的 DNA长度超过 1mm,而细胞本身是 1.7? × 0.65? 的圆筒,
因此,DNA分子通过超螺旋 ( supercoiling), 使分子形成更紧密的结构。
supercoiling
原核细胞中的染色体 -拟核( nucleoid)
2.DNA packaging( DNA的包装)
? 2.2 真核细胞中的 DNA包装
?
核小体 30nm的螺旋管
染色质纤维 中期的染色体
螺旋 螺旋
3,Chromosomes( 染色体)
? 3.1 一般情况下,细菌细胞中的染色体是环状的,而且只有一个
拷贝,所以它是单倍体( haploid,monoploid),自由分散在细
胞之中。
? 3.2 真核细胞中,大段的 DNA以一定数量的染色体形式位于细胞
核中,被核膜与细胞质分开。每个染色体都有两个拷贝,所以是
双倍体( diploid,amphiploid),整个基因组来自两个亲本。
? 3.3 真核细胞的这种结构导致了一个非常复杂的细胞分裂机制,
叫有丝分裂,保证每个后代细胞都得到每个染色体的一个拷贝。
? 3.4 真核细胞中的线粒体和叶绿体中有 DNA,这些 DNA的特点相
原核细胞。
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C2 DNA replication
DNA的复制
1.Overview( 概述)
1.1 DNA复制是碱基配对的半保留复制。
新的 DNA链是以旧链为模板合成的,
新加入的碱基与模板上的碱基互补
配对,当整个分子复制出来时,每
个新的 DNA时由原来的一个链和一个
新合成的链组成的,所以叫半保留
复制。
2.The replication bubble( 复制泡)
2.1 复制泡,DNA的合成发生在两条
母链上,复制起点只有一个,并
且双向延伸形成一个 θ状结构,
称之为复制泡。
2.2 复制叉( replication forks),环
状 DNA复制的两个位点称之为复
制叉。
3.DNA polymerase( DNA聚合酶)
3.1在细菌中,通常负责 DNA合成的酶是 DNA聚合酶 Ⅲ, DNA聚合酶 Ⅲ 的作
用就是在延伸链上的 3’ -OH端添加一个新的核苷酸,释放一个焦磷酸,使
新合成的 DNA链沿 5’ → 3’ 方向延伸。
3.2 DNA聚合酶的特性所导致的 DNA合成的特点:
DNA聚合酶不能从头起始合成 DNA,必须有一个 3’ -OH基团,因此这些酶
必须有引物才能合成 DNA。
DNA只能在一个方向上即 5’ → 3’ 方向上合成,由于 DNA双链是反向平行
的,并且在一个复制叉上同时复制,因此只有一条链的合成是连续的,另
一条链只能以小片段形式合成。
5’ 3’
3’ 5’
4.Primers( 引物)
? DNA起始合成问题可以由一种特殊的 RNA酶也叫引物酶来解决,
它可以在 DNA合成起始点产生一段与 DNA模板链配对的 RNA片段
(引物)。 RNA聚合酶不需要 3’ -OH基团来起始 RNA的合成,因
此它可以从头合成 RNA,为 DNA链合成提供必需的 3’ -OH基团。
? DNA聚合酶 Ⅰ 可以切去核苷酸, 往上加入脱氧核苷酸。
? 最后,DNA连接酶将缺口补上。
DNA聚合酶 Ⅲ
RNA引物
5’ 3’
3’ 5’
新合成的 DNA
5.Leading and lagging strands( 前导链和滞后链)
? DNA可以连续合成的链成为
前导链,另一条链成为滞后
链,滞后链上的片段称为冈
崎片段。
6.Eukaryote replication( 真核生物的复制)
真核生物复制的几个特点:
6.1 染色体上有许多复制起点;
6.2 前导链和滞后链由不同的 DNA聚合内合成。冈崎片段较原核生物小;
7.Rolling circle replication( 滚环式复制)
? 7.1 滚环式复制经常发生在病毒或者细菌细胞中质粒的复制。
? 7.2 复制机理,DNA的一条链产生缺口,提供 3’ -OH基团,在解旋酶和单
链结合蛋白作用下产生一个复制叉,接着有缺口的链被置换。脱氧核苷
酸被加入到 3’ -OH基团来产生一条前导链,被置换下来的链作为后滞链
合成模板。
5’ -P3’ -OH
制造一个缺口,
露出可加入脱氧
核糖核苷酸的 3’ -OH
新合成的 DANA
被取代的链
利用冈崎片段,可以
复制出一个互补链
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C3 RNA molecules
In the cell
细胞中的 RNA分子
1.Structure of RNA( RNA的结构)
RNA与 DNA的区别,
1.1 戊糖是核糖而不是脱氧核糖,这也是 RNA具有酶活性的原因 ;
1.2 胸腺嘧啶( T),被尿嘧啶取代( U);
1.3 RNA为单链,但是也可以形成复杂的二级结构;
1.4 稀有核苷酸如黄嘌呤核苷、加尿嘧啶核苷可以出现在转录后的 RNA;
1.5 RNA合成的底物是三磷酸核苷酸;
1.6 RNA的序列可以用 5’ → 3’ 碱基序列的形式来表示,如 ACGUCCAUG
2.RNA moleculles in the cell( 细胞中的 RNA分子)
? 有三种 RNA分子,他们分别是:
? 2.1 核糖体 RNA( rRNA),他的作用是参与蛋白质的合成,它可以协助核
糖体保持一定的结构,并发挥相应的功能。
? 2.2 转运 RNA( tRNA),蛋白质合成过程中转运氨基酸,将核酸序列转换
成相应的氨基酸序列。
? 2.3 信使 RNA( mRNA),他们又 DNA转录而来,并作为蛋白质合成的模板。
原核及真核生物 rRNA分类
生物体 核糖体亚基 沉降系数 大小
原核生物 大亚基 23S 2900
小亚基 16S,5S 1500,120
真核生物 大亚基 28S,5.8S,5S 4200,160,120
小亚基 18S 1900
3.Catalytic RNA molecules( 具催化功能的 RNA分子)
? 在 20世纪 80年代的研究中发现有些 RNA具有酶催化活性(称之为
核酶)。其中最常见的是具有自我拼接功能的内含子,它可以将
自身从转录的 RNA上切除并将相邻两个外显子拼接起来。核酶广
泛存在于许多微生物体,如原生动物、真菌的线粒体、藻类的叶
绿体及某些噬菌体中。
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C4 Transcription
转录
1.Overview( 概述)
1.1 DNA中编码一条多肽链或者一个稳定的 RNA分子的碱基序列称作一个基
因。 DNA上的基因只能通过一种信使 RNA( mRNA) 来传递信息,合成
蛋白质。 DNA mRNA Protein
1.2 RNA的合成过程称作转录。
1.3 RNA的合成与 DNA的复制相似,但是也有许多差别,主要有:
? 只有一条 DNA链能够被复制;
? RNA合成的底物是三磷酸核苷酸( NTP);
? 真核生物中一个 mRNA仅携带一个基因产物的信息;原核生物中一个 mRNA
携带多个基因的信息;
? RNA聚合酶结合在基因起始信号的特异点被称为启动子( promoter);
? RNA聚合酶不需要引物;
? 转录过程中,可以通过蛋白质因子对特定基因的转录进行调控。
2.DNA-dependent RNA polymerases( DNA依赖型 RNA聚合酶)
? 大肠杆菌有完整的 RNA聚合酶(又称全酶, holoenzyme),它包括
五个亚基,2个 α亚基,β,β’和 σ亚基。其中 σ亚基(又称 σ因子)
是与启动子结合所必需的。
? 真核生物的 RNA聚合酶需要附加的转录因子来协助 RNA的起始。
3.Stages of transcription( 转录的步骤)
? 共分为三步:
? 3.1起始阶段: