遗传评定概述
单性状育种值估计
多性状综合遗传评定
Genetic Evaluation
个体遗传评定
第三节 多性状综合遗传评定
?多性状选择概述
?综合选择指数的估计
?选择指数应用的注意事项
多性状选择概述
育种工作中，不仅希望单个性状得到改进，更
追求在 多个性状 上同时获得进展
畜禽的 育种目标 涉及多个性状：
?奶牛：产奶量、乳脂率、乳蛋白率
?猪：日增重、瘦肉率和产仔数
?蛋鸡：产蛋数和蛋重
?绵羊：剪毛量、毛长和细度
多性状选择概述
多性状选择方法
顺序选择法
独立淘汰法
综合选择法
综合选择指数
综合遗传评定
顺序选择法 （ tandem selection）
?指对育种目标中待选择的几个性状逐一进行选择
?例如奶牛的育种目标：产奶量、乳脂率、乳蛋白率
?缺点,花时太长、性状的选择 顾此失彼,已不使用
多性状选择概述
产奶量 乳脂率 乳蛋白率
2-3个世代 2-3个世代 2-3个世代
独立淘汰法 （ independent culling）
?指育种目标中包含的每个性状都有一个最低选择标
准，各性状都超过相应标准的个体留作种畜
?改进,同时考虑多个性状，优于顺序淘汰法
?缺点,选择的个体可能在 各性状上都表现平平
多性状选择概述
综合选择法 （ index selection,I ）
?根据育种目标中各性状的 遗传基础和经济重要
性,分别给予各性状一个适当的 加权系数,综
合到一个指数中，根据指数的大小进行选择
?选择效果优于独立淘汰法和顺序选择法
多性状选择概述
独立淘汰法 顺序选择法综合选择法 > >
综合选择指数的特征
?反映的个体种用价值较为全面
?不仅考虑性状的 遗传基础 和 经济重要性,
而且还考虑 性状间的遗传相关
?选择效率较高，在 BLUP之 前被广泛应用
综合选择指数
?多性状选择概述
?综合选择指数的估计
?选择指数应用的注意事项
综合选择指数的基本公式：
综合选择指数的估计
i
n
i
iT AWAI ???
I,AT,综合选择指数
Wi,第 i 个性状的经济加权值
Ai,第 i 个性状的育种值
根据各性状在 育种
和经济上 的重要性，
给予相应的 经济加
权值
I 的计算公式,
综合选择指数的估计
)( iiii
n
i
iT ppbAWAI ???? ??
矩阵形式：
)p(pb' ??I
b’,含 遗传基础 和 经济意义 的偏回归系数向量
p, 为不同来源的信息性状表型值
p
多元回归方法
：与 p对应的均数
综合选择指数的估计
综合选择指数计算的 关键步骤,
偏回归系数 b的计算
计算偏回归系数的正规方程组 （ 求极大值方法 ）
D A wVbD A wVb 1??? 则,
V,信息性状表型值之间的方差－协方差矩阵
D,被估个体 与 信息来源个体 间的 亲缘系数 对角矩阵
A,信息性状 与 目标性状 间的 遗传方差－协方 差矩阵
w,经济加权值向量
（ 6-16）
目标性状与信息性状
?目标性状, 综合育种值所包含的性状，即育种
目标中待改进的性状（如：产奶量、乳脂 量 ）
?信息性状, 育种值估计中提供信息资料的性状
（如：产奶量、乳脂 率 ）
信息性状与目标性状一般为相同性状，
也可以不同，但必须有较高的遗传相关
估计综合选择指数的 步骤：
综合选择指数的估计
D AwVb 1???
)( ppb' ??I
wADVV 1,、、)( ?
例,对某奶牛场的青年公牛进行综合选择指
数计算,目标性状 为 乳脂量 和 日增重 。
已知一公牛现有如下 信息性状 记录：
母亲乳脂量 PD1=170kg,对应均数为 140kg
父亲日增重 PS2=1180g,对应均数为 1290g
本身日增重 PE2=1350g,对应均数为 1300g
综合选择指数的估计
综合选择指数的估计
性状 w σP σA
乳脂量（ 1） 25元 25kg 12.5kg
0.10日增重（ 2） 1.3元 80g 51g
两性状的经济加权值和有关遗传参数为：
2,1Ar
两性状间的
遗传相关
解：先求矩阵, 结果如下：
综合选择指数的估计
?
?
?
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2
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2
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5.1 3 0 0515.0),(),( 22)( 2222222 ?????? APPAESES EsrAAC o vPPC o v ?
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AAC o v
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88.3175.635.0),(),( 21)( 2121 ????? AAC o vrPPC o v ED PPAED
两性状间的遗传相关
信息个体间的亲缘相关
综合选择指数的估计
于是,
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1
偏回归系数为：
综合选择指数的估计
综合选择指数为：
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1 3 0 01 3 5 0
1 2 9 01 1 8 0
1 4 01 7 0
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评价综合选择指数 准确度 的指标, 真实
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综合选择指数的估计
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2
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其中，
G,各目标性状间的遗传方差－协方差矩阵
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AAC o v
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综合选择指数的估计
本例的综合选择指数准确度为：
? ? 69.1 0 6 1 9 53.125
5175.63
75.635.123.125
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?多性状选择概述
?综合选择指数的估计
?应用选择指数法的注意事项
应用选择指数法的 前提
? 不存在系统环境效应
? 被估个体与表型观测值来源于同一总体
? 遗传参数已估计出来
选择指数应用的注意事项
满足上述条件时，估计育种值为最佳线性无
偏估计。 I 的应用受到上述条件的制约
制定选择指数的 注意事项
1) 目标性状
?要突出。 一个选择指数包括 2～ 4个最重要的性状
例如：种公猪包括达 100kg体重日龄和活体背膘
种母猪再增加总产仔数性状
?避免有高的负遗传相关性状。 必须考虑时，可合并
为一个性状，如产奶量与乳脂率合并为 4％标准奶
综合选择指数应用的注意事项
2) 信息性状
?易于度量, 日增重、活体背膘,饲料利用率
?早期性状, 头胎产奶量
育种值估计方法
选择指数法
BLUP法
MBLUP法
育种值估计
的 初级 阶段
目前 广为应用 的
育种值估计方法
未来 的育种
值估计方法
数量遗传学
分子遗传学
分子数量遗传学
单性状育种值估计
多性状综合遗传评定
Genetic Evaluation
个体遗传评定
第三节 多性状综合遗传评定
?多性状选择概述
?综合选择指数的估计
?选择指数应用的注意事项
多性状选择概述
育种工作中，不仅希望单个性状得到改进，更
追求在 多个性状 上同时获得进展
畜禽的 育种目标 涉及多个性状：
?奶牛：产奶量、乳脂率、乳蛋白率
?猪：日增重、瘦肉率和产仔数
?蛋鸡：产蛋数和蛋重
?绵羊：剪毛量、毛长和细度
多性状选择概述
多性状选择方法
顺序选择法
独立淘汰法
综合选择法
综合选择指数
综合遗传评定
顺序选择法 （ tandem selection）
?指对育种目标中待选择的几个性状逐一进行选择
?例如奶牛的育种目标：产奶量、乳脂率、乳蛋白率
?缺点,花时太长、性状的选择 顾此失彼,已不使用
多性状选择概述
产奶量 乳脂率 乳蛋白率
2-3个世代 2-3个世代 2-3个世代
独立淘汰法 （ independent culling）
?指育种目标中包含的每个性状都有一个最低选择标
准，各性状都超过相应标准的个体留作种畜
?改进,同时考虑多个性状，优于顺序淘汰法
?缺点,选择的个体可能在 各性状上都表现平平
多性状选择概述
综合选择法 （ index selection,I ）
?根据育种目标中各性状的 遗传基础和经济重要
性,分别给予各性状一个适当的 加权系数,综
合到一个指数中，根据指数的大小进行选择
?选择效果优于独立淘汰法和顺序选择法
多性状选择概述
独立淘汰法 顺序选择法综合选择法 > >
综合选择指数的特征
?反映的个体种用价值较为全面
?不仅考虑性状的 遗传基础 和 经济重要性,
而且还考虑 性状间的遗传相关
?选择效率较高，在 BLUP之 前被广泛应用
综合选择指数
?多性状选择概述
?综合选择指数的估计
?选择指数应用的注意事项
综合选择指数的基本公式：
综合选择指数的估计
i
n
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iT AWAI ???
I,AT,综合选择指数
Wi,第 i 个性状的经济加权值
Ai,第 i 个性状的育种值
根据各性状在 育种
和经济上 的重要性，
给予相应的 经济加
权值
I 的计算公式,
综合选择指数的估计
)( iiii
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矩阵形式：
)p(pb' ??I
b’,含 遗传基础 和 经济意义 的偏回归系数向量
p, 为不同来源的信息性状表型值
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多元回归方法
：与 p对应的均数
综合选择指数的估计
综合选择指数计算的 关键步骤,
偏回归系数 b的计算
计算偏回归系数的正规方程组 （ 求极大值方法 ）
D A wVbD A wVb 1??? 则,
V,信息性状表型值之间的方差－协方差矩阵
D,被估个体 与 信息来源个体 间的 亲缘系数 对角矩阵
A,信息性状 与 目标性状 间的 遗传方差－协方 差矩阵
w,经济加权值向量
（ 6-16）
目标性状与信息性状
?目标性状, 综合育种值所包含的性状，即育种
目标中待改进的性状（如：产奶量、乳脂 量 ）
?信息性状, 育种值估计中提供信息资料的性状
（如：产奶量、乳脂 率 ）
信息性状与目标性状一般为相同性状，
也可以不同，但必须有较高的遗传相关
估计综合选择指数的 步骤：
综合选择指数的估计
D AwVb 1???
)( ppb' ??I
wADVV 1,、、)( ?
例,对某奶牛场的青年公牛进行综合选择指
数计算,目标性状 为 乳脂量 和 日增重 。
已知一公牛现有如下 信息性状 记录：
母亲乳脂量 PD1=170kg,对应均数为 140kg
父亲日增重 PS2=1180g,对应均数为 1290g
本身日增重 PE2=1350g,对应均数为 1300g
综合选择指数的估计
综合选择指数的估计
性状 w σP σA
乳脂量（ 1） 25元 25kg 12.5kg
0.10日增重（ 2） 1.3元 80g 51g
两性状的经济加权值和有关遗传参数为：
2,1Ar
两性状间的
遗传相关
解：先求矩阵, 结果如下：
综合选择指数的估计
?
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两性状间的遗传相关
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偏回归系数为：
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综合选择指数为：
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其中，
G,各目标性状间的遗传方差－协方差矩阵
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综合选择指数的估计
本例的综合选择指数准确度为：
? ? 69.1 0 6 1 9 53.125
5175.63
75.635.123.125
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应用选择指数法的 前提
? 不存在系统环境效应
? 被估个体与表型观测值来源于同一总体
? 遗传参数已估计出来
选择指数应用的注意事项
满足上述条件时，估计育种值为最佳线性无
偏估计。 I 的应用受到上述条件的制约
制定选择指数的 注意事项
1) 目标性状
?要突出。 一个选择指数包括 2～ 4个最重要的性状
例如：种公猪包括达 100kg体重日龄和活体背膘
种母猪再增加总产仔数性状
?避免有高的负遗传相关性状。 必须考虑时，可合并
为一个性状，如产奶量与乳脂率合并为 4％标准奶
综合选择指数应用的注意事项
2) 信息性状
?易于度量, 日增重、活体背膘,饲料利用率
?早期性状, 头胎产奶量
育种值估计方法
选择指数法
BLUP法
MBLUP法
育种值估计
的 初级 阶段
目前 广为应用 的
育种值估计方法
未来 的育种
值估计方法
数量遗传学
分子遗传学
分子数量遗传学
