第十三章 蛋白质的生物合成
Chapter 13 Biosynthesis of Proteins
第一节 遗传密码
一、三联体密码(密码子)的概念
mRNA分子中所存储的蛋白质合成
信息,是由组成它的四种碱基( A、
G,C,U)以特定顺序排列成三
个一组的三联体代表的,即每三
个碱基代表一个氨基酸信息。
二,64种密码子
起始密码 AUG
氨基酸密码
终止密码 UAA,UAG,UGA
? 三联体密码的确定 43=64
AAA AAT AAG AAC
ATA ATT ATG ATC
AGA AGT AGG AGC ……,
? 遗传密码的破译
1968年,霍利、尼伦伯格、柯拉纳获诺贝尔奖。
三、遗传密码的基本特性
1、每个密码子三联体决定一种 AA。其方向
是 5’→3’。 eg,5’-AUG-3’。
2、简并性:密码子简并,即一种 AA有几种
不同密码子的现象。
同义密码子,即编码同一种 AA的不同密
码子。
3、无标点符号
4、不重叠性(有少数例外)
5、通用性,所有生物的几乎一样
第二节 核糖体
核糖体是蛋白质合成的部位。
主要成分 —— 蛋白质和 RNA ( rRNA是
构成核糖体的主要组成部分)。
功 能,按照 mRNA 的指令合成多肽
链。( N端向 C端合成)
mRNA
核糖体
核糖体是合成蛋白质的细胞器
原核生物(细菌、放线
菌、蓝绿藻) 70S
50S ( 5SrRNA,
3SrRNA)
30S( 16SrRNA)
A位:氨酰 -tRNA结合
部位( AA位)
P位:肽酰 -tRNA结合
部位 (肽位)
第三节 转移 RNA的功能
一、多肽合成与 tRNA的关系
tRNA分子上与蛋白质生物合成有关的位点至少有 4
个,即
① 3’一 CCAOH,是 AA接受位点;
②识别氨酰 -tRNA合成酶的位点;
③核糖体识别位点,使延长中的肽链附着于
核糖体上;
④反密码子位点。(每一个 tRNA都有一个由
3个核苷酸组成的特殊的反密码子)
tRNA反密码子与 mRNA密码子的配对特点
tRNA反密
码子可以根
据碱基配对
的原则,与
mRNA上对
应的密码子
相结合
反密码子 密码子
A U
U A,G
C G
I(出现在 5’
位)
U,C,G
G C,U
密
码
子
与
反
密
码
子
之
间
的
碱
基
对
I G C
mRNA 3’-A C G-5’ (Ala)
5’ 3’
储存在 mRNA的遗传密码称为第一套密码系统
储存在 tRNA的遗传密码称为第二套密码系统
第四节 蛋白质的生物合成
一、蛋白质合成系统的重要组分
1,mRNA的作用机制
2、核糖体的作用机制
3,tRNA的作用机制
二、蛋白质合成过程的分子机制
(一)氨基酸的活化
α— COOH被活化(酰化反应实现)
AA+ tRNA + ATP 氨基酰 - tRNA
+ AMP+PPi
E:氨基酰 - tRNA合成酶
(二)肽链的合成(以原核生物为例)
1、起始阶段:
? 在核糖体上合成多肽。
? fMet-tRNA占据了核糖体上的 P位
(此过程消耗一个 GTP),空的 A
位准备接受下一个氨酰 -tRNA。
? 起始的完成以核糖体大小亚基、
mRNA和 fMet-tRNA形成复合物作
为标志。
2、延长阶段
( 1)进位:新的氨酰 -tRNA进入 A位。消耗
一个 GTP。
( 2)转肽:形成新的肽键
P位 A位 P位 A位
CHO
NH NH2
R1CH + R2CH tRNA +?
O=C O=C
O-tRNA O-tRNA
思考:提供 — COOH的 AA在哪一位。
E,exit site
P site
A site
( 3) 脱落,空载的 tRNA从 P位上脱
落。
( 4) 移位,核糖体沿 mRNA的
5’→3’方向移动,同时,原处于 A
部位带有肽链的 tRNA随即到 P部
位,使 A位空出来。(消耗一个
GTP)
以上 4个步骤一再重复,直至肽
链增长到必需的长度
3、终止阶段
包括两个事件:
( 1)在 mRNA上识别终止密码子( UAA、
UAG,UGA);
( 2)水解所合成肽链与 tRNA间的酯键,
释放肽链。
tRNA从 P位上脱落下来,70S核糖体也
从 mRNA上脱落,解离为 30S及 50S亚基
并立即投入下一轮核糖体循环,以合成
另一新的蛋白质分子。
思考题:
合成一个五肽至少需要多少能量?
(能量供体的主要形式是 GTP)
(三)翻译后加工
肽链 ≠蛋白质(有功能的)
1,N— 末端 AA或部分肽段的切除
以原核生物为例:
fMet-xx-xx-
↓脱甲酰基酶
Met-xx-xx-
↓氨肽酶
切去一个或多个 N端 AA
2、信号肽的切除,信号肽酶
3,— S— S— 的形成
mRNA中没有( Cys) 2的密码子
4,AA的修饰:羟基化、甲基化等
eg 胶原中的羟脯氨酸(羟基化)
5、亚基之间、亚基与辅基之间的
聚合。
6,多肽链折叠成有活性的构象。
信号肽及识别信号肽的信号识别体的结构特征
? 目前通常所说的信号肽是指翻译产
物,新生肽链 N端引导新生肽链进
入内质网的肽段。
? 这种信号肽一般含有约 20个氨基酸
残基,从其结构看,中间集中了较
多的疏水性残基,两端是一些极性
的残基。
*信号肽有时也可位于多肽链的中部。
?识别信号肽的识别体,称为信号肽
识别颗粒( SRP)。它是 7SL RNA
和 6条不同分子量的肽链组成的复合
物。除了和信号肽结合外,识别颗
粒还可以和其它一些帮助新生肽穿
越内质网膜的蛋白质(或复合物)
结合,后者为停泊蛋白或核糖体受
体等。
真核生物与原核生物蛋白质合成过程的不同点
真核生物 原核生物
翻译与转录不偶联,mRNA需加
工修饰
翻译与转录偶联,mRNA无“帽”及无
“尾”结构
mRNA半寿期约 4— 6小时较稳定,
易分离
mRNA半寿期约 1-3分钟,不稳定,不
易分离
mRNA为单顺反子 mRNA为多顺反子
起始阶段需 GTP及 ATP 起始阶段需 GTP
延长阶段 GTP水解后可被 ATP再
磷酸化,两种延长因子可同时与
核蛋白体结合
GTP水解后 EFTu即从核蛋白体上脱落
只有一种终止因子 有三种终止因子
合成速度慢 合成速度快
合成可被亚胺环己酮、白喉毒素
等抑制
可被氯霉素、链霉素、四环素等抑制
真核生物蛋白质合成过程的不同点
① 起始 AA-tRNA为 Met-tRNA。
② 40S亚基首先识别 mRNA5’端,然后
移动到起始位点(原核生物起始复
合物直接在 AUG处形成)。
③小亚基不首先与 mRNA结合。
④核糖体各种因子不同于原核生物。
Chapter 13 Biosynthesis of Proteins
第一节 遗传密码
一、三联体密码(密码子)的概念
mRNA分子中所存储的蛋白质合成
信息,是由组成它的四种碱基( A、
G,C,U)以特定顺序排列成三
个一组的三联体代表的,即每三
个碱基代表一个氨基酸信息。
二,64种密码子
起始密码 AUG
氨基酸密码
终止密码 UAA,UAG,UGA
? 三联体密码的确定 43=64
AAA AAT AAG AAC
ATA ATT ATG ATC
AGA AGT AGG AGC ……,
? 遗传密码的破译
1968年,霍利、尼伦伯格、柯拉纳获诺贝尔奖。
三、遗传密码的基本特性
1、每个密码子三联体决定一种 AA。其方向
是 5’→3’。 eg,5’-AUG-3’。
2、简并性:密码子简并,即一种 AA有几种
不同密码子的现象。
同义密码子,即编码同一种 AA的不同密
码子。
3、无标点符号
4、不重叠性(有少数例外)
5、通用性,所有生物的几乎一样
第二节 核糖体
核糖体是蛋白质合成的部位。
主要成分 —— 蛋白质和 RNA ( rRNA是
构成核糖体的主要组成部分)。
功 能,按照 mRNA 的指令合成多肽
链。( N端向 C端合成)
mRNA
核糖体
核糖体是合成蛋白质的细胞器
原核生物(细菌、放线
菌、蓝绿藻) 70S
50S ( 5SrRNA,
3SrRNA)
30S( 16SrRNA)
A位:氨酰 -tRNA结合
部位( AA位)
P位:肽酰 -tRNA结合
部位 (肽位)
第三节 转移 RNA的功能
一、多肽合成与 tRNA的关系
tRNA分子上与蛋白质生物合成有关的位点至少有 4
个,即
① 3’一 CCAOH,是 AA接受位点;
②识别氨酰 -tRNA合成酶的位点;
③核糖体识别位点,使延长中的肽链附着于
核糖体上;
④反密码子位点。(每一个 tRNA都有一个由
3个核苷酸组成的特殊的反密码子)
tRNA反密码子与 mRNA密码子的配对特点
tRNA反密
码子可以根
据碱基配对
的原则,与
mRNA上对
应的密码子
相结合
反密码子 密码子
A U
U A,G
C G
I(出现在 5’
位)
U,C,G
G C,U
密
码
子
与
反
密
码
子
之
间
的
碱
基
对
I G C
mRNA 3’-A C G-5’ (Ala)
5’ 3’
储存在 mRNA的遗传密码称为第一套密码系统
储存在 tRNA的遗传密码称为第二套密码系统
第四节 蛋白质的生物合成
一、蛋白质合成系统的重要组分
1,mRNA的作用机制
2、核糖体的作用机制
3,tRNA的作用机制
二、蛋白质合成过程的分子机制
(一)氨基酸的活化
α— COOH被活化(酰化反应实现)
AA+ tRNA + ATP 氨基酰 - tRNA
+ AMP+PPi
E:氨基酰 - tRNA合成酶
(二)肽链的合成(以原核生物为例)
1、起始阶段:
? 在核糖体上合成多肽。
? fMet-tRNA占据了核糖体上的 P位
(此过程消耗一个 GTP),空的 A
位准备接受下一个氨酰 -tRNA。
? 起始的完成以核糖体大小亚基、
mRNA和 fMet-tRNA形成复合物作
为标志。
2、延长阶段
( 1)进位:新的氨酰 -tRNA进入 A位。消耗
一个 GTP。
( 2)转肽:形成新的肽键
P位 A位 P位 A位
CHO
NH NH2
R1CH + R2CH tRNA +?
O=C O=C
O-tRNA O-tRNA
思考:提供 — COOH的 AA在哪一位。
E,exit site
P site
A site
( 3) 脱落,空载的 tRNA从 P位上脱
落。
( 4) 移位,核糖体沿 mRNA的
5’→3’方向移动,同时,原处于 A
部位带有肽链的 tRNA随即到 P部
位,使 A位空出来。(消耗一个
GTP)
以上 4个步骤一再重复,直至肽
链增长到必需的长度
3、终止阶段
包括两个事件:
( 1)在 mRNA上识别终止密码子( UAA、
UAG,UGA);
( 2)水解所合成肽链与 tRNA间的酯键,
释放肽链。
tRNA从 P位上脱落下来,70S核糖体也
从 mRNA上脱落,解离为 30S及 50S亚基
并立即投入下一轮核糖体循环,以合成
另一新的蛋白质分子。
思考题:
合成一个五肽至少需要多少能量?
(能量供体的主要形式是 GTP)
(三)翻译后加工
肽链 ≠蛋白质(有功能的)
1,N— 末端 AA或部分肽段的切除
以原核生物为例:
fMet-xx-xx-
↓脱甲酰基酶
Met-xx-xx-
↓氨肽酶
切去一个或多个 N端 AA
2、信号肽的切除,信号肽酶
3,— S— S— 的形成
mRNA中没有( Cys) 2的密码子
4,AA的修饰:羟基化、甲基化等
eg 胶原中的羟脯氨酸(羟基化)
5、亚基之间、亚基与辅基之间的
聚合。
6,多肽链折叠成有活性的构象。
信号肽及识别信号肽的信号识别体的结构特征
? 目前通常所说的信号肽是指翻译产
物,新生肽链 N端引导新生肽链进
入内质网的肽段。
? 这种信号肽一般含有约 20个氨基酸
残基,从其结构看,中间集中了较
多的疏水性残基,两端是一些极性
的残基。
*信号肽有时也可位于多肽链的中部。
?识别信号肽的识别体,称为信号肽
识别颗粒( SRP)。它是 7SL RNA
和 6条不同分子量的肽链组成的复合
物。除了和信号肽结合外,识别颗
粒还可以和其它一些帮助新生肽穿
越内质网膜的蛋白质(或复合物)
结合,后者为停泊蛋白或核糖体受
体等。
真核生物与原核生物蛋白质合成过程的不同点
真核生物 原核生物
翻译与转录不偶联,mRNA需加
工修饰
翻译与转录偶联,mRNA无“帽”及无
“尾”结构
mRNA半寿期约 4— 6小时较稳定,
易分离
mRNA半寿期约 1-3分钟,不稳定,不
易分离
mRNA为单顺反子 mRNA为多顺反子
起始阶段需 GTP及 ATP 起始阶段需 GTP
延长阶段 GTP水解后可被 ATP再
磷酸化,两种延长因子可同时与
核蛋白体结合
GTP水解后 EFTu即从核蛋白体上脱落
只有一种终止因子 有三种终止因子
合成速度慢 合成速度快
合成可被亚胺环己酮、白喉毒素
等抑制
可被氯霉素、链霉素、四环素等抑制
真核生物蛋白质合成过程的不同点
① 起始 AA-tRNA为 Met-tRNA。
② 40S亚基首先识别 mRNA5’端,然后
移动到起始位点(原核生物起始复
合物直接在 AUG处形成)。
③小亚基不首先与 mRNA结合。
④核糖体各种因子不同于原核生物。