? 第一节遗传变异的物质基础
? 第二节微生物的基因组结构
? 第三节质粒和转座因子
? 第四节基因突变及诱变育种
? 第五节细菌基因转移和重组
? 第六章真核微生物的遗传学特性
? 第七章菌种的衰退、复壮与保藏
第 八章微生物遗传变异与育种
遗传与变异的概念
遗传:亲代将自身一整套遗传因子传递给下一代的行为和功
能,
变异:生物体的遗传物质结构和数量的改变,新性状稳定、可
遗传。
遗传型(genotype):一个生物体所含有的基因的总和。
表型(phenotype):一个生物体所具有的一切外表特征和内
在特性的总和。
饰变(modification):指生物体由于非遗传因素引起的表型改
变,变化发生在转录、转译水平,特点是几乎整个群体
中的每一个个体都发生同样的变化,性状变化的幅度
小,不遗传,引起饰变的因素消失后,表型即可恢复。
一、证明遗传物质的三个经典实验
1. 转化实验---遗传物质是DNA
2. 噬菌体感染实验---证明DNA是遗传物质,且其
中含有合成蛋白质的遗传信息。
3. 植物病毒重建实验---遗传物质是RNA。
第一节遗传的物质基础
1.肺炎链球菌转化实验
2. T2噬菌体感染实验(A.D.Hershey和M.Chase 1952年)
HR
蛋白质
TMV
蛋白质
HR-RNA
TMV-RNA
3.病毒重建实验(Fraenkel—Conrat1956年)
生化提取分别获得含RNA的烟草花叶病
毒(TMV)、霍氏车前花叶病毒(HR)蛋白
质外壳和核酸
抗血清处理,证明杂种病毒的蛋
白质外壳来自TMV,而非HR
杂种病毒的后代的蛋白质外壳表现
为HR,而非TMV
遗传物质是核酸(RNA)而非蛋白质
第二节微生物的基因组
一、概念
基因组(genome):
一个物种的单倍体的所有染色体及其所包含的遗传信息的总称
原核生物(如细菌),多为单倍体(在一般情况下只有一条染色体)
真核微生物,多条染色体,例如啤酒酵母有16条染色体。有时为双倍体
1、原核生物(细菌、古生菌)的基因组
1)染色体为双链环状的DNA分子(单倍体);
2)基因组上遗传信息具有连续性;
3)功能相关的结构基因组成操纵子结构;
4)结构基因的单拷贝及rRNA基因的多拷贝;
5)基因组的重复序列少而短;
二、微生物基因组结构的特点
2、真核微生物(啤酒酵母)的基因组
1)典型的真核染色体结构;
2)没有明显的操纵子结构;
3)有间隔区(即非编码区)和内含子序列;
4)重复序列多;
质 粒
定义:是一类小型共价闭合环状核外DNA,能独立于细胞核
进行自主复制。可以通过交换掺入细胞核成为附加体;可以从
寄主细胞中消除。
大小:2~100×106Da,含有数个到数十个甚至上百个基因。
性质:质粒是一种复制子,分为严紧型和松弛型,严紧型质粒
的复制受细胞核控制,一般一个寄主细胞内有2~3个;松弛型
质粒的复制不受细胞核控制,在细胞内的数量可以达到10-15
个
功能:进行细胞间接合并带有一些基因,如产生毒素、抗药
性、降解功能等。
重组:在质粒之间、质粒与染色体之间菌可发生。
第三节质粒和转座因子
质粒的主要类型
质粒所编码
的功能和赋
予宿主的表
型效应
致育因子(Fertility factor,F因子)
抗性因子(Resistance factor,R因子)
产细菌素的质粒(Bacteriocinproduction plasmid)
毒性质粒(virulence plasmid)
代谢质粒(Metabolic plasmid)
隐秘质粒(cryptic plasmid)
– 致育因子/性因子,62×106Dalton,94.5kb,相
当于核染色体DNA2%的环状双链DNA,足以编
码94个中等大小多肽,其中1/3基因(tra区)与
接合作用有关。
– 存在于肠细菌属、假单胞菌属、嗜血杆菌、奈瑟
氏球菌、链球菌等细菌中,决定性别。
1.F-因子(fertility factor)
– R因子由相连的两个DNA片段组成,即抗性转移因
子(resistencetransforfactor,RTF )和抗性决
定因子(r-determinant),RTF控制质粒copy数及
复制,抗性决定因子带有抗生素或重金属的抗性基
因。
– R-因子在细胞内的copy数可从1~2个到几十个,分
为严紧型和松弛型两种,经氯霉素处理后,松弛型
质粒可达2000~3000个/细胞。
2. R(抗生素抗性和重金属抗性)因子
(resistencefactor)
3 .Col因子(colicinogenicfactor)
– 产大肠杆菌素因子。大肠杆菌素是一种由E.coli的某些菌株所分
泌的细菌蛋白,具有通过抑制复制、转录、转译或能量代谢等
而专一地杀死不含Col因子的近缘的其它肠道细菌。
– 凡带Col因子的菌株,由于质粒本身编码一种免疫蛋白,从而对
大肠杆菌素有免疫作用,不受其伤害。
4 .Ti(毒性)质粒(tumoeinducing plasmid)
– 即诱癌质粒。长200kb,是一种大型质粒。
– 存在于根癌土壤杆菌(Agrobacterium
tumefaciens)中。赋予宿主引起许多双子叶植物的
根癌的特性。
– 当带有Ti质粒的细菌侵入植物细胞中后,在其细胞中
溶解,把细菌的DNA释放至植物细胞中。含有复制
子的Ti质粒的小片段与植物细胞中的核染色体发生整
合,破坏控制细胞分裂的激素调节系统,从而使它
转变成癌细胞。
5.降解性(代谢)质粒
– 如假单胞菌属中发现。它们的降解性质粒可为
一系列能降解复杂物质的酶编码,从而能利用
一般细菌所难以分解的物质做碳源。这些质粒
以其所分解的底物命名,例如有分解CAM(樟
脑)质粒,XYL(二甲苯)质粒,SAL(水杨
酸)质粒,MDL(扁桃酸)质粒,,NAP
(奈)质粒和TOL(甲苯)质粒等。
6.隐秘质粒
不显示任何表型效应,只能通过物理的方法检
测的质粒。如酵母菌的2um质粒。
转座因子
插入(IS)序列
转座子(Tn)
特殊病毒(Mu噬菌体)
定义:可在DNA链上改变自身位置的一段DNA序列。
原核生物中的转座子类型
?插入突变
?产生染色体畸变(复制性转座子)
?基因的移动和重排
转座的遗传效应
第四节基因突变及修复
一个基因内部遗传结构或DNA序列的任何改变基因突变:
突变
自发突变
诱变
环境因素的影响,DNA复制过程的偶然错误等
而导致,一般频率较低,通常为10-6-10-9 。
某些物理、化学因素对生物体的DNA进行直接
作用,突变以较高的频率产生。
一、基因突变
1. 碱基变化与遗传信息的改变
? 同义突变:GGG(Gly)---GGA (Gly)
? 错义突变:AGA(Arg)---GGA (Gly)
? 无义突变:UGU(Cys)---UGA(stop)
? 移码突变:AGA(Arg) UGU(Cys) G---AGU(Ser) GUG(Val)
? RNA基因组发生突变的几率失DNA的1000倍。
(一)基因突变类型:
2. 表型突变
细胞形态:如细菌的鞭毛、芽孢或荚膜的有无, 。
形态突变型
菌落形态:菌落大小、外形光滑(S型) 、粗糙(R型)和颜色等
营养缺陷型:缺乏合成必须营养物质的突变型,hisC-,hisC+
生化突变型 抗性突变:菌株对某种药物产生抵抗的突变 Tetr, Tets
抗原性突变(包括细胞内部、表面成分的改变)
回复突变:
致死性突变型(合成关键性酶的基因发生突变,表现出致死突变)
条件致死突变型:如温度敏感型
其它突变型:毒力突变、糖发酵突变、产量、产品突变等
按
表
型
分
例如:温度敏感型突变
菌落颜色变化
rpoB3401
LCH320
DJ258
rpoB+
30C 37C 39C 44C
R529C
R529C
T525R
(二)基因突变的特点:
1)不对应性:环境与变异无对应性
2)自发性:非人为的诱变因素下发生
3)稀有性:生物体的自发突变率为10-6~10-9
4)独立性:一个基因的突变对其它基因突变无
影响,同时发生2个突变的几率很低。
5)诱变性:诱变剂可提高突变率10~105倍
6)稳定性:突变性状稳定、可遗传
7)可逆性:野生型--突变型叫正向突变,反之为
回复突变或回变。
突变率:每一细胞在每一世代中发生某一性状突变的几
率。
(三)基因突变自发性及不对应性的证明
? 变量试验
? 涂布试验
? 平板影印培养试验
自发突变(spontaneous mutation) :没有人工诱变因素的参
与,生物体的自然突变。
1.变量试验:1943年,Luria和 Delbrück
结果:
1)抗性细胞的出
现,是在接触噬菌
体之前;
2)喷上噬菌体,仅
起淘汰野生型和鉴
别抗性株作用;
3)由于甲方高度彷
徨,说明突变是随
机的。
103/ml
Phage T1 plates
24-36hr
24-36hr
2. 涂布试验(1949年,Newcombe )
结论:
1、突变与噬菌体无关;
2、涂布使抗性菌株均匀
分布;
3、抗性突变可在任何时
间发生,与噬菌体存在无
关。
3. 平板影印(replica plating)(1952,Lederberg夫妇 )
实验表明:从未接触链霉素(str)的菌株可发生
抗性突变,分离可得到纯的str r 菌株。
一种能达到在一系列培养皿的相同位置上出现
相同遗传型菌落的接种培养方法。1次接8个。
二、突变与育种
(一)自发突变与生产育种
1.生产选育:群体培养中个别的变异个体表现出
生长优势,发现突变种后,随时分离、纯化。
2.定向培育:用特定的环境长期处理某一微生物
群体,同时不断对其移种、传代,以达到积累
和选择合适的自发突变体的一种育种方法。
(二)诱变育种
1. 概念:
诱变育种是用物理或化学的诱变剂使诱变对象内的
遗传物质(DNA)的分子结构发生改变,引起性状
变异并通过筛选获得符合要求的变异菌株的一种育
种方法。
2. 诱变剂:
2)种类:
物理因子(phisicalagents)
化学因子(chemical agents)
转座子(transposable elements)
物理诱变剂:U.V、χ、γ、快中子、超声波等。
化学诱变剂:
1)概念:凡能提高基因突变频率的理化因素。
3. 诱变的主要环节
1)诱变剂的选择:
a. 了解诱变剂的性质、作用机理和使用方法
b. 处理方式:
单一因子处理:
复合因子处理:两种以上因素
c. 处理剂量:测致死率。
先后使用
同时使用
单一因子重复使用
方法 平板菌落计数法纸片法
一般杀菌率为70%左右。
三、诱变剂与致癌物质——Ames试验
a)利用各种诱变剂获得各类遗传突变,进行诱变育种;
c)危害人类自身的健康
b)对有害微生物进行控制;
很多种化学物质,能以各种机制导致DNA的突变
Ames试验:
回复突变(reverse mutation
或back mutation):突变体
失去的野生型性状,可以通
过第二次突变得到恢复,这
种第二次突变称为回复突
变。
抑制突变:由于第二次突变
抑制了第一次突变所造成的
缺陷。
原理:检测鼠伤寒沙门氏菌
(Salmonella typhmurium)组
氨酸营养缺陷型菌株(his-)的
回复突变率,
是由美国加利福尼亚大学的Bruce Ames教授于1966年发明。
四、营养缺陷型的筛选
(一)概念:
1. 三种遗传型个体
营养缺陷型(auxotroph):经诱变产生的一些合成能
力出现缺陷,而必须在培养基内加入相应
有机养分才能正常生长的变异菌株。
如:lys - ; his - ;
野生型(wild type):自然界分离到的任何微生物,在
其发生营养缺陷突变前的原始菌株,为
该微生物的野生型。如:lys + ; his+ ;
原养型(prototroph) :指auxo突变菌株回复突变或重组
后产生的菌株,与野生型的表型相同。
营养缺陷型的表示方法
基因型:所需营养物的前三个英文小写斜体字母表示:hisC
(组氨酸缺陷型,其中的大写字母C同一表型中不同基因的突变)
表型:同上,但第一个字母大写,且不用斜体:HisC
在具体使用时多用hisC-和hisC+,分别表示缺陷型和野生型。
2、筛选用的培养基
基本培养基(minimal medium,MM)[-]:满足野生型菌株
营养要求最低成分的组合。
完全培养基(complete medium,CM)[+]:满足一切营养
缺陷型生长的天然或半组合培养基。
补充培养基(supplemented medium,SM)[x]:在基本培养
基中有针对性地加入一或几种营养成分以满足相应营
养缺陷型生长的组合培养基。
(二)筛选方法
营养缺陷型的鉴定
诱变处理
营养缺陷型的浓缩
营养缺陷型的检出
2.营养缺陷型的浓缩:
1)抗生素法:
原理:青霉素(细
菌)、制霉菌素(霉
菌)等抗生素作用于生
长着的微生物细胞,对
休止态细胞无作用。
方法:菌培养在含抗生
素的MM基中。
1. 诱变处理:亚硝基胍(NTG)
2)菌丝过滤法:
适用于丝状(放
线菌、霉菌)。
原理:野生型在
基本培养基上发
育成菌丝,不能
通过滤膜;营养
缺陷型孢子可通
过滤膜,野生型
菌丝不能通过。
3)差别杀菌法:
基本培养基上只有野生型生长,加热杀死
野生型营养体,保留营养缺陷型芽孢。
细菌——80℃
酵母——60 ℃
适用于产芽孢、孢子菌。
3.营养缺陷型的检出
1)逐个检出法
2)影印平板培养法
3)限量补充法
(在基本培养基中加0.01%
蛋白胨,营养缺陷型菌落小,
野生型菌落大)
3.营养缺陷型的检出
4)夹层培养法
两层基本培养基,夹一层菌液,标记后,再加一
层完全培养基。
3.营养缺陷型的检出
4.营养缺陷型的鉴定
1)生长谱法
?方法简便;
?回变和污染不影响
结果
?测定物质可为粉末
或纸片
混合氨基酸法步骤:
a. 将多种营养因子编组,
如:一组:1 2 3 4 5
二组:2 6 7 8 9
三组:3 7 10 11 12
四组:4 8 11 13 14
五组:5 9 12 14 15
2)混合氨基酸(Vit)法
1)每组内无重复的营
养因子
2)每组中应包含只出
现一次的因子
3)每组中其他因子应
分别出现二次
营养因子分组编排时注意:
4.营养缺陷型的鉴定
b. 将组合液的纸片放
在涂菌的基本培养基
上培养
c. 结果分析
a. 将多种营养因子编组,
如:一组:1 2 3 4 5
二组:2 6 7 8 9
三组:3 7 10 11 12
四组:4 8 11 13 14
五组:5 9 12 14 15
5.营养缺陷型的应用
1)作为标记菌株:进行基因工程、诱变育种、
代谢过程的研究中的亲本标记;
2)作为生产菌种:aa、核苷酸等生产菌种;
3)作为aa、维生素、碱基的测定菌株。
第五节 细菌基因转移和重组
第六章真核微生物的遗传学特性
在“微生物遗传学”中学习
第七章菌种的衰退、复壮与保藏
性状稳定的菌种是微生物学工作最重要的基本要求,
否则生产或科研都无法正常进行。
一、菌种的衰退与复壮
1.影响微生物菌种稳定性的因素:
c)死亡;
大量群体中的自发突变菌种衰退的特点:
a)变异;
b)污染;
(一)菌种衰退(degeneration):
衰退是指由于自发突变的结果,而使某物种原有一系列生物学
性状发生量变和质变的现象。
2. 防止衰退的措施
1)经常进行纯种分离,并对相应的性状指标进行检查;
2)减少传代次数;
3)创造良好的培养条件;
4)采用有效的菌种保藏方法;
1)从衰退的菌种群体中把少数个体再找出来,重新获得具有
原有典型性状的菌种。
2)有意识地利用微生物会发生自发突变的特性,在日常的菌种
维护工作中不断筛选“正变”个体。
a)纯种分离; b)通过寄主体进行复壮;
(二)菌种的复壮(rejuvenation):
二、菌种保藏
在一定时间内使菌种不死、不变、不乱
基本要求:
基本原理:
a. 选用优良菌种
b.创造一个利于微生物休眠的环境条件
环境要素:干燥、低温、缺氧、缺营养
二、菌种保藏
基本方法:
生活态
休眠态
培养基传代培养
寄主传代培养
冷冻
干燥
斜面、平板
液氮、低温冰箱
沙土管、冷冻真空干燥
表几种常用菌种保藏方法的比较
方法名称 主要措施 适宜菌种 保藏期 评价
冰箱保藏法(
斜面)
冰箱保藏法(
半固体)
石蜡油封藏法
砂土保藏法
冷冻干燥保藏
法
液氮保藏法
甘油悬液保藏
法
低温(4℃)
低温(4℃),避氧
低温(4℃),缺氧
干燥,无营养
干燥,无氧,低温,
有保护剂
超低温(-196℃)
,有保护剂
低温(-70℃),保
护剂甘油
各大类
细菌,酵
母菌
各大类**
产孢子的
微生物
各大类
各大类
细菌,酵
母菌
3—6月
6—12月
1—2年
1—10年
5—15 年
以上
15 年以
上
约10年
简便
简便
简便
简便有
效
繁而高
效
繁而高
效
较简便
*用斜面或半固休穿刺培养物均可。一般置4℃冰箱保藏。
**石油发酵微生物不适宜。