附录二：伯杰氏系统细菌学手册（第九版）纲要 伯杰氏系统细菌学手册（Bergey’s Manual of Systematic Bacteriology）共分四卷。 第一卷(1984年)：具有医学和商用价值的革兰氏阴性细菌。包括螺旋体，螺菌和弧菌，革兰氏阴性好氧和兼性好氧杆菌，革兰氏阴性的专性厌氧菌，革兰氏阴性好氧和厌氧球菌，硫酸盐和硫还原细菌，立克次氏体，衣原体和枝原体。 第二卷(1986年)：具医学和商用价值的革兰氏阳性细菌。包括革兰氏阳性球菌，革兰氏阳性芽孢和非芽孢杆菌，分支细菌，非丝状放线菌。 第三卷(1989年)：剩余的革兰氏阴性细菌。趋光性、滑动、有鞘、出芽和有附器的细菌，蓝细菌，自养菌和古细菌。 第四卷(1989年)：丝状放线菌及相关细菌。 第一卷 第一节 螺旋体 目1：螺旋体目Spirochaetales 科1：螺旋体科Spirochaetaceae 属1：螺旋体属Spirochaeta 属2：脊螺旋体属Cristispira 属3：密螺旋体属Treponema 属4：疏螺旋体属Borrelia 科2：钩端螺旋体科Leptospiraceae 属1：钩端螺旋体属Leptospira 其它种类 白蚁和食木蟑螂后肠中螺旋体 第二节 好氧或微好氧,运动,螺旋或弧菌状革兰氏阴性细菌 属：水生螺菌属Aquaspirillum 属：螺菌属Spirillum 属：氮螺菌属Azospirillum 属：海洋螺菌属Oceanospirillum 属：弯曲杆菌属Campylobacter 属：蛭弧菌属Bdellovibrio 属：吸血弧菌属Vampirovibrio 第三节 非运动(或偶见运动),革兰氏阴性弯曲细菌 科1：螺状菌科Spirosomaceae 属1：螺状菌属Spirosoma 属2：古字状菌属Runella 属3：交织杆菌属Plectobacillus 其它属 属：微环菌属Microcyclus 属：新月菌属Meniscus 属：短弓菌属Brachyarcus 属：暗屈曲菌属Pelosigma 第四节 革兰氏阴性好氧杆菌和球菌 科1：假单胞菌科Pseudomonadaceae 属1：假单胞菌属Pseudomonas 属2：黄单胞菌属Xanthomonas 属3：弗拉特氏菌属Frateuria 属4：动胶菌属Zoogloea 科2：固氮菌科Azotobacteraceae 属1：固氮菌属Azotobacter 属2：固氮单胞菌属Azomonas 科3：根瘤菌科Rhizobiaceae 属1：根瘤菌属Rhizobium 属2：慢生根瘤菌属Bradyrhizobium 属3：土壤杆菌属Agrobacterium 属4：叶杆菌属Phyllobacterium 科4：甲基球菌科Methylococcaceae 属1：甲基球菌属Methylococcus 属2：甲基单胞菌属Methylomonas 属3：盐杆菌属Halobacterium 属4：盐球菌属Halococcus 科6：醋杆菌科Acetobacteraceae 属1：醋杆菌属Acetobacter 属2：葡糖杆菌属Gluconobacter 科7：军团菌科Legionellaceae 属1：军团菌属Legionella 科8：奈瑟氏球菌科Neisseriaceae 属1：奈瑟氏球菌属Neisseria 属2：莫拉氏菌属Moraxella 属3：不动杆菌属Acinetobacter 属4：金氏菌属Kingella 其它属： 属：拜叶林克氏菌属Beijerinckia 属：德克斯氏菌属Derxia 属：黄色杆菌属Xanthobacter 属：栖热菌属Thermus 属：热微菌属Thermomicrobium 属：盐单胞菌属Halomonas 属：交替单孢菌属Alteromonas 属：黄杆菌属Flavobacterium 属：产碱杆菌属Alcaligenes 属：蛇形菌属Serpens 属：紫色杆菌属Janthinobacterium 属：布鲁氏菌属Brucella 属：博德特氏菌属Bordetella 属：弗郎西丝氏菌属Francisella 属：副球菌属Paracoccus 属：俊片菌属Lampropedia 第五节 兼性厌氧革兰氏阴性杆菌 科1：肠杆菌科Enterobacteriaceae 属1：埃希氏菌属Escherichia 属2：志贺氏菌属Shigella 属3：沙门氏菌属Salmonella 属4：柠檬酸细菌属Citrobacter 属5：克雷伯氏菌属Klebsiella 属6：肠杆菌属Enterobacter 属7：欧文氏菌属Erwinia 属8：沙雷氏菌属Serratia 属9：哈夫尼菌属Hafnia 属10：爱德华氏菌属Edwardsiella 属11：变形菌属Proteus 属12：普罗威登斯菌属Providencia 属13：摩根氏菌属Morganella 属14：耶尔森氏菌属Yersinia 肠杆菌科的其它属 属：肥杆菌属Obesumbacterium 属：致病杆菌属Xenorhabdus 属：克吕沃尔氏菌属Kluyvera 属：拉恩氏菌属Rahnella 属：西地西菌属Cedecea 属：塔特姆氏菌属Tatumella 科2: 弧菌科Vibrionaceae 属1：弧菌属Vibrio 属2：发光杆菌属Photobacterium 属3：气单胞菌属Aeromonas 属4：邻单胞菌属Plesiomonas 科3：巴斯德菌科Pasteurellaceae 属1：巴斯德杆菌属Pasteurella 属2：嗜血菌属Haemophilus 属3：放线杆菌属Actinobacillus 其它属 属：发酵单胞菌属Zymomonas 属：色杆菌属Chromobacterium 属：心杆菌属Cardiobacterium 属：鞘杆菌属Calymmatobacterium 属：加德纳氏菌属Gardnerella 属：艾肯氏菌属Eikenella 属：链杆菌属Streptobacillus 第六节 厌氧革兰氏阴性直、弯和螺杆菌 科1：拟杆菌科Bacteroidaceae 属1：拟杆菌属Bacteroides 属2：梭杆菌属Fusobacterium 属3：纤毛菌属Leptotrichia 属4：丁酸弧菌属Butyrivibrio 属5：琥珀酸单胞菌属Succinimonas 属6：琥珀酸弧菌属Succinivibrio 属7：厌氧螺菌属Anaerobiospirillum 属8：沃林氏菌属Wolinella 属9：月形单胞菌属Selenomonas 属10：厌氧弧菌属Anaerovibrio 属11：梳状菌属Pectinatus 属12：醋弧菌属Acetivibrio 属13：毛螺菌属Lachnospira 第七节 异化型硫酸盐或硫还原细菌 属：脱硫单孢菌属Desulfuromonas 属：脱硫弧菌属Desulfovibrio 属：脱硫单胞菌属Desulfomonas 属：脱硫球菌属Desulfococcus 属：脱硫杆菌属Desulfobacter 属：脱硫叶菌属Dusulfobulbus 属：脱硫八叠球菌属Desulfosarcina 第八节 厌氧革兰氏阴性球菌 科1：韦荣氏球菌科Veillonellaceae 属1：韦荣氏球菌属Veillonella 属2：氨基酸球菌属Acidaminococcus 属3：巨球形菌属Megasphaera 第九节 立克次氏体和衣原体 目1：立克次氏体目Rickettsiales 科1：立克次氏体科Rickettsiaceae 族1：立克次氏体族Rickettsieae 属1：立克次氏体属Rickettsia 属2：罗卡利马氏体菌属Rocalimaea 属3：考克斯体菌属Coxiella 族2：埃里希氏体族Ehrlichieae 属4：埃里希氏体属Ehrlichia 属5：考德里氏体属cowdria 属6：新立克次氏体属Neorickttsia 族3：沃尔巴克氏体族Wolbachieae 属7：沃尔巴克氏体属Wolbachia 属8：立克次氏小体属Rickettsiella 科2：巴尔通氏体科Bartonellaceae 属1：巴尔通氏体属Bartonella 属2：格拉汉氏体属Grahamella 科3：无形体科Anaplasmataceae 属1：无形体属Anaplasma 属2：埃及小体属Aegyptianella 属3：血巴通氏体属Haemobartonella 属4：血虫体属Eperythrozoon 目2：衣原体目Chlamydiales 科1：衣原体科Chlamydiaceae 属1：衣原体属Chlamydia 第十节 枝原体 目1：枝原体目Mycoplasmatales 科1：枝原体科Mycoplasmataceae 属1：枝原体属Mycoplasma 属2：尿枝原体属Ureaplasma 科2：无胆甾原体科Acholeplasmaceae 属1：无胆甾原体属Acholeplasma 科3：螺原体科Spiroplasmaceae 属1：螺原体属Spiroplasma 其它属 属：厌氧枝原体属Anaeroplasma 属：热原体属Thermoplasma 植物和无脊椎动物的枝原体样生物 内共生菌 原生动物的内共生菌 纤毛内共生菌 鞭毛内共生菌 阿米巴内共生菌 内共生菌类别： 属1：全孢螺菌属Holospora 属2：杀手杆菌属Caedibacter 属3：类杀手杆菌属Pseudocaedibacter 属4：溶菌属Lyticum 属5：罩杆菌属Tectibacter 昆虫内共生菌 属：蟑螂杆状体属Blattabacterium 真菌和除节肢动物外的无脊椎动物内共生菌 第二卷 第十二节 革兰氏阳性球菌 科1：微球菌科Micrococcaceae 属1：微球菌属Micrococcus 属2：口腔球菌属Stomatococcus 属3：动性球菌属Planococcus 属4：葡萄球菌属Staphylococcus 科2：异常球菌科Deinococcaceae 属：异常球菌属Deinococcus 其它属 属：链球菌属Streptococcus 产脓的溶血性链球菌，口腔链球菌，肠道链球菌， 乳酸链球菌，厌氧性链球菌和其它链球菌 属：明串珠菌属Leuconostoc 属：片球菌属Pediococcus 属：气球菌属Aerococcus 属：孪生球菌属Gemella 属：消化球菌属Peptococcus 属：消化链球菌属Peptostreptococcus 属：瘤胃球菌属Ruminococcus 属：粪球菌属Coprococcus 属：八叠球菌属Sarcina 第十三节 形成芽孢的革兰氏阳性杆菌和球菌 属：芽孢杆菌属Bacillus 属：芽孢乳杆菌属Sporolactobacillus 属：梭菌属Clostridium 属：脱硫肠状菌属Desulfotomaculum 属：芽孢八叠球菌属Sporosacina 属：颤螺菌属Oscillospora 第十四节 匀称的、无芽孢革兰氏阳性杆菌 属：乳杆菌属Lactobacillus 属：利斯特氏菌属Listeria 属：丹毒丝菌属Erysipelothri 属：索丝菌属Brochothrix 属：肾杆菌属Renibacterium 属：库特氏菌属Kurthia 属：里拉菌属Caryophanon 第十五节 不匀称的、无芽孢革兰氏阳性杆菌 属：棒杆菌属Corynebacteriu 属：植物病原性棒杆菌 属：加德纳氏菌属Gardnerella 属：隐秘杆菌属Arcanobacterium 属：节杆菌属Arthrobacter 属：短杆菌属Brevibacterium 属：短小杆菌属Curtobacterium 属：乳酪杆菌属Caseobacter 属：微杆菌属Microbacterium 属：金杆菌属Aureobacterium 属：纤维单胞菌属Cellulomonas 属：壤霉菌属Agromyces 属：蛛菌属Arachnia 属：罗氏菌属Rothia 属：丙酸杆菌属Propionibacterium 属：真杆菌属Eubacterium 属：醋杆菌属Acetobacterium 属：毛螺菌属Lachnospira 属：丁酸弧菌属Butyrivibrio 属：高温厌氧杆菌属Thermoanaerobacter 属：放线菌属Actinomyces 属：双岐杆菌属 Bifidobacterium 第十六节 分枝杆菌 科1：分枝杆菌科Mycobacteriaceae 属1：分枝杆菌属Mycobacterium 第十七节 诺卡氏菌类 属：诺卡氏菌属Nocardia 属：红球菌属Rhodococcus 属：类诺卡氏菌属Nocardioides 属：假诺卡氏菌属Pseudonocardia 属：厄氏菌属Oerskovia 属：糖多孢菌属Saccharopolyspora 属：小多孢菌属Micropolyspor 属：原小单孢菌属Promicromonospora 属：间孢囊菌属Intrasporangium 第三卷 第十八节 非放氧光合细菌 紫细菌 科1：着色菌科Chromatiaceae 属1：着色菌属Chromatium 属2：束硫菌属Thiocystis 属3：硫螺旋菌属Thiospirillum 属4：荚硫菌属Thiocapsa 属5：闪杆菌属Lamprobacter 属6：闪囊菌属Lamprocystis 属7：网硫菌属Thiodictyon 属8：可变杆菌属Amoebobacter 属9：板硫菌属Thiopedia 科2：外硫红螺菌科Ectothiorhodospiraceae 属：外硫红螺菌属Ectothiorhodospira 紫色非硫化细菌 属：红螺菌属Rhodospirillum 属：红球形菌属Rhodopila 属：红杆菌属Rhodobacter 属：红假单胞菌属Rhodopseudomonoas 属：红微菌属Rhodomicrobium 属：红环菌属Rhodocyclus 绿色细菌 绿硫细菌 属：绿菌属Chlorobium 属：突柄绿菌属Prosthecochloris 属：暗网菌属Pelodictyon 属：绿臂菌属Ancalochloris 属：绿滑菌属Chloroherpeton 共生菌 多细胞，丝状绿色细菌 属：绿屈挠菌属Chloroflexus 属：螺丝菌属Heliothrix 属：绿颤蓝细菌属Oscillocholoris 属：绿丝菌属Chloronema 未确定属 属：螺旋杆菌属Heliobacterium 属：赤细菌属Erythrobacter 第十九节 好氧光合细菌 组1：蓝细菌 小节1： 目：着色球菌目Chrococcales 属1：管孢蓝细菌属Chamaesiphon 属2：粘杆菌属Gloeobacter 属3：粘杆蓝细菌属Gloeothece 小节2： 目：宽球蓝细菌目Pleurocapsales 属1：皮果蓝细菌属Dermocarpa 属2：异球蓝细菌属Xenococcus 属3：小皮果蓝细菌属Dermocarpella 属4：粘八叠球菌属Myxosacina 属5：拟色球蓝细菌属Chroococcidiopsis 小节3： 目：颤蓝细菌目Oscillatoriales 属1：螺旋蓝细菌属Spirulina 属2：节螺蓝细菌属Arthrospira 属3：颤蓝细菌属Oscillatoria 属4：鞘丝蓝细菌属Lyngbya 属5：假鱼腥蓝细菌属Pseudanabaena 属6：斯塔尔氏蓝细菌属Starria 属7：发毛针蓝细菌属Crinalium 属8：微鞘蓝细菌属Microcoleus 小节4： 目：念珠蓝细菌目Nostocales 科1：念珠蓝细菌科Nostocaceae 属1：鱼腥蓝细菌属Anabaena 属2：蓝束丝蓝细菌属Aphanizomenon 属3：节球蓝细菌属Nodularia 属4：筒孢蓝细菌属Cylindrospermum属5：念珠蓝细菌属Nostoc 科2：伪枝蓝细菌科Scytonemataceae 属1：伪枝蓝细菌属Scytonema 科3：胶须蓝细菌科Rivulariaceae 属1：眉蓝细菌属Calothrix 小节5： 目：拟绿胶蓝细菌目Stigonematales 属1：真杆蓝细菌属Chlorogloeopsis 属2：飞氏蓝细菌属Fischerella 属3：真枝蓝细菌属Stigonema 属4：吉特勒氏蓝细菌属Geitleria 组2： 目：原绿蓝细菌目Prochlorales 科1：原绿蓝细菌科Prochloraceae 属：原绿蓝细菌属Prochloron 其它类别 属：原绿丝蓝细菌属“Prochlorothrix” 第二十节 好气化能自养细菌和相关生物 A．硝化细菌 科：硝化细菌科Nitrobacteraceae 属1：硝化杆菌属Nitrobacter 属2：硝化刺菌属Nitrospira 属3：硝化球菌属Nitrococcus 属4：亚硝化螺菌属Nitrosospira 属5：亚硝化单胞菌属Nitrosomonas 属6：亚硝化球菌属Nitrosococcus 属7：亚硝化螺菌属Nitrosospira 属8：亚硝化叶菌属Nitrolobus 属9：亚硝化弧菌属Nitrosovibrio B．无色硫化细菌 属：硫小杆菌属Thiobacterium 属：大单胞菌属Macromonas 属：硫螺菌属Thiospira 属：卵硫菌属Thiovulum 属：硫杆菌属Thiobacillus 属：硫微螺菌属Thiomicrospira 属：硫球菌属Thiosphaera 属：嗜酸菌属Acidiphilium 属：嗜热丝菌属Thermothrix C．专性氢氧化菌 属：氢细菌属Hydrogenobacter 铁和锰氧化和/或储存细菌 科：鞘铁菌科Siderocapsaceae 属1：鞘铁菌属Siderocapsa 属2：瑙曼氏菌属Naumanniella 属3：铁球菌属Siderococcus 属4：赭菌属Ochrobium 趋磁细菌 属：水生螺菌属Aquaspirillum 属：嗜胆球菌属Bilophococcus 第二十一节 芽生和/或有附器的细菌 A. 柄细菌 1. 出芽细菌 属：生丝微菌属Hyphomicrobium 属：生丝单胞菌属Hyphomonas 属：土微菌属Pedomicrobium 属：臂微菌属Ancalomicrobium 属：突柄微菌属Prosthecomicrobium 属：星状菌属Stella 属：双头菌属Labrys 2. 非出芽细菌 属：柄杆菌属Caulobacter 属：不粘柄菌属Asticcacaulis 属：突柄杆菌属Prosthecobacter B. 无柄细菌 出芽细菌 属：浮霉状菌属Planctomyces 属：等球菌属Isosphaera 属：芽生杆菌属Blastobacter 属：角微菌属Angulomicrobium 属：芽殖菌属gemmiger 属：剑菌属Ensifer 2. 非出芽细菌 属：嘉利翁氏菌属Gallionella 属：涅瓦河菌属Nevskia 包在铁和锰沉积物中形态独特的芽生细菌 属：塞里伯氏菌属Seliberia 属：生金菌属Metallogenium 属：柄球菌属Caulococcus 属：库兹涅佐夫氏菌属Kuznezovia 属：枝硫菌属Thiodendron 其他 有脊细菌Spinate bacteria 第二十二节 鞘衣细菌 属：球衣菌属Sphaerotilus 属：纤发菌属Leptothrix 属：束缚杆菌属Haliscomonobacter 属：利斯克氏菌属“Lieskeella” 属：栅发菌属“Phragmidiothrix” 属：泉发菌属Crenothrix 属：细支发菌属“Clonothrix” 第二十三节 非光合，无子实体，滑动细菌 目1：噬纤维菌目Cytophagales 科1：噬纤维菌科Cytophagaceae 属1：噬纤维菌属Cytophaga 属2：生孢噬纤维菌属Sporocytophaga 属3：二氧化碳嗜纤维菌属Capnocytophaga 属4：柔发菌属Flexithrix 其它属 属：屈挠杆菌属Flexibacter 属：噬几丁质菌属Chitinophaga 属：微颤蓝细菌属Microscilla 目2：溶杆菌目Lysobacterles 科：溶杆菌科Lysobacteriaceae 属：溶杆菌属Lysobacter 目3：贝日阿托氏菌目Beggiatoales 科：贝日阿托氏菌科Beggiatoaceae 属1：贝日阿托氏菌属Beggiaoa 属2：辫硫杆菌属Thioploca 属3：拟硫螺菌属Thiosprillopsis 属4：丝硫菌属Thiothrix 其它 科1：西蒙斯氏菌科Simonsiellaceae 属1：西蒙斯氏菌属Simonsiella 属2：小链菌属Alysiella 科2：暗线菌科“Pelonemataceae” 属1：暗线菌属“Pelonemata” 属2：暗辫菌属“Peloploca” 属3：无色线菌属“Achroonema” 属4：花丛菌属“Desmanthos” 其它属 属：滑柱菌属Herpetosiphon 属：曲发菌属Toxothrix 属：亮发菌属Leucothrix 属：透明颤菌属Vitreoscilla 属：脱硫线菌属Desulfonema 属：震球菌属Agitococcus 属：无色菌属Achromatium 第二十四节 滑动、产子实体细菌 目：粘球菌目Myxococcales 科1：粘球菌科Myxococcaceae 属：粘球菌属Myxococcus 科2：原囊菌科Archangiaceae 属：原囊菌属Archangium 科3：孢囊杆菌科Cystobacteraceae 属1：孢囊杆菌属Cystobacter 属2：蜂窝囊菌属Melittangium 属3：标桩菌属Stigmatella 科4：多囊菌科Polyangiaceae 属1：多囊菌属Polyangium 属2：侏囊菌属Nannocystis 属3：软骨霉状菌属Chondromyces 第二十五节 古细菌 组1：产甲烷古细菌 目1：甲烷杆菌目Methanobacteriales 科1：甲烷杆菌科Methanobacteriaceae 属1：甲烷杆菌属Methanobacterium 属2：甲烷短杆菌属Methanobrevibacter 科2：甲烷嗜盐菌科Methanothermaceae 属：甲烷嗜盐菌属Methanothermus 目2：甲烷球菌目Methanococcales 科：甲烷球菌科Methanococcaceae 属：甲烷球菌属Methanococcus 目3：甲烷微球菌目Methanomicrobiales 科1：甲烷微球菌科Methanomicrobiaceae 属1：甲烷微球菌属Methanomicrobium属2：产甲烷菌属Methanogenium 属3：甲烷螺菌属Methanospirillun 科2：甲烷八叠球菌科Methanosarcinaceae 属1：甲烷八叠球菌属Methanosarcina 属2：拟甲烷球菌属Methanococcoides 属3：甲烷叶菌属Methanolobus 属4：甲烷丝菌属Methanothrix 其它类别 科：甲烷盘菌科Methanoplanaceae 属：甲烷盘菌属Methanoplanus 其它 属：甲烷球形菌属Methanosphaera 组2：硫还原古细菌 目：古生球菌目Archaeoglobales 科：古生球菌科“Archaeoglobaceae” 属：古生球菌属Archaeoglobus 组3：极端嗜盐古细菌 目：嗜盐细菌目Halobacteriales 科：盐细菌科Halobacteriaceae 属1：盐球菌属Halococcus 属2：盐杆菌属Halobacterium 属3：富盐菌属Haloferax 属4：盐盒菌属Haloarcula 属5：嗜盐碱球菌属Natronococcus 属6：嗜盐碱杆菌属Natronobacterium 属7：无细胞壁古细菌 属8：热原体属Thermoplasma 组5：极端嗜热细菌 目1：热变形菌目Thermoproteales 科1：热变形菌科Thermoproteaceae 属1：热变形菌属Thermoproteus 属2：嗜热菌属Thermophilum 科2：硫还原球菌科Desulfurococcaceae 属1：硫还原球菌属Desulfurococcus 属2：热球菌属Thermococcus 属3：热盘菌属Thermodiscus 属4：热网菌属Pyrodictium 目2：热球菌目Thermococcales 科：热球菌科Thermococcaceae 属1：热球菌属Thermococcus 属2：热球菌属Pyrococcus 目3：硫化叶菌目Sulfolobales 科：硫化叶菌科Sulfolobaceae 属：硫化叶菌属Sulfolobus 属：酸菌属Acidianus 第四卷 第二十六节 诺卡菌样放线菌 属：诺卡氏菌属Nocardia 属：红球菌属Rhodococcus 属：类诺卡氏菌属Nocardioides 属：假诺卡氏菌属Pseudonocardia 属：厄氏菌属Oerskovia 属：糖多孢菌属Saccharopolyspora 属：干草菌属Faenia(Micropolyspora) 属：原小单孢菌属Promicromonospora 属：间孢囊菌属Intrasporangium 属：放线多孢菌属Actinopolyspora 属：糖单孢菌属Saccharomonospora 属：拟无枝酸菌属 Amycolatopsis 属：无枝酸菌属Amycolata 第二十七节 多孢子囊放线菌 属：地嗜皮菌属Geodermatophilus 属：嗜皮菌属Dermatophilus 属：弗兰克氏菌属Frankia 第二十八节 游动放线菌 属：游动放线菌属Actinoplanes 属：小瓶菌属Ampullariella 属：水生角质菌属Pilimelia 属：指孢囊菌属Dactylosporangium 属：小单胞菌属Micromonospora 第二十九节 放线菌和有关的属 属：链霉菌属Streptomyces 属：轮丝链霉菌属Streptoverticillium 属：动孢囊菌属Kineospora 属：鱼孢菌属Sporichthya 第三十节 Maduromycetes 足分支菌 属：马杜拉放线菌属Actinomadura 属：小双孢菌属Microbispora 属：小四孢菌属Microtetraspora 属：游动双孢菌属Planobispora 属：游动单胞菌属Planomonospora 属：螺孢菌属Sprillospora 属：链孢囊菌属Streptosporangium 第三十一节 高温单胞菌及相关的属 属：高温单胞菌属Thermomonospora 属：束丝放线菌属Actinosynnema 属：拟诺卡氏菌属Nocardiopsis 属：链异壁菌属Streptoalloteichus 第三十二节 高温放线菌 属：高温放线菌属Thermoactinomyces 第三十三节 其它属 属：糖霉菌属Glycomyces 属：拟孢囊菌属Kibdelosporangium 属：北里孢菌属Kitasatosporia 属：糖丝菌属Saccharothrix 附录三: Ainsworth(1973)的真菌分类系统纲要 真菌界(The Fungi) 1.粘菌门Myxomycota (1)集孢菌纲Acrasiomycetes 1)原柱菌亚纲Protostelidae a.原柱菌目Protosteliales 2)集孢菌亚纲Acrasidae a.集孢菌目 Acrasiales 3)网柱菌亚纲 Dictyostelidae a.网柱菌目 Dictyosteliales (2)粘菌纲 Myxomycetes 1)鹅绒菌亚纲 Ceratiomyxomycetidae a.鹅绒菌目 Ceratiomyxales 2)内孢菌亚纲 Myxogastromycetidae a.绒泡菌目 Physarales b.无菌丝目 Liceales c.刺丝菌目 Echinosteliales d.团毛菌目 Trichiales 3)发网菌亚纲 Stemomitomycetidae a.发网菌目 Stemonitales 2. 真菌门 Eumycota (1)鞭毛菌亚门 Ｍastigomycotina 1) 壶菌纲 Chytridiomycetes a. 壶菌目 Chytridiales b. 肋壶菌目 Harpochytriales c. 芽枝菌目 Blastocladiales d. 单毛菌目 onoblepharidales 2)丝壶菌纲 Hyphochytridiomycetes a. 丝壶菌目 Hyphochytridiales 3)根肿菌纲 Plasmodiophorales a. 根肿菌目 Plasmodiophorales 4)卵菌纲 Oomycetes a. 链壶菌目 Lagenidiales b. 水霉目 Saprolegniales c.节水霉目 Leptomitales d. 霜霉目 Peronosporales (2)接合菌亚门 Zygomycotina 1)接合菌纲 Zygomycetes a.毛霉目 Mucorales b.虫霉目 Entomophthorales c.捕虫霉目 Zoopagales 2)毛菌纲 Trichomycetes a.钩孢毛菌目 Harpellales b.内孢毛菌目 Asellariales c.外孢毛菌目 Eccrinales d.变形毛菌目 Amoebidiales (3)子囊菌亚门 Ascomycotina 1)半子囊菌纲 Hemiascomycetes a.内孢霉目 Endomycetales b.原囊菌目 Protomycetales c.外囊菌目 Taphrinales 2)不整囊菌纲 Plectomycetes a.散囊菌目 Eurotiales 3)核菌纲 Pyrenomycetes a.白粉菌目 Erysiphales b.小煤炱目 Meliolales c.冠囊菌目 Coronophorales d.球壳菌目 Sphaeriales 4)腔菌纲 Loculoascomycetes a.多腔菌目 Myriangiales b.座囊菌目 Dothideales c.格孢腔菌目 Pleosporales d.缝裂壳目 Hysteriales e.半球腔菌目 Hemisphaeriales 5)虫囊菌纲 Laboulbeniomycetes a.虫囊菌目 Laboulbeniales 6)盘菌纲 Discomycetes a.梭绒盘菌目 Medeolariales b.瘿果盘菌目 Cyttariales c.块菌目 Tuberales d.盘菌目 Pezizales e.星裂盘菌目 Phacidiales f.厚顶盘菌目 Ostropales g.柔膜菌目 Helotiales (4) 担子菌亚门 Basidiomycotina 1)冬孢菌纲 Teliomycetes a. 锈菌目 Uredinales b. 黑粉菌目 Ustilaginales 2)层菌纲 Hymenomycetes a. 银耳目 Tremellales b. 木耳目 Auriculariales c. 隔担菌目 Septobasidiales d. 外担菌目 Exobasidiales e. 缢担菌目 Brachybasidiales f. 花耳目 Dacrymycetales g. 胶膜菌目 Tulasnellales h. 伞菌目（蘑菇目） Agaricales i. 多孔菌目 Aphyllophorales (Polyporales) 3)腹菌纲 Gesteromycetes a.轴灰包目 Podaxales b.鬼笔目 Phallales c.马勃目 Lycoperdales d.高腹菌目 Gautieriales e.腹菌目 Hymenogastrales f.鸟巢菌目 Nidulariales g.黑腹菌目 Melanogastrales h.硬皮马勃目 Sclerodermatales i. 梗灰包目 Turostomatales (5)半知菌亚门 Deuteromycotina 1)芽孢纲 Blastomycetes a.隐球酵母目 Cryptococcales b.掷孢酵母目 Sporobolomycetales 2)丝孢纲 Hyphomycetes a.无孢目 Agonomycetales b.束梗孢目 Stilbellales c.丝孢目 Hyphomycetales(Moniliales) d.瘤座孢目 Tuberculariales 3)腔孢纲 Coelomycetes a.黑盘孢目 Melanconiales b.球壳孢目 Sphaeropsidales 附录四: Smith的分类系统 根据真菌的有性繁殖特点，将其分为三个纲和一个类： 一、藻状菌纲（Phycomycetes）：菌丝如存在，通常无隔膜，有性孢子为合子、卵孢子或接合孢子 菌丝有隔膜，如无菌丝靠出芽繁殖　 有性世代存在 1．子囊菌纲（Ascomycetes）：有性孢子为内生在子囊内的子囊孢子 2．担子菌纲（Basidiomycetes）：有性孢子为外生在担子上的担孢子 有性世代不详 半知菌类（Fungi imperfecti） I. 藻状菌纲（Phycomycetes） 藻状菌纲是真菌门中最小的一纲，估计有200余属，1,500种。分布很广，水生或陆生，其中包括腐生和寄生的种类。它们的特征是：1. 典型的无隔多核菌丝体；2. 孢子囊中产生大量的孢囊孢子；3. 有性繁殖形成合子，卵孢子或接合孢子。 根据孢囊孢子能否游动和游动孢囊孢子的鞭毛数目，将藻状菌纲分为三个亚纲： 形成能动的孢囊孢子 单鞭毛菌亚纲（Uniflagellatae）：孢囊孢子有一根后生单鞭毛 壶菌目（Chytridiales） 芽枝霉目（Blastocladiales） 单毛菌目（Monoblepharidales） （二）双鞭毛菌亚纲（Biflagellatae）：孢囊孢子双鞭毛 链壶菌目（Lagenidiales） 水霉目（Saprolegniales） 水节霉目（Leptomitales） 霜霉菌目（Peronosporales） 二、无鞭毛菌亚纲（Aflagellatae）：形成不能动的孢囊孢子 毛霉目（Mucorales） 虫霉目（Entomophthorales） Ⅱ子囊菌纲（Ascomycetes） 子囊菌纲是真菌门中比较大的一纲，估计有1,700多属，26,000多种。它们的显著特点是产生子囊。 子囊菌的菌体有简单的单细胞至复杂的多细胞结构。有性生殖由两个已分化的或形态无区别的雌、雄细胞相结合后形成子囊，或结合后形成造囊丝，再由造囊丝形成子囊，内生子囊孢子。子囊裸露或包藏于由菌丝所结成的子囊果内。 根据造囊丝和子囊果的有无，将子囊菌纲分成两个亚纲： 一、半子囊菌亚纲（Hemiascomycetes）：凡是不产生造囊丝，不形成子囊果的 内孢霉目（Endomycetales） 内孢霉科（Endomycetaceae） 掷孢酵母科（Sporobolomycetaceae） 隐球酵母科（Cryptococcaceae） 2.外囊菌目（Taphrinales） 真子囊菌亚纲（Euascomycetes）：凡是产生造囊丝，并由此形成子囊，且有子囊果的 1. 闭囊壳菌类（Plectomycetes）：凡子囊果是封闭无孔口的 曲霉目（Aspergillales） 曲霉属（Aspergillus） 青霉属（Penicillium） 红曲霉属（Monascus） 2.核菌类（Pyrenomycetes）：凡子囊果是子囊壳的 球壳菌目（Sphaeriales） 脉孢菌属（Neurospora） 赤霉属（Gibberella） 麦角菌目（Clavicipitales） 3. 盘菌类（Discomycetes）：凡子囊果为盘状子囊盘的 盘菌目（Pezizales） 块菌目（Tuberales） Ⅲ 担子菌纲（Basidiomycetes） 担子菌纲是真菌门中最高级的一纲，大约有24,000种。它们的特征为产生担孢子。 担子菌无明显的生殖器官，两性的结合是靠未分化菌丝的接合或孢子的接合。而且结合时只行质配，并不核配，以锁状联合的方式形成新的双核细胞。两性细胞核在形成担孢子之前才行核配，随之行减数分裂产生单倍体的担孢子。 根据担子的构造，将担子菌纲分成两个亚纲。 一、同担子菌亚纲（Homobasidiomycetes）：担子由单一细胞组成，无横隔 1. 层担子菌类（Hymenomycetes）：子实层在成熟时暴露于外的 （1）蘑菇目（Agaricales）：有担子果 （2）外担菌目（Exobasidiales）：无担子果 2．腹菌类（Gasteromycetes）：子实层在成熟时包藏于内的 异担子菌亚纲（Heterobasidiomycetes）：担子由几个细胞组成，有分隔 1. 花耳目（Dacrymycetales） 2. 银耳目（Tremellales） 3. 木耳目（Auriculariales） 4. 隔担菌目（Septobasidiales） 5. 锈菌目（Uredinales） 6. 黑粉菌目（Ustilaginales） Ⅳ 半知菌类（Fungi imperfecti） 半知菌类数量极大，约有26,000种。凡是那些只发现无性世代而未观察到有性世代的真菌，都被人为地归入半知菌类。 半知菌产生各种类型的子实体，分生孢子梗和分生孢子。以这些器官的结构特征为分类标准，将其分为三目一群。 球壳孢目（Sphaeropsidales）分生孢子长在分生孢子器或变形的分生孢子器中。 黑盘孢目（Melanconiales）分生孢子长在分生孢子盘中。 丛梗孢目（Moniliales）分生孢子产生在散生的分生孢子梗上，或分生孢子梗成束，或分生孢子梗密生于子座上。 无孢菌群（Mycelia sterilia）未发现孢子，只生菌丝。 附录五: 酵母菌分属检索表（Lodder,1970年） 裂殖酵母属（Schizosaccharomyces）：无性繁殖为裂殖，以生隔膜分裂为二个细胞，而不是芽殖 梗孢酵母属（Sterigmatomyces）：无性繁殖是在梗上形成细胞 以其他方式进行无性繁殖 瓶形酵母属（Pityrosporum）： 一端芽殖 二端芽殖 多边芽殖，有真菌丝，或有节孢子，掷孢子 裂芽酵母属（Schizoblastosporion） 不发酵葡萄糖 发酵葡萄糖 4．有子囊孢子 克勒克酵母属（Kloeckera）：无子囊孢子 5. 威克酵母属（Wickerhamia）：孢子帽形（运动帽） 类酵母属（Saccharomycodes）：孢子圆形（或有窄边），光滑、透明或成对结合 拿逊酵母属（Nadsonia）：孢子圆形，痣面，棕色 有孢汉逊酵母属（Hanseniaspora）：孢子帽形、钢盔形或球形、带有明显的突起、孢子不成对结合 6. 有掷孢子 …………………………………………………………………………… 7 无掷孢子 …………………………………………………………………………… 9 7．锁掷酵母属（Sporidiobolus） 无锁状联合………………………………………………………………………… 8 8．掷孢子不对称，有胡萝卜素……………………掷孢酵母属（Sporobolomyces） 掷孢子对称，无胡萝卜素……………………………………布勒掷孢酵母属（Bullera） 9. 营养细胞为三角形………………………………………… 三角酵母属（Trigonopsis） 营养细胞非三角形 …………………………………………………………… 10 10. 细胞有的为尖形（一端略尖）可由葡萄糖强烈地产醋酸，有特殊香气，在麦芽汁 琼脂上生长缓慢……………………………………………………………………… 11 细胞无尖形 ……………………………………………………………………… 12 11．有子囊孢子………………………………………………… 德克酵母属（Dekkera） 无子囊孢子………………………………………… 酒香酵母属（Brettanomyces） 12.有子囊孢子………………………………………………………………………… 13 无子囊孢子……………………………………………………………………… 28 13．同化硝酸盐……………………………………………………………………… 14 不同化硝酸盐…………………………………………………………………… 16 14．细胞形成一管状子囊，其末端的球形区域内形成帽形子囊孢子…………………… ………………………………………………………………… 管囊酵母属（Pachysolen） 子囊非管状……………………………………………………………………… 15 15．孢子球形，痣面………………………………………… 固囊酵母属（Citeromyces） 孢子帽形或土星形…………………………………………汉逊酵母属（Hansenula） 16.子囊为母细胞上之囊状突起，孢子为浅琥珀色……………油脂酵母属（Lipomyces） 子囊与Lipomyces不同………………………………………………………… 17 17．有大量真菌丝和芽细胞…………………………………拟内孢霉属（Endomycopsis） 真菌丝少或无…………………………………………………………………… 18 18．孢子针形，孢子1-2个……………………………………梅奇酵母属（Metschnikowia） 孢子镰刀形，孢子二个以上…………………………………………………… 19 孢子大，卵至柱形，30-40℃生长，要求复杂的培养基并需气态二氧化碳，仅在兔 子消化道和某些啮齿动物中发现…………………复膜酵母属（Saccharomycopsis） 孢子球形至卵形，痣面，中部具有凸起……………许旺酵母属（Schiwanniomyces） 孢子形状与上述不同 …………………………………………………………………20 19. 孢子具有鞭状附着物 ……………………………………针囊酵母属（Nematospora） 孢子无鞭状附着物 ……………………………………… 球囊酵母属（Coccidiascus） 20．成熟时子囊容易破裂 ………………………………………………………………21 成熟时子囊不易破裂 ………………………………………………………………22 21．孢子圆形或卵形 ………………………………………………………………23 孢子帽形或土星形 …………………………………………毕赤酵母属（Pichia） 孢子肾形 …………………………………………克鲁维酵母属（Kluyveromyces） 22.强发酵葡萄糖…………………………………………克鲁维酵母属（Kluyveromyces） 发酵葡萄糖弱、慢或无…………………………………………毕赤酵母属（Pichia） 23.孢子圆形或卵形 ………………………………………………………………24 孢子大、长方形、角钝……………………………………洛德酵母属（Loddermyces） 孢子扁圆至椭圆或扁豆状，浅棕色………………………………温酵母属（Wingea） 孢子帽形，土星形，其凸起用普通光学显微镜容易看到………毕赤酵母属（Pichia） 24. 强发酵葡萄糖 ………………………………………………………………………25 发酵葡萄糖慢弱或无 ………………………………………………………………26 25．麦芽汁中容易形成醭 ………………………………………… 毕赤酵母属（Pichia） 麦芽汁中不易形成醭 ………………………………………酵母属（Saccharomyces） 26. 孢子光滑…………………………………………………………毕赤酵母属（Pichia） 孢子痣面……………………………………………………………………………27 27．形成子囊前立即接合 ………………………………德巴利酵母属（Debaryomyces） 形成子囊前不立即接合 ……………………………………… 毕赤酵母属（Pichia） 28.多边芽殖，基部宽，同时有隔膜；无节孢子，无冬孢子…… 卵孢酵母属（Oosporidium） 多边芽殖，有真菌丝和节孢子；无冬孢子 …………… 丝孢酵母属（Trichosporon） 多边芽殖，可形成真菌丝；无节孢子，可能有冬孢子 …………………………29 29．有芽细胞、假菌丝、真菌丝或二者都有，无冬孢子 …………………………31 有芽细胞，真菌丝和冬孢子；锁状联合有或无，假菌丝有或无 ………………30 30．菌落粉红色，有胡萝卜素，不发酵………………… 红冬孢酵母属（Rhodosporidium） 菌落无色素，可发酵…………………………… 白冬孢酵母属（Leucospridium） 31. 菌落粉红或黄色，不发酵………………………………………………………… 32 菌落无色素，可发酵 ………………………………………………………………34 32．同化肌醇 …………………………………………隐球酵母属（Cryptococcus） 不同化肌醇 ………………………………………………………………………33 33．不形成类淀粉化合物…………………………………………红酵母属（Rhodotorula） 形成类淀粉化合物 …………………酵母状外囊菌属（Yeast-like forms of Taphrina） 34．常有芽细胞和假菌丝，可能有真菌丝 ……………………假丝酵母属（Candida） 无假菌丝或仅有原始型假菌丝，无真菌丝 ……………………………………35 35．同化肌醇，不发酵…………………………………… 隐球酵母属（Cryptococcus） 不同化肌醇，可发醇…………………………………………球拟酵母属（Torulopsis） 附录5: 酵母菌分类系统（Kreger Van Rij, 1982年） 子囊菌酵母 内孢霉目（Endomycetales） 蚀精霉科（Spermophthoraceae） 球囊酵母属（Coccidiascus） 梅奇酵母属（Metschnikowia） 针孢酵母属（Nematospora） 酵母科（Saccharomycetaceae） 裂殖酵母亚科（Schizosaccharomycoi deae） 裂殖酵母属（Schizosaccharomyces） 拿逊酵母亚科（Nadsonioi deae） 有孢汉逊酵母属（Hanseniaspora） 拿逊酵母属（Nadsonia） 类酵母属 （Saccharomycodes） 威克酵母属（Wickerhamia） 油脂酵母亚科（Lipomycet oideae） 油脂酵母属（Lipomyces） 酵母亚科（Saccharomycetoi deae） 神食酵母属（Amobrosiozyma） 节囊酵母属（Arthroascus） 固囊酵母属（Citeromyces） 棒孢酵母属（Clavispora） 兔粪酵母属（Cyniclomyces） 德巴利酵母属（Debaryomyces） 德克酵母属（Dekkera） 小季酵母属（Guillicrmondella） 汉逊酵母属（Hansenula） 伊萨酵母属（Issatchenka） 克鲁维酵母属 （Kluyveromyces） 洛德酵母属（Loddermyces） 管囊酵母属（Pachysolen） 孢突酵母属（Pachytichospora） 毕赤酵母属（Pichia） 德克酵母属（Dekkera） 酵母属（Saccharomyces） 复膜孢酵母属（Saccharomycopsis） 许旺酵母属（Schiwanniomyces） 厚膜酵母属（Sporopachydermia） 半球厚膜酵母属（Stephanoascus） 有孢圆酵母属（Torulaspora） 拟魏克酵母属（Wickerhamiella） 温酵母属（Wingea） 接合酵母属（Zygosaccharomyces） 二、担子菌酵母 黑粉菌目（Ustilaginales） 线黑粉菌科（Filobasidiaceae） 雪球酵母属（Chionosphaera） 拟线黑粉酵母属（Filobasidiella） 线黑粉酵母属（Filobasidium） 白冬孢酵母属（Leucospridium） 形成冬孢子酵母菌（Teliospore-forming yeast） 红冬孢酵母属（Rhodosporidium） 锁掷酵母属（Sporidiobolus） 三、半知菌酵母 隐球酵母科（Cryptococcaceae） 针芽孢酵母属（Aciculoconidium） 酒香酵母属（Brettanomyces） 假丝酵母属（Candida） 隐球酵母属（Cryptococcus） 克勒克酵母属 （Kloeckera） 鳞班酵母属（Malassezia） 卵孢酵母属（Oosporidium） 发夫酵母属（Phaffia） 红酵母属 （Rhodotorula） 八叠酵母属（Sarcinosporon） 裂芽酵母属（Schizoblastosporion）梗孢酵母属（Sterigmatomyces） 合轴酵母属（Symposiomyces） 丝孢酵母属（Trichosporon） 三角酵母属（Trigonopsis） 掷孢酵母科（Sporobolomycetaceae） 布勒掷孢酵母属（Bullera） 掷孢酵母属（Sporobolomyces）