Translation
Translation in prokaryotes
? 蛋白质生物合成体系
? 氨基酸的活化与搬运
? 核糖体循环
? 多聚核糖体
Translation in eukaryotes
Posttranslational processing
蛋白质生物合成体系
? 1,mRNA
? 2、核糖体
? 3,tRNA
? 4、起始因子、延长因子和终止因子
? 5、氨基酰 -tRNA 合成酶
mRNA:模板
? 遗传密码 (genetic codon),三联体密码 ( triplet
code)
? 遗传密码的破译:遗传密码表
? 遗传密码的特点:
* 连续性 (commaless)
* 有起始密码 (AUG)和终止密码 (UAA,UAG,UGA)
* 简并性 (degeneracy)
* 摆动性 (wobble)
* 通用性 (universal)
mRNA(messenger RNA)是翻译的直
接模板
实验 1:系统中加入 RNase,蛋白质合成 立刻 终止;
实验 2:系统中加入 DNase,蛋白质合成在 30分钟后 终止。
说明,蛋白质 合成是以 RNA为模板;而 RNA合成又是以 DNA
为模板的。
DNA
RNA前体
成熟 mRNA
mRNA
蛋白质
转录
加工
运输
翻译
细胞核
细胞质
三联体密码 ( triplet code)
mRNA 5′ AUCGACCUGAGC 3′
4 20 (× )
42=16 20 (× )
43=64 20 (√)
mRNA 5′ AUCGACCUGAGC 3′
mRNA 5′ AUCGACCUGAGC 3′
mRNA 5‘ UUUUUUUUUUUU 3‘
多肽 N Phe-Phe-Phe-Phe C
密码子与反密码子配对的 摆动
现象
tRNA反密码子碱基 I U C
mRNA密码子碱基 A,C,U A,G C,G,U
m R N A 5' A U U A U C A U A 3'
U A I
I l e
5'
U A I
I l e
5'
U A I
I l e
5'
t R N A
3' 3' 3'
5'
3'
t R N A
核糖体( ribosome):场所
? 1、有容纳 mRNA的通道
? 2、能结合起始、延长及终止因子等。
? 3、有 A位( acceptor site)和 P位 (donor site).
? 4、有转肽酶活性,催化肽键形成
? 5、大亚基上有延长因子依赖的 GTP酶活
性,可为转肽提供能量。
tRNA:接合器
? 一种 tRNA只能与一种氨基酸结合,一种
氨基酸可与几种 tRNA结合。
? 结合位点为,3`端 CCA-OH。
? Ala-tRNAala;
met-tRNAemet;携带延长中的肽链上的蛋氨酸
? fmet-tRNAfmet,起始 tRNA(原核生物)
? Met-tRNAimet
t R N A
3'
5'
A位P位
大亚基
小亚基
m R N A
接头假说:
起始因子( initiation factor)
? 参与蛋白质起始复合物的形成。
IF-1:促进 IF-2和 IF-3的活化。
IF-2:促进 fmet-tRNAfmet与 30S小亚基结合
的作用,并有依赖核糖体的 GTP酶活。
IF-3:使 30S亚基释放,辅助 mRNA与小亚
基结合,并阻止大小亚基重新聚合。
延长因子 (elongation factor)
? EF-Tu:与氨酰 -tRNA及 GTP结合形成 EF-
Tu.GTP.AA-tRNA,将氨酰 tRNA转入 A位。
? EF-Ts:在 GTP供能时,使 EF-Tu.GDP转
变为 EF-Tu.GTP.
? EF-G:依赖于核糖体的 GTPase,使 GTP
水解,并有移位酶作用。
终止因子 (termination factor
? 又称为释放因子 (release factor,RF)
? 功能是识别 mRNA上的终止密码子,终止
肽链的合成并释放出肽链。
? RF-1:识别密码子 UAA及 UAG
? RF-2:UAA及 UGA
? RF-3:结合 GTP,并促进 RF-1及 RF-2与核糖
体的结合。
氨基酰 -tRNA合成酶
? 既能识别特定的氨基酸,又能识别转运该
氨基酸的 tRNA。
? 氨基酸 +ATP+tRNA 氨基酰 -tRNA +AMP
+PPi
? 氨基酰 -tRNA合成酶可发挥较对功能,使误
载的氨基酰 -tRNA从 tRNA上释下,保证遗
传信息翻译的准确性。
核糖体循环( ribosome
cycle)
? 起始( initiation)
? 延长 (elongation)
? 终止( termination)
起始( initiation)
? 1、核糖体大小亚基的解离,IF-3,IF-1
? 2,mRNA与小亚基结合。 AUG上游 8~13
个碱基处存在 SD序列( Shine-Dalgarno
sequence),能与小亚基中 16SrRNA3`端序
列互补。
? 3,fmet-tRNA的结合,IF-2,GTP,IF-1
? 4、大亚基结合,IF-2有 GTP酶活,各 IF
释放。
延长 (elongation)
? 进位 (注册):
先形成 EF-Tu.GTP.AA-tRNA复合物
? 转肽
肽酰转移酶,不需 GTP,位于大亚基,中
心含 23SrRNA。
? 移位
EF-G,GTP供能。
终止( termination)
? RF
? 核糖体转肽酶变为水解酶活性 。
多聚核糖体( polyribosome)
? 在一条 mRNA链上常结合有多个核糖体,
呈串珠状排列,同时进行多肽链的合成。
? 每个独立的核糖体都能合成一条完整的
多肽链,因此从同一模板上同时能合成
多条多肽链。可提高 mRNA的利用率和
蛋白质生物合成的速度。
真核生物蛋白质合成的特点
? 起始阶段
( 1)在核内合成 mRNA前体,加工并与多种蛋
白质结合成核蛋白颗粒,转入胞浆。起始时其
二级结构需要松解,并放出多余的蛋白质。
( 2) Met-tRNAiMet
( 3) 起始复合物,40S-mRNA-Met-tRNAiMet
( 4)没有 SD序列。帽子结合蛋白结合 mRNA上
的帽子结构。
( 5)至少 9 种起始因子。
eIF-2,GTP结合蛋白,与 GTP结合后携带起始
Met-tRNAiMet进入 40S小亚基。
eIF-4A,ATPase,
eIF-4B:解链酶,松解 mRNA二级结构
eIF-4E:帽结合蛋白( cap-binding protein,CBP)
eIF-4F:通过 eIF-4E与 mRNA的 5`帽结构结合,eIF-
3参与寻找 AUG。
延长、终止阶段
? 延长:仅延长因子不同
eEF-1α相当于 EF-Tu
eEF-1β 相当于 EF-Ts
eEF-2相当于 EF-G。
终止:仅一种释放因子,可识别 3 种密码
子( UAA,UAG,UGA),并需 GTP。
肽链的翻译后加工
? 新生肽链的折叠
? 肽链中氨基酸的共价修饰
糖苷共价修饰( covalent modification)
脂质共价修饰
其它共价修饰
? 新生肽链的水解修饰
? 亚单位聚合
新生肽链的折叠
? 折叠酶 (foldase)或分子伴侣 (molecular
chaperone)
分子伴侣,是一个结构上互不相同的蛋白质
家族,可识别肽链的非天然构象,促进蛋白
质正确折叠。如热休克蛋白( heat shock
protein,HSP)70与 60。
肽链中氨基酸的共价修饰
糖苷共价修饰( covalent modification):多
肽链的糖苷化与肽链的合成同时进行。
脂质共价修饰,脂肪酸与多肽链中的丝、
苏氨酸的羟基以酯键结合,影响蛋白质
的生物功能。
其它共价修饰,羟基化、磷酸化、甲基化、
乙酰化等。
新生肽链的水解修饰
蛋白质生物合成的抑制
? 利福霉素及其衍生物利福平:与原核细
胞 RNA聚合酶的亚基结合抑制转录。抗
菌药。
白喉毒素( diphtheria toxin)
? 对真核生物剧毒,实质是一种修饰酶,
对真核生物的 EF-2起共价修饰作用,使
其失活。
? 由于肿瘤细胞对白喉毒素比正常细胞更
敏感,故用它与抗肿瘤细胞的特异抗原
结合以消灭肿瘤细胞。
干扰素( interferon)
? 由真核生物细胞感染病毒后分泌的具有
抗病毒作用的蛋白质。可抑制病毒繁殖,
保护宿主。
? 干扰素在双链 RNA(某些 RNA病毒)存
在时,作用于蛋白质合成的启动阶段,
使蛋白质合成受抑制。
? 干扰素还可诱导生成一种寡核苷酸,活
化 RNaseL,由 RNaseL降解病毒 RNA。
作业
? 核酶
? 反义 RNA
? HIV病毒基因组的结构与功能
? 端粒与端粒酶
? RFLP
? 人类基因组多样性计划
? 常用抗生素的作用机制
? 谈谈你对, 分子生物学, 的认识
Translation in prokaryotes
? 蛋白质生物合成体系
? 氨基酸的活化与搬运
? 核糖体循环
? 多聚核糖体
Translation in eukaryotes
Posttranslational processing
蛋白质生物合成体系
? 1,mRNA
? 2、核糖体
? 3,tRNA
? 4、起始因子、延长因子和终止因子
? 5、氨基酰 -tRNA 合成酶
mRNA:模板
? 遗传密码 (genetic codon),三联体密码 ( triplet
code)
? 遗传密码的破译:遗传密码表
? 遗传密码的特点:
* 连续性 (commaless)
* 有起始密码 (AUG)和终止密码 (UAA,UAG,UGA)
* 简并性 (degeneracy)
* 摆动性 (wobble)
* 通用性 (universal)
mRNA(messenger RNA)是翻译的直
接模板
实验 1:系统中加入 RNase,蛋白质合成 立刻 终止;
实验 2:系统中加入 DNase,蛋白质合成在 30分钟后 终止。
说明,蛋白质 合成是以 RNA为模板;而 RNA合成又是以 DNA
为模板的。
DNA
RNA前体
成熟 mRNA
mRNA
蛋白质
转录
加工
运输
翻译
细胞核
细胞质
三联体密码 ( triplet code)
mRNA 5′ AUCGACCUGAGC 3′
4 20 (× )
42=16 20 (× )
43=64 20 (√)
mRNA 5′ AUCGACCUGAGC 3′
mRNA 5′ AUCGACCUGAGC 3′
mRNA 5‘ UUUUUUUUUUUU 3‘
多肽 N Phe-Phe-Phe-Phe C
密码子与反密码子配对的 摆动
现象
tRNA反密码子碱基 I U C
mRNA密码子碱基 A,C,U A,G C,G,U
m R N A 5' A U U A U C A U A 3'
U A I
I l e
5'
U A I
I l e
5'
U A I
I l e
5'
t R N A
3' 3' 3'
5'
3'
t R N A
核糖体( ribosome):场所
? 1、有容纳 mRNA的通道
? 2、能结合起始、延长及终止因子等。
? 3、有 A位( acceptor site)和 P位 (donor site).
? 4、有转肽酶活性,催化肽键形成
? 5、大亚基上有延长因子依赖的 GTP酶活
性,可为转肽提供能量。
tRNA:接合器
? 一种 tRNA只能与一种氨基酸结合,一种
氨基酸可与几种 tRNA结合。
? 结合位点为,3`端 CCA-OH。
? Ala-tRNAala;
met-tRNAemet;携带延长中的肽链上的蛋氨酸
? fmet-tRNAfmet,起始 tRNA(原核生物)
? Met-tRNAimet
t R N A
3'
5'
A位P位
大亚基
小亚基
m R N A
接头假说:
起始因子( initiation factor)
? 参与蛋白质起始复合物的形成。
IF-1:促进 IF-2和 IF-3的活化。
IF-2:促进 fmet-tRNAfmet与 30S小亚基结合
的作用,并有依赖核糖体的 GTP酶活。
IF-3:使 30S亚基释放,辅助 mRNA与小亚
基结合,并阻止大小亚基重新聚合。
延长因子 (elongation factor)
? EF-Tu:与氨酰 -tRNA及 GTP结合形成 EF-
Tu.GTP.AA-tRNA,将氨酰 tRNA转入 A位。
? EF-Ts:在 GTP供能时,使 EF-Tu.GDP转
变为 EF-Tu.GTP.
? EF-G:依赖于核糖体的 GTPase,使 GTP
水解,并有移位酶作用。
终止因子 (termination factor
? 又称为释放因子 (release factor,RF)
? 功能是识别 mRNA上的终止密码子,终止
肽链的合成并释放出肽链。
? RF-1:识别密码子 UAA及 UAG
? RF-2:UAA及 UGA
? RF-3:结合 GTP,并促进 RF-1及 RF-2与核糖
体的结合。
氨基酰 -tRNA合成酶
? 既能识别特定的氨基酸,又能识别转运该
氨基酸的 tRNA。
? 氨基酸 +ATP+tRNA 氨基酰 -tRNA +AMP
+PPi
? 氨基酰 -tRNA合成酶可发挥较对功能,使误
载的氨基酰 -tRNA从 tRNA上释下,保证遗
传信息翻译的准确性。
核糖体循环( ribosome
cycle)
? 起始( initiation)
? 延长 (elongation)
? 终止( termination)
起始( initiation)
? 1、核糖体大小亚基的解离,IF-3,IF-1
? 2,mRNA与小亚基结合。 AUG上游 8~13
个碱基处存在 SD序列( Shine-Dalgarno
sequence),能与小亚基中 16SrRNA3`端序
列互补。
? 3,fmet-tRNA的结合,IF-2,GTP,IF-1
? 4、大亚基结合,IF-2有 GTP酶活,各 IF
释放。
延长 (elongation)
? 进位 (注册):
先形成 EF-Tu.GTP.AA-tRNA复合物
? 转肽
肽酰转移酶,不需 GTP,位于大亚基,中
心含 23SrRNA。
? 移位
EF-G,GTP供能。
终止( termination)
? RF
? 核糖体转肽酶变为水解酶活性 。
多聚核糖体( polyribosome)
? 在一条 mRNA链上常结合有多个核糖体,
呈串珠状排列,同时进行多肽链的合成。
? 每个独立的核糖体都能合成一条完整的
多肽链,因此从同一模板上同时能合成
多条多肽链。可提高 mRNA的利用率和
蛋白质生物合成的速度。
真核生物蛋白质合成的特点
? 起始阶段
( 1)在核内合成 mRNA前体,加工并与多种蛋
白质结合成核蛋白颗粒,转入胞浆。起始时其
二级结构需要松解,并放出多余的蛋白质。
( 2) Met-tRNAiMet
( 3) 起始复合物,40S-mRNA-Met-tRNAiMet
( 4)没有 SD序列。帽子结合蛋白结合 mRNA上
的帽子结构。
( 5)至少 9 种起始因子。
eIF-2,GTP结合蛋白,与 GTP结合后携带起始
Met-tRNAiMet进入 40S小亚基。
eIF-4A,ATPase,
eIF-4B:解链酶,松解 mRNA二级结构
eIF-4E:帽结合蛋白( cap-binding protein,CBP)
eIF-4F:通过 eIF-4E与 mRNA的 5`帽结构结合,eIF-
3参与寻找 AUG。
延长、终止阶段
? 延长:仅延长因子不同
eEF-1α相当于 EF-Tu
eEF-1β 相当于 EF-Ts
eEF-2相当于 EF-G。
终止:仅一种释放因子,可识别 3 种密码
子( UAA,UAG,UGA),并需 GTP。
肽链的翻译后加工
? 新生肽链的折叠
? 肽链中氨基酸的共价修饰
糖苷共价修饰( covalent modification)
脂质共价修饰
其它共价修饰
? 新生肽链的水解修饰
? 亚单位聚合
新生肽链的折叠
? 折叠酶 (foldase)或分子伴侣 (molecular
chaperone)
分子伴侣,是一个结构上互不相同的蛋白质
家族,可识别肽链的非天然构象,促进蛋白
质正确折叠。如热休克蛋白( heat shock
protein,HSP)70与 60。
肽链中氨基酸的共价修饰
糖苷共价修饰( covalent modification):多
肽链的糖苷化与肽链的合成同时进行。
脂质共价修饰,脂肪酸与多肽链中的丝、
苏氨酸的羟基以酯键结合,影响蛋白质
的生物功能。
其它共价修饰,羟基化、磷酸化、甲基化、
乙酰化等。
新生肽链的水解修饰
蛋白质生物合成的抑制
? 利福霉素及其衍生物利福平:与原核细
胞 RNA聚合酶的亚基结合抑制转录。抗
菌药。
白喉毒素( diphtheria toxin)
? 对真核生物剧毒,实质是一种修饰酶,
对真核生物的 EF-2起共价修饰作用,使
其失活。
? 由于肿瘤细胞对白喉毒素比正常细胞更
敏感,故用它与抗肿瘤细胞的特异抗原
结合以消灭肿瘤细胞。
干扰素( interferon)
? 由真核生物细胞感染病毒后分泌的具有
抗病毒作用的蛋白质。可抑制病毒繁殖,
保护宿主。
? 干扰素在双链 RNA(某些 RNA病毒)存
在时,作用于蛋白质合成的启动阶段,
使蛋白质合成受抑制。
? 干扰素还可诱导生成一种寡核苷酸,活
化 RNaseL,由 RNaseL降解病毒 RNA。
作业
? 核酶
? 反义 RNA
? HIV病毒基因组的结构与功能
? 端粒与端粒酶
? RFLP
? 人类基因组多样性计划
? 常用抗生素的作用机制
? 谈谈你对, 分子生物学, 的认识